Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_TCF25_0006100

Sequence Length

574 nt

GC Content

0.6010

GGCUGUCCUCCCUUCUGGUAGGUUCUGCUCCAGACGAGCCCUUACCACGUUGACUCACUCCUGCAGCUCAGCGAUGCCUGCCGCUUUCAAGAGGAUCAGGAGAUGGCUCGAGACCUCGUAGAGAGAGCGCUGUACAGCAUGGAAUGUGCGUUCCACCCCCUGUUCAGUCUCACCAGUGGGGCCUGCCGGCUGGAUUACCGCAGACCCGAGAACAGGAGCUUCUACCUGGCCCUCUACAAGCAGAUGAGCUUCCUGGAGAAGCGAGGCUGCCCGCGCACGGCGCUGGAGUACUGCAAGCUCAUCCUGAGUCUCGAGCCGGAUGAGGACCCCCUCUGCAUGCUGCUGCUCAUCGACCACCUGGCCUUGCGGGCCCGGAACUACGAGUACCUGAUCCGCCUCUUCCAGGAGUGGGAGGCUCAUCGGAACCUGUCCCAGCUCCCUAAUUUUGCCUUCUCUGUUCCACUGGCGUAUUUCCUGCUGAGCCAGCAGACAGACCUCCCUGAGUGUGAGCAGAGCUCUGCCAGGCAGAAGGCCUCUCUCCUGAUACAGCAGGCGCUCACCAUGUUCCCUGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-204.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -216.42

Frequency: 0.0000

Diversity: 186.41

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((..((((((((...(((((((....((((.....)))).)))))))..........((((((...(((((((........)))).....)))...))))))..((((((((((.((..((.((((((((((.((((..((((((....))))))....)))).))))....(((((.((.....)).)))))......(((((((((((..((((........))))...))).....((((....(((((.....)))))....))))..((((...)))).)).)).))))..)))).))))))))))))))))))..)))))).))(((((((((((((((...((((.......(((((((((((.(.((.(((...))).)).).)))))........(((((((((((.((....)).))..))))).))))......((((((.((((((((((((((.((.....((((((...))))))....))...))..)))).)))))))).......)))))))))))).......)))).))))))........))))).....))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((..(,(((,,..{((((((((((({((((,{.,,|||,....,,,.,|{{|,|||....{{|{,|{|||||{,.((((.(((((({.((((((((((((...{((((((((({{((({((((.((({((((.((((..((((((....))))))...,||||.}}}}||}.,,,,{.((,.{{{||{|,,,,....}}}})).)}}.,|..{{||.{...,,.}}}},.,})}}}}.,{{,{{{{{|{{{,.,,,,}..||.,||{|,((.((((...)))).)),)),},)),}))))})),}))))))))))))}...((((....)))).(({...})){((((...,....((.(((((...))))).))......))))})))))))}.,,))))...))))))).)))),,...(((..{{{...}}}.}}}.......,(((...,,,{,,,,.,,||}|......,,||||})},,)))).{{|......}}},))},))))))))).})))}))).}),}))),.)){{{{,|....{|||||......}}.))),....))))