Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_TCF20_0003100
Sequence Length
242 nt
GC Content
0.4752
AGACAAGUGGAAGAGUGGAGAAAGAGCAUUCCUAAGAGAGGUCUUUUGGGAACCAAGGCUCAAAAGUAUGUAGCAUAUUAUCAAUCAAACCCUGGGCCCUUAGGCUAAGGGCCUAGAGAUGACAGAGGGGAAGGUCAGAAGGGAGCGUGGGCCUAAUAGUAUGAGAGCAAGGUGGGAAUAGCUUUGAACCUGGGGCUGGGGCACUUGAGUCUCAUAAAUGGAACAAAGUUUUGUGAAGAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-64.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -67.71
Frequency: 0.0089
Diversity: 43.42
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..((((((....(((((....((((((((((((.....(.(((((((((..(((..((((...((((((...))))))............(((((((((((...)))))))))))...((((..........)))).....)))).))).)))))......)))).)....))))))).)))))...))....)))....))))))..)(((....(((((((...))))))).....)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(..((((((....(((,,....((((((((((((.....{.(((((((((..((,..((((...{(((((...))))))............(((((((((((...))))))))))).,.|{{{..........)))}.....)))).))).)))))......)))).)....))))))).)))))...,)}...)))....))))))..)(((.,..(((((((...))))))).....)))
Back