Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_TCF25_0007700

Sequence Length

508 nt

GC Content

0.6024

CUCAGCGAUGCCUGCCGCUUUCAAGAGGAUCAGGAGAUGGCUCGAGACCUCGUAGAGAGAGCGCUGUACAGCAUGGAAUGUGCGUUCCACCCCCUGUUCAGUCUCACCAGUGGGGCCUGCCGGCUGGAUUACCGCAGACCCGAGAACAGGAGCUUCUACCUGGCCCUCUACAAGCAGAUGAGCUUCCUGGAGAAGCGAGGCUGCCCGCGCACGGCGCUGGAGUACUGCAAGCUCAUCCUGAGUCUCGAGCCGGAUGAGGACCCCCUCUGCAUGCUGCUGCUCAUCGACCACCUGGCCUUGCGGGCCCGGAACUACGAGUACCUGAUCCGCCUCUUCCAGGAGUGGGAGGCUCAUCGGAACCUGUCCCAGCUCCCUAAUUUUGCCUUCUCUGUUCCACUGGCGUAUUUCCUGCUGAGCCAGCAGACAGACCUCCCUGAGUGUGAGCAGAGCUCUGCCAGGCAGAAGGCCUCUCUCCUGAUACAGCAGGCGCUCACCAUGUUCCCUGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-183.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -192.92

Frequency: 0.0000

Diversity: 142.60

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(...(.(((((((((.......((((((((((((....((((((((((.((..((.((((((((((.((((..((((((....))))))....)))).))))....(((((.((.....)).)))))......(((((((((((..((((........))))...))).....((((....(((((.....)))))....))))..((((...)))).)).)).))))..)))).))))))))))))))))....((((....)))).(((...)))(((((........((.(((((...))))).))......)))))))))))))...)))).((((((..(((((((....(((..(((...))).)))....((((((((.((((((((((((((.((.....((((((...))))))....))...))..)))).)))))))).......))))))))))))))))))))).....))))))).)).)...)(((....)))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(...(.(((((((((.,.....,{{{((((((((,..{((((((((({{((({((((.((({((((.((((..((((((....))))))...,||||.}}}}||}.,,,,{.((,.{{{||{|,,,,....}}}})).)}}.,|..{{||.{...,,.}}}},.,})}}}}.,{{,{{{{{|{{{,.,,,,}..||.,||{|,((.((((...)))).)),)),},)),}))))})),}))))))))))))}...((((....)))).(({...}}}{((((.,......((.(((((...))))).))......)))),)))))))).,,},,,.((((({.{(((((((....(({..{{{...))).)))....,{((((((.((((((((((((((.{,.....((((((...))))))..,}},..,}}..)))).)))))))).......)))))))}))))))))))))),..,.))))))).)).)...)(((....)))