Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_TCF25_0007300
Sequence Length
1349 nt
GC Content
0.5975
GUUCUGCUCCAGACGAGCCCUUACCACGUUGACUCACUCCUGCAGCUCAGCGAUGCCUGCCGCUUUCAAGAGGAUCAGGAGAUGGCUCGAGACCUCGUAGAGAGAGCGCUGUACAGCAUGGAAUGUGCGUUCCACCCCCUGUUCAGUCUCACCAGUGGGGCCUGCCGGCUGGAUUACCGCAGACCCGAGAACAGGAGCUUCUACCUGGCCCUCUACAAGCAGAUGAGCUUCCUGGAGAAGCGAGGCUGCCCGCGCACGGCGCUGGAGUACUGCAAGCUCAUCCUGAGUCUCGAGCCGGAUGAGGACCCCCUCUGCAUGCUGCUGCUCAUCGACCACCUGGCCUUGCGGGCCCGGAACUACGAGUACCUGAUCCGCCUCUUCCAGGAGUGGGAGGCUCAUCGGAACCUGUCCCAGCUCCCUAAUUUUGCCUUCUCUGUUCCACUGGCGUAUUUCCUGCUGAGCCAGCAGACAGACCUCCCUGAGUGUGAGCAGAGCUCUGCCAGGCAGAAGGCCUCUCUCCUGAUACAGCAGGCGCUCACCAUGUUCCCUGGAGUCCUCCUGCCCCUGCUCGAGUCUUGCAGUGUGCGGCCCGACGCCAGCGUUUCCAGUCACCGCUUCUUUGGACCCAAUGCUGAAAUAAGCCAGCCCCCUGCCCUGAGCCAGCUGGUGAACCUGUACCUUGGGAGGUCACACUUUCUCUGGAAAGAGCCCGCCACCAUGAGCUGGCUGGAGGAGAACGUCCACGAGGUUCUGCAAGCAGUGGACGCCGGGGACCCAGCCGUGGAAGCCUGUGAGAACCGGCGGAAGGUGCUCUACCAGCGUGCACCCAGGAAUAUCCACCGCCAUGUGAUCCUCUCUGAGAUCAAGGAAGCCGUCGCUGCCCUGCCCCCGGACGUGACCACGCAGUCUGUGAUGGGGUUUGAUCCUCUGCCUCCUUCGGACACAAUCUACUCCUACGUCAGGCCAGAGAGGCUAAGUCCUAUCAGCCAUGGAAACACCAUUGCUCUCUUCUUCCGGUCACUGUUGCCAAACUAUACCAUGGAGGGGGAGAGGCCCGAGGAAGGAGUGGCUGGGGGUCUGAACCGCAACCAGGGCCUGAACAGGCUGAUGCUGGCUGUGCGCGACAUGAUGGCCAACUUCCACCUCAACGACCUGGAGGCGCCGCACGAGGACGACGCUGAGGGGGAGGGGGAGUGGGACUGAGCGUCCGCAGAGGUGACCGAAAAGCCGUAUGAUGAUGUUCCCGAUUUCUCUGUUGGUCGGAGUCGGCCAGUUGCCUGAAGUAGGGAAGCUGAGUGUGUCGCUCCCUGGUCCACUGUUUCUCCUAUAAAUGUAAAUGGGUCACGCUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-514.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -535.39
Frequency: 0.0000
Diversity: 297.54
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((...)))))((((....(((.((((.(((((((((.((((..((((((((.((.((..((((((((((((((.(.(..((((((((((.((..((.((((((((((.((((..((((((....))))))....)))).))))....(((((.((.....)).)))))......(((((((((((..((((........))))...))).....((((....(((((.....)))))....))))..((((...)))).)).)).))))..)))).))))))))))))))))....((((....))))(((((((((..............((.(((((...))))).))......((((((((..((((((..(((((((((..(((((((....(((..(((...))).)))....((((((((.((((((((((((((.((.....((((((...))))))....))...))..)))).)))))))).......))))))))))))))))))))).....((((((..((((..((.(((((((.((((..((((...(((.........((((.(.(((((.......((((((((((((...........)))))...)))))))......))).)).).))))(((.((((((((((((..(((...((..(((((((...)))))))..))..)).)..))))......))))))))..)))(((((.((...)).)))))))).)))).)))).)))))))..))...))))..))))))..)))..))))))))))))))...)))))))))....(((...))).....).).))))))))).)))))....)).)).))))))))..))))....))).)))).....(((.((.((.((.((((((((((((.((((((...)))........((((((.(.((.((((.((.(((......))).)).((.((((.....)))).))((((((((((((((....(((....)))...)))..))))))))))))))).)).).))))))))).))))))).))))).))..)).)).)))..(((((....((((((......((((....((((((((((((.(((((.((.(((.(..((...)).).)))....)).)))))))))((((((((.((...(((((((..((..(((.........)))...))..))))))))).))))))))))))))))..)))))))))).)))))..((((((((((..((((.(.(........).)))))))))).)))))....)).)))))))...))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({{(((...)))))((((....(((.((({.{((((((((.((((..((((((((.((.((..((((((((((((((,(.{.,((((((((({{((({((((.((({((((.((((..((((((....))))))...,||||.}}}}||}.,,,,{.((,.{{{||{|,,,,....}}}})).)}}.,|..{{||.{...,,.}}}},.,})}}}}.,{{,{{{{{|{{{,.,,,,}..||.,||{|,((.((((...)))).)),)),},)),}))))})),}))))))))))))}...((((....))))(((((((((.,,...........((.(((((...))))).))......((((((((..((((((..(({((((((..(((((((....(((..(((...))).)))....{(((((((.((((((((((((((.(,.....((((((...))))))..,,},..,)}..)))).)))))))).......)))))))}))))))))))))).....((((((..((((..((.(((((((.((((..((((...(((.........((((.(.(((((.......((((((((((((...........)))))...)))))))......))).)).}.))))(((.(((((((({(((..,{{.,.{{..{{{|{||...,||||||,.,),.)),)...,,)},},..}))))))).,}))(((((.((...)).)))))))).)))).)))).)))))))..})...))))..)))))),.))}..))))))))))))))...)))))))))....(({...)))....,).}.))))))))).)))))....)).)).))))))))..))))....))).)))},{{{{({,,||}}|.||}((((((((((((.((({({...}}}........((((((.(.((.((((.((.(((......))).)),((.((((.....)))).))|(((((((((((((....(((....)))...)))..))))))))))})))).)).).))))))))).))))))).))))),||.{{{{({{{{,..,||||}...{|||{({{,{{.{({(....((((({{(((((.(((((.((.(((.(.,{{...)).).))).}}.}}.)))))})))|(((((((,((,..(((((((..((..(((.........)))...))..)))))))||.||}}}}}}}}}))))),.)))))))}}},}|||}..{{{||{{|||,.{{{{,|,|},,,,,,}),))))))))}}.}}}}}....)}.}))))))...))))
Back