Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_TCF25_0004600

Sequence Length

1794 nt

GC Content

0.4939

GUCCACAGUGAGCUGCAUUCUCACAGCUGCUUCAUUCCUUCUUAGACUCUUGGCCGGGGGUGGUGUUCCUGAAGCUAGUUUACCCUUGAGGGAGAGUAUUUAAAGCCAGAGUGCACACGUAACCCUUAGAAUUGGGGUCUGAAUGGGAGUCCACAGAUUGUCUGUGUAUAACCUUGUCUGUGACCGUGGGUUGUAGAGAUGCUCAGAGUAGCUGGUCUCCAUCCCUCACACUGCCUUGUCCAGCAUGAGGUUUCAAAAGCCAUGCCGAGUGCAGUGCUCACGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCUGAGGCGGACAGAUCACCUGAAGUCAGGAGUUUGAGACCAGCUGGGCAACAUAGUGAAACCCCGUCUCUACUGAAAAUACAAAAAUUAGCUGGGCGUGGUGGGCAGGCAUCUGUAAUCCCAGCUACUCAGGAAGCUGAGGCGGGACAUUCGCUUGAACCCAGGAGGCAGAGGUUGCAAUGAGCUGAGAUCACACCACUGCACUCCAGCCUGGCCGACAGAGCGAGACCGUGUCUCAAAAAAAAGUUUUCAAAAGCUGUUAAAUUUUAAGAUUCUAGUUUUGUCGUGGUGGCUCACGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCAAGGCGGGCGGAUCACCUGAGUUCACGAGUUCGAGAUCAGCCUGACCAACAUGGAGAAACCCCGUCUCUACUAAAAAUACAAAAAAUUAGCCAGGCAUGGUCGUGCAUGCCUGUAAUCCCAGCUACUCAGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUCGCUUGAAACCGGAGGCAGAGGUUGCGGUGAGCUGAGAUCGUGACGUUGCACUCCAGCCUGGGCAACGAGAGCGAAACUCCAUCUCAAAAAAAAAAAAAAGAUUCUAGUUUUGCUUCUCAGAGCAAAACUAAUGUGAAGGUCAGGUUCUGAGAUAAGUUUCUUUCUCUCUUUCUUUCUUUUUUUUUUUUUUUGAGGCAGAUUCUUGCUCUGUCGCCCAGGCUGGAAUGCAGUGGUGUGAUCCUGGCUCACUGCAACCUCCGCCUCCUGGGUUCAGGCAAUUCUGCCUCAGCCUCCCGAGUAGCUGGGAUUGCAGGUGCACGCCACCACGCCCAGCUAAUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUAGUAGAGACGGGGCUUCACCAUGUCGGCCAGGCUGGUCUCGAACUCCUGACCUCAGGUGAUCCACUUGCCUUGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCGUGAGCCAUGGCGCCCGGCCCAGAUAAAUUUCAUCUGUGUCCAUUCAGUAGUUCUUAGCAGUUGGGCAGCCCCAGAUGAGGAUGGCUGGCUGCGAUGGGGAGCACAGGGUCUUUCAGCUCCUUAGAGGAGGAAGAGCAGGGGGGGUGUCUGCUUCUGGGACUUUAUGUAGGAGGUAUAUUCCACCUCUGGACUCUCCAUCGAAGUGUCCAGAAGGCUUUGUCUUUUUUUUAUUUAUUUAUUUUUAUUUUUUUAUUUUUUAGAGACAGGGUCUUGCUGGGUUGUCCAGUCUGGUUUUGAACUCGUGGCCUCAAGUGAUCCUCCCAUCUCAGUCUCCCAAAUAGCUGGGACUACCGGCACAUGCCACCGCUAAUUUAUUUUAUUUUAUUUUUUAUAGAAACAAGGUCUUACUUUGUUGCCCAGGGUGAUGUCAAACUCCUGGCUUCAAGCGAUUCUCCUCCCUCUACCUCCUAAAGUGCUAGGAUUACAGGCAUGAGCCACCACGCCCAGCCAGACACAUCCUGUUUUAUUGGACCAUGGAGAGUAUUGCUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-911.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -935.33

