Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_TCF25_0008500

Sequence Length

293 nt

GC Content

0.6212

AGAGAGCGCUGUACAGCAUGGAAUGUGCGUUCCACCCCCUGUUCAGUCUCACCAGUGGGGCCUGCCGGCUGGAUUACCGCAGACCCGAGAACAGGAGCUUCUACCUGGCCCUCUACAAGCAGAUGAGCUUCCUGGAGAAGCGAGGCUGCCCGCGCACGGCGCUGGAGUACUGCAAGCUCAUCCUGAGUCUCGAGCCGGAUGAGGACCCCCUCUGCAUGCUGCUGCUCAUCGACCACCUGGCCUUGCGGGCCCGGAACUACGAGUACCUGAUCCGCCUCUUCCAGGAGUGGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-102.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -106.09

Frequency: 0.0021

Diversity: 70.33

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((((((.((((..((((((....))))))....)))).)))).....(((.(((((((.((((((.((.....(((((((((((..((((........))))...))).....((((....(((((.....)))))....))))..((((...)))).)).)).))))..(((((...))))).)).))))))...))).))))..)))......))).))).)(..((((((((....(((((.(.((.(((...))).)).).))))).....)))))..)))..)

Thermodynamic Ensemble Prediction

({,((((((((.((((..((((((....))))))....)))).)))}.....{((.(((((((.((((((.({.....(((((({((((..((((,{,..,,.}}}),..}}}.....(({{....(((({.....)))))..,.)))),,((((...)))).)).)).))))..(((({...))))).)).))))))...))).})))},))),..,..))}}))).)(..((((((((....(((((.(.((.(((...))).)).).))))).....)))))..)))..)