Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_TCF20_0004300
Sequence Length
253 nt
GC Content
0.5731
GAAGGGCUGGCAGUGGGGAUUGAGGUGGAGGAAGGGCACAUUGAGUCAGAGACCUGAAGGAGGGAAGGAGCUGGUGUCCAGCCCCUGUGCGUGAACCCACACAACAAGGCCAUGAGGGUCAUCGUGCCCAUUUCACUGGUGGUGCCUAAGGUCCACAGCUGCUAAGUGGCAAUGCAUCAGACCCAGGCUGUACGGCUCCAUCCUGCCUGCUCUCAUUGCUGCAUUCCAUGGCUCUCUGGGAAGGGCAUUUUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-82.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -87.85
Frequency: 0.0002
Diversity: 70.17
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((((((((((.(((.(((((((((((...((((((..(((.((.....(((.....)))..(((.(((((...))))).))).((.(((....))).))............)).)))..)))))).))))))).((((.(((...))))))).((((((....))))..)).)))).)))..))))).)))).)).))((((((..(((((..(..((........)).)..))))).)))).....))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.(((((((((((.(((.(((({((((((...((((((..{,,.({,{...{||,,...}}|,.{((.(((((...))))).))}{((.(((....))).),.}..{{{{....,)})),..)))))).))))))).((((.(((...))))))).(((((,..,,))),..}}.)))).)))..))))).)))).)).))((((((..(((((..{,,{{.......,)).,..))))).)))),....,)
Back