Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_TGM4_0000200
Sequence Length
508 nt
GC Content
0.5413
AGCUGCAAGUUCUCCACAUUGACUUCUUGAAUCAGGACAACGCCGUUUCUCACCACACAUGGGAGUUCCAAACGAGCAGUCCUGUGUUCCGGCGAGGACAGGUGUUUCACCUGCGGCUGGUGCUGAACCAGCCCCUACAAUCCUACCACCAACUGAAACUGGAAUUCAGCACAGGGCCGAAUCCUAGCAUCGCCAAACACACCCUGGUGGUGCUCGACCCGAGGACGCCCUCAGACCACUACAACUGGCAGGCAACCCUUCAAAAUGAGUCUGGCAAAGAGAGGACAUGGUUUUCAUGCCUGAUGAGGACGAGCGCAAAGAGUACAUCCUCAAUGACACGGGCUGCCAUUACGUGGGGGCUGCCAGAAGUAUCAAAUGCAAACCCUGGAACUUUGGUCAGUUUGAGAAAAAUGUCCUGGACUGCUGCAUUUCCCUGCUGACUGAGAGCUCCCUCAAGCCCACAGAUAGGAGGGACCCCGUGCUGGUGUGCAGGGCCAUGUGUGCUAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-164.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -173.41
Frequency: 0.0000
Diversity: 160.60
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..((..(((.(((..(((.(.....).)))..))).)))...))..))((.(((((((((............((((((((((((((..((((((((((((((...))))))(((((.((((((((((((...........................))))..))))))))..)))))..))).....))))).))))))...(((((((.((......((((....)))))))))))))....((.(((((...............))))).)).....(((((((..((((((.((.((.((((((.(.((.......)).).))))))........((((.((((...)))).))))((((((.((.(((...........))).)))))))))))).))))))..))))))))))))))).....(((((.(((.(((.(.(((......))).).))).))).)))))(((.((((....)))).))))))))))))...))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((..((..(((.(((..(((.{.....,.}}}..))).)))...))..))((.(((((((((,.{{{,.....}|||{(((({((({{{{((,{{{(,((((((...))))))(((((.(((((((|((((.,.....................,...))))..})))))))..)))))..,,|.{(((((((((.........)))))))))).}..,,((((....)))),|,,,..{,,..{(({((({(..{{{..,..,,{|{|||||,|,.....((({(((,.{{{|||}||||,.((((((.{.((.......)).}.))))))......}}}}||.{|||,..},))})}))|||||..||,{,,..,|,....,,})},}}}}}}}}||}},}))}}}..,}})))}))}})}}),,,,.(((((.(((.(((.(.(((......))).).))).))).))))),{{,||||.,,.})))}))))))))))))...))
Back