Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_TGM4_0001100

Sequence Length

416 nt

GC Content

0.4784

GCUCCUCUGAGGAGAGGCAGGUCAUGGAUCAUGCCUUCCUCCUUCUCAGUUCUGAGAGGGAGCACAGACGACCUGUAAAAGAGAACUUUCUUCACAUGUCGGUACAAUCAGAUGAUGUGCUGCUGGGAAACUCUGUUAAUUUCACCGUGAUUCUUAAAAGGAAGACCGCUGCCCUACAGAAUGUCAACAUCUUGGGCUCCUUUGAACUACAGUUGUACACUGGCAAGAAGAUGGCAAAACUGUGUGACCUCAAUAAGACCUCGCAGAUCCAAGGUCAAGUUGCCUAACACAGGCAGAAUUGGCCAGCUACUUGUCUGCAAUUGUAUCUUCAAGAAUACCCUGGCCAUCCCUUUGACUGACGUCAAGUUCUCUUUGGAAAGCCUGGGCAUCUCCUCACUACAGACCUCUGACCAUGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-122.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -129.57

Frequency: 0.0000

Diversity: 106.79

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((((....))))).)).((((((...((((((..((((((((((....)))))))))).((((.....)))).(((((((((((.......((((((((.(((..((..((((.(((...(((...................(((..((((......)))).))).((((...(((.((....))))).))))...((((((.((((((((((....((((((.((.((((....((((((.....((((..(((((.(......).)))))..))))....)))))).........)))).)).))))))))))))))))..))))))....))).))))))).))))))))))))).)))))))))))((....)).))))))..........(((....))).))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

,(({,,,({{{{|||||{||{(({{{|,|},|||||..((((((((((....)))))))))).{(((.....}}}|.{((((({{{{{,,,,..,|{{|((((,(({,{.,..||||,|||,..(((,{,..........,,}.,,{{{.{((({...,}})},,.}}}.((((...(({,((....))))).))))..,{(((((.((((((((((....((((((.((.((((....((((((,....((((..(((((.{......}.)))))..))))....}))))).,,,..,,.)))).)).))))))))))))))))..))))))....|||.|||}}||,,||||||}}}})),)))}}}}}}},||}..})).))),,}}}}}}}}....}}.}{,,,,.,,,,))