Frequency: 0.0000

Diversity: 209.81

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((.(((.(((((........))))))))...................((((.(((.(((((((((((.(((..........))).)))))..((((((.......)))))).......(((((.......))))).(((..((((...((((((...))))))((((((((.(((...)))...))))))))((((((((......)))..)))))..))))))).(((((((((....(((((.(.((....)).)))))))))).)))))(((((.(((((((((((.((((((((((((((..((((.(((..((((.(.(((((((((((((((((.(.((.((((((((((.(((((.(((..((.((((..(((((((.((((((((((.(((((((((.(((((....)))...(((((((((....(((.(((((((.((((...((((((((..(((.(((((((.(((.(...(((.......))))))).))))...((((.((((.((((..(((((((((.((((((.((((((........(((((((...((((....)))).)))))))..(((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((.(((.((((((((((((((((((.((.((((((.(((.((((((((((((((((((...(((((((((((..(((.(((((((((..((((((((((((((((((((.((((((((((((((((.....((((((..((((((((.(((((((((((((((((.((((((..(((((((.((((((((((((.((.(((((((...((..(((((((((((((((((((....(((((((((((....)))))))))))....(((((..(((....((((......))))....)))..))))))))))))))))))))))))..))...))))))))).)))))))))))).)))))))..)))))).))))))))))))))))).)))))).))..))))))..)))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))..)))).)))..)))))))))))...............)))))))))))))))))).))).)))))).)).)))))))))))))))))).))).)))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))..(((((.((.....(((((((((((((((....((........))...))))))....)))))))))....)))))))((((((((((..((((.((((((..(((....)))..)))))).).((((((((((..((((((...((.....)).))))))))))))).))))))..))))))))))(((((...(((((((...)))))))...)))))...................)))))).)))))).)))))))))..)))).)))).)))).......))).)))..))))))))...)))).))))))).)))....)))))))))...)).)).)))))).).))))))))......)).)))))))..)))).))..))).))))).))))))))))..)).).))))))))))))))))).).)))).)))..))))..)))))))))))))).))))))))))).))))))))))).))).))))((((.....))))....)))))((..((.....))..))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((.(((,(((((........))))}))}.,,...,,....,}...,,((((.(((.((((((.,,{(.{{,..........,,|{|||||({((((((..,,{{,,,||||{{,....(((((.......)))))..,,..((,.({.((((((...)))))).}}..)),.,||}}})))..,})})),,,,||}}}}}}.{{{.,.,,,},)))..))))))},(((((((((....(((({.(,((....}),)))))))))).)))))|((((.(((((((((((.((((((((((((((..((((.(((..((((.(.(((((((((((((((((.(.((.((((((((((.(((((.(((..((.((((..(((((((.((((((((((.(((((((((.(((((....))),..(((((((((.,..(((.(((((((.((((...((((((((..(((.(((((((.(({,(...({,.......)}}}))).))))...((((.((((.((((..(((((((((.((((((.((((({,,......{((((((...{{{{....}}}}.})))))){.(((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((.(((.((((((((((((((((((.((.((((((.(((.((((((((((((((((((...(((((((((((..(((.(((((((((..{(((((((((((((((((((.((((((((((((((((.....((((((,.((((((((.(((((((((((((((((.((((({..(((((((.((((((((((((.((.(((((((.,.((..(((((((((((((((((((,...(((((((((((....)))))))))))....(((((..(((....((((......)))),}}.,)),,)}})))))))))))))))))))))..)).,.))))))))).)))))))))))).)))))))..}))))).})))))))))))))))).)))))).)).,))))))..)))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))..)))).)))..)))))))))))...............)))))))))))))))))).))).)))))).)).)))))))))))))))))).))).)))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))).,(((({{((.....{((((((((((((((....{(........}}.,.))))))....))))))))).,.,))))))}((((((((((..((((.((((((..(((....)))..)))))).),(({(((((({..((((((...{{.....}).))))))))))))).))))))..)))))))))){((((...(((((((...)))))))...))))}...................)))))).)))))).)))))))))..)))).)))).)))).......))).)))..))))))))...)))).))))))).)))....))))))))).,.)).)).)))))).).))))))))......}}.)))))))..)))).))..))).))))).)))))))))),.)).).))))))))))))))))).).)))).)))..))))..)))))))))))))).))))))))))).))))})))))).))).))))||,{.....})},....)))))((.,{(.....)).,))