Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_TCF25_0009200
Sequence Length
944 nt
GC Content
0.5975
AGAGAGCGCUGUACAGCAUGGAAUGUGCGUUCCACCCCCUGUUCAGUCUCACCAGUGGGGCCUGCCGGCUGGAUUACCGCAGACCCGAGAACAGGAGCUUCUACCUGGCCCUCUACAAGCAGAUGAGCUUCCUGGAGAAGCGAGGCUGCCCGCGCACGGCGCUGGAGUACUGCAAGCUCAUCCUGAGUCUCGAGCCGGAUGAGGACCCCCUCUGCAUGCUGCUGCUCAUCGACCACCUGGCCUUGCGGGCCCGGAACUACGAGUACCUGAUCCGCCUCUUCCAGGAGUGGGAGGCUCAUCGGAACCUGUCCCAGCUCCCUAAUUUUGCCUUCUCUGUUCCACUGGCGUAUUUCCUGCUGAGCCAGCAGACAGACCUCCCUGAGUGUGAGCAGAGCUCUGCCAGGCAGAAGGCCUCUCUCCUGAUACAGCAGGCGCUCACCAUGUUCCCUGGAGUCCUCCUGCCCCUGCUCGAGUCUUGCAGUGUGCGGCCCGACGCCAGCGUUUCCAGUCACCGCUUCUUUGGACCCAAUGCUGAAAUAAGCCAGCCCCCUGCCCUGAGCCAGCUGGUGAACCUGUACCUUGGGAGGUCACACUUUCUCUGGAAAGAGCCCGCCACCAUGAGCUGGCUGGAGGAGAACGUCCACGAGGUUCUGCAAGCAGUGGACGCCGGGGACCCAGCCGUGGAAGCCUGUGAGAACCGGCGGAAGGUGCUCUACCAGCGUGCACCCAGGAAUAUCCACCGCCAUGUGAUCCUCUCUGAGAUCAAGGAAGCCGUCGCUGCCCUGCCCCCGGACGUGACCACGCAGUCUGUGAUGGGGUUUGAUCCUCUGCCUCCUUCGGACACAAUCUACUCCUACGUCAGGCCAGAGAGGCUAAGUCCUAUCAGCCAUGGAAACACCAUUGCUCUCUUCUUCCGGUCACUGUUGCCAAACUAUACCAUGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-341.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -356.16
Frequency: 0.0000
Diversity: 203.81
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((.((((..((((((....))))))....)))).)))).......(((((((((((.((........))))))....(((..((((........))))...)))....(((.((((.((((((((((..(((...(((((((((((...)))).)).)))..))..)))..)))(((.(((((((..((((((((....))))(((((((((..............((.(((((...))))).))......((((((((..((((((..(((((((((..(((((((....(((..(((...))).)))....((((((((.((((((((((((((.((.....((((((...))))))....))...))..)))).)))))))).......))))))))))))))))))))).....((((((..((((..((.(((((((.((((..((((...(((.........((((.(.(((((.......((((((((((((...........)))))...)))))))......))).)).).))))(((.((((((((((((..(((...((..(((((((...)))))))..))..)).)..))))......))))))))..)))(((((.((...)).)))))))).)))).)))).)))))))..))...))))..))))))..)))..))))))))))))))...)))))))))....(((...)))..(((...))))))).))).))))))))))))))))))))))))))))...((((((((....))).)))))((((((((((((.((((((((((.....(((..........)))......))).))))).)).))))))))))))...((((.....)))).))))))).((((.(((....(((....)))...)))..))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((((.((((..((((((....))))))....)))}.)))}....,,,((,(({,{{{||{|,,,,....}}}})).,,,{{{..((((,{,,.||.}|}},..}}}....(((.((((.(((((({{((..(((..{({{{({{((((..,}})}.}|,}}}.,}}..}||..|||{{,{(((((((..((((((((....))))(((((((((.,,...........((.(((((...))))).))......((((((((..((((((..(({((((((..(((((((....(((..(((...))).)))....{(((((((.((((((((((((((.(,.....((((((...))))))..,,},..,)}..)))).)))))))).......)))))))}))))))))))))).....((((((..((((..((.(((((((.((((..((((...(((.........((((.(.(((((.......((((((((((((...........)))))...)))))))......))).)).}.))))(((.(((((((({(((..,{{.,.{{..{{{|{||...,||||||,.,),.)),)...,,)},},..}))))))).,}))(((((.((...)).)))))))).)))).)))).)))))))..})...))))..)))))),.))}..))))))))))))))...)))))))))....(({...}))..{{{...))))))).))).)))))),))))))))))))))}}}}}}}...((((((((....))).))))){(({((({{{{{.{{((((((((.....(({..........)))...,..)))}})))).)),)}}}}}}}}))),,.((((.....)))).))))))}}((((.(((....(((....)))...)))..))))
Back