Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_TCF25_0010600
Sequence Length
578 nt
GC Content
0.6003
GCUCAUCGGAACCUGUCCCAGCUCCCUAAUUUUGCCUUCUCUGUUCCACUGGCGUAUUUCCUGCUGAGCCAGCAGACAGACCUCCCUGAGUGUGAGCAGAGCUCUGCCAGGCAGAAGGCCUCUCUCCUGAUACAGCAGGCGCUCACCAUGUUCCCUGGAGUCCUCCUGCCCCUGCUCGAGUCUUGCAGUGUGCGGCCCGACGCCAGCGUUUCCAGUCACCGCUUCUUUGGACCCAAUGCUGAAAUAAGCCAGCCCCCUGCCCUGAGCCAGCUGGUGAACCUGUACCUUGGGAGGUCACACUUUCUCUGGAAAGAGCCCGCCACCAUGAGCUGGCUGGAGGAGAACGUCCACGAGGUUCUGCAAGCAGUGGACGCCGGGGACCCAGCCGUGGAAGCCUGUGAGAACCGGCGGAAGGUGCUCUACCAGCGUGCACCCAGGAAUAUCCACCGCCAUGUGAUCCUCUCUGAGAUCAAGGAAGCCGUCGCUGCCCUGCCCCCGGACGUGACCACGCAGUCUGUGAUGGGGUUUGAUCCUCUGCCUCCUUCGGACACAAUCUACUCCUACGUCAGGCCAGAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-196.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -207.80
Frequency: 0.0000
Diversity: 124.32
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((....(((..(((...))).)))....((((((((.((((((((((((((.((.....((((((...))))))....))...))..)))).)))))))).......)))))))))))((((((((((((...((((((..((((..((.(((((((.((((..((((...(((.........((((.(.(((((.......((((((((((((...........)))))...)))))))......))).)).).))))(((.((((((((((((..(((...((..(((((((...)))))))..))..)).)..))))......))))))))..)))(((((.((...)).)))))))).)))).)))).)))))))..))...))))..)))))).......(((((..(((((...........)))))..(((...))).)))))...((((((.....).)))))(((.(((....)))..)))(((((((((((((....))).)))))....))))).........((((......)).))..............))))))..))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((....(((..(((...))).)))....{(((((((.((((((((((((((.(,.....((((((...))))))..,,},..,)}..)))).)))))))).......)))))))})))((((((((((((...((((((..((((..((.(((((((.((((..((((...(((.........((((.(.(((((.......((((((((((((...........)))))...)))))))......))).)).}.))))(((.(((((((({(((..,{{.,.{{..{{{|{||...,||||||..,),,)),)...,})},},..}))))))).,}))(((((.((...)).)))))))).)))).)))).)))))))..})...))))..)))))),......(((((..(((((.{.......}.)))))..(((...))).)))))...{(((({,,...},))))|(((,{((.,.,|}}.||||{{{{{((((((((....))).)))))....))))).,}}}..,,,}},}},,..|||,.........,}}...))))))..))))))
Back