Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_TCF20_0003600

Sequence Length

1963 nt

GC Content

0.4997

ACAGUGAGAGAACAACAGAAAACACUAAUGUGAUUUCAGAGGAAGGGGCGCUCAGUUAUUGAGUGCCUGCCACUGUGCAAUCUUGGGCAGCAACUUAACCUGUUUGAGCCUCAGUCUACUCAUGUCCUUUUGUGUCCAUGUCAUAGAACAUGCAGCUAGUGUUAACAGUGCCUGGUACUGCACUGAAUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGAGACGGAGUUUUGCUCUUGUCGCCCAGGCUGGAGUGCAACAGCACAAUCUCAGCUAACUGCAACCUUUGCCUCCAGGGUUCAGGCGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCCAAGUAGCUGGGAUUACAGGCGCCCGCCACCACGCCCAGCUAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACAGGGUUUCACCAUGUUGGUCAGGGUGGUCUUGAACUCCUGACCUCAGGUGAUACACCCCCCUUGGCCUCCCAAGUGCUGGGAUUACAGGCGUAAGCCACUGUGCCUGGCCUAUGCAGCUCUCUUGAGAGUCCCACAACACCUUAUGAGUGAGGUAAUUAAAAAAAAAUUUUUUUCUUUUAAAUAAAUAGAGAUGAGGGGGAGUCUCACUGUGUUGCGCAGGUUGGUCUUGAACUCCUGGCCUCAAGCAAUCCUCACACCUCGGCUUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGUGUGAGCCACCACACCCGGCCCAGUGAGAUAAUAUUAUCUCCAUUUUAUAGCUGAGGAAACCAAAGGGGGAAGUGACUUGUCCAAGGCCACGCAGUCCAAGAGUAACCCACAUCUUCCUGUUGGCUAUGAUGCCCAUACACGUUCUUUUUCCAGAUGGAACCAAAAGAGAAAGUGGCAGGCUUUCAGGGAUAAAGAGGCCCAGCUGGCCUGGUCCAAGGACUGGGGAAGUUUCCAGGUGGAGGGCAUUGGGGCAAUGUUCUGGCAGGGUCUGAAAGGGCGGGGAGGGGGCUGCAUGGUUAUAAGAGGCAGGAGCUGACAGGCGCCUGGACUCCAGUUAUCUGUCUGCAUUCUUUAUUCUUUCCCUUUUGAAUGAGGCUCUGCGACAGAUUGUCAGCAUCCCCCGGGCCCUGCAUCUGAGACGCAAGUGAGGUUAUGAAGAAGGGAAAGAAUGGAAGAAUGAUGGGGCAGGGGACUCUAAGGAAAAAGGAUUCAUCUUUCUUCAUGAAUUCUCUCAAGAAAUUAAGGGUGCCCCCAACACCAGUCUUCAGGAGGCCCUGCAUUCUCCUAUUUUUGUCCAGAAAACAUUGAUUUGUGCUGAGUGCCUCUUCCAGCUUUCCCUUUACAGCCCUGAUCCCAGGAGAAGCCAGGUACUGGUCUUUUAAAAGUCUUGAGGCCUGAGAAUUUGAAAAUGAAACUCAGAAGAACAAUGGGAAUAAUCAGAGGGCAGGGCCCCGUGGCUUGUUCAGCUCUGCCCCGGAAGAGCCUGGCAUGCAGGAGGUGUUGGGGAAUCAAGUCCCCAGGAAUAGUCCUGACCUGCUUUGGAGCCAGCCCCCACUUUGUGAGAUUGGACAGAAGCCAGGAGAAAUCACUGCCUUCCCCAAGUACAUGCUCCUGCCAAGGGGCCCAGGACCACCUGGGGCUCUGCCUGGGACCCUGAGACCCUCCUUGGGUAGCCUGAGAAAAGGCAAUGGCUAGGUGGGGUGAAAGGUCAAAAAGUAAAAGCAGGCCCCGGGAAGCUGUGUACCUCAAAUAUAUGGAAAUCUGGGUUCCAGACCACACCUGGUUCCUGACAAUCCCCACCUGCUGCCGGAAGCACUUUUCCAAUCCCAACUUUUAAGUUGGGUUGCUUCAGGAGAGGAAGCCACAUACUCCCCUAACAUCUAGGACAGAUGGGAGCCUAAUUUAGAAUCGGCAAUUUUAGCCAACAUUAGGGACAUCUAAUCCAAACUCUCCUCACCCACAGGAAACUGAGGCCCAAAGUGGGAGGAGAAUUUGGCCAGGUCAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-698.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -731.95

Frequency: 0.0000

Diversity: 629.30

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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