Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_TGM4_0000600

Sequence Length

422 nt

GC Content

0.5521

UUUGAGAAAAAUGUCCUGGACUGCUGCAUUUCCCUGCUGACUGAGAGCUCCCUCAAGCCCACAGAUAGGAGGGACCCCGUGCUGGUGUGCAGGGCCAUGUGUGCUAUGAUGAGCUUUGAGAAAGGCCAGGGCGUGCUCAUUGGGAAUUGGACUGGGGACUACGAAGGUGGCACAGCCCCAUACAAGUGGACAGGCAGUGCCCCGAUCCUGCAGCAGUACUACAACACGAAGCAGGCUGUGUGCUUUGGCCAGUGCUGGGUGUUUGCUGGGAUCCUGACUACAGUGCUGAGAGCGUUGGGCAUCCCAGCACGCAGUGUGACAGGCUUCGAUUCAGCUCACGACACAGAAAGGAACCUCACGGUGGACACCUAUGUGAAUGAGAAUGGCGAGAAAAUCACCAGUAUGACCCACGACUCUGUCUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-138.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -145.73

Frequency: 0.0000

Diversity: 129.24

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

....(((.....(((.((((((((((((...(((((((..((.(((((((..((((((.((((........((.(((.((((....)))).))))).)))).))).))).))))))).))...)).)))))((((.((.((((........)))).)).))))..((.(((((.(((((((....))))...))).))))))).....))))))))).........(((((((.......)))))))..((.((((((((((((((((((.((((..((...((((((.((((.....)).)).))))))...((((....((((.......))))....))))))..)))).))...))))))))))))).)))..))....(((.((.....)).))).......))).)))....))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

....(({.....(({.((((((((((((...(((((((..((.(((((((..((((((.{(({..,.,...{{.(((.((((....)))).))))).}})).))).))).))))))).))...))}})))),((,{((|{{||......||,)}}||}|||||..((.(((((.(((((((....))))...))).)))))))..}}.))))))))).,,,..,,,({{((((.{,....}}}}}))|||,,|||((((((({((((((({(((({{(,...,{(((,.,|||}}}}}),}))})))))}.,,{(((,...(({(.,.....}}}}....}}}},}..}}}}.}}}|,})}))}}}})))},}}|..,.,...{((.((.....)).)))...,...))).)))....))).