Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_TGM4_0001200
Sequence Length
492 nt
GC Content
0.5000
AUUUCAGCAUUUCCUACCUUGUGCUUAGCUUUCAGAUUAUGGAUGAUUAAAUUUGAUGACUUAUAUGAGGGCAGAUUCAAGAGCCAGCAGGUCAAAAAGGCCAACACAACCAUAAGCAGCCAGACCCACAAGGCCAGGUCCUGUGCUAUCACAGGGUCACCUCUUUUACAGUUAGAAACACCAGCCGAGGCCACAGAAUCCCAUCCCUUUCCUGAGUCAUGGCCUCAAAAAUCAGGGCCACCAUUGUCUCAAUUCAAAUCCAUAGAUUUCGAAGCCACAGAGUCUCUCCCUGGAGCAGCAGACUAUGGGCAGCCCAGUGCUGCCACCUGCUGACGACCCUUGAGAAGCUGCCAUAUCUUCAGGCCAUGGGUUCACCAGCCCUGAAGGCACCUGUCAACUGGAGUGCUCUCUCAGCACUGGGAUGGGCCUGAUAGAAGUGCAUUCUCCUCCUAUUGCCUCCAUUCUCCUCUCUCUAUCCCUGAAAUCCAGGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-132.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -142.07
Frequency: 0.0000
Diversity: 97.32
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((......))(((((...(((((....(((((.(((((((((((...........((((((((...(((((..(((((....(((.((.(((......((((.............................))))((((((((((....))))))...)))).(((((....)))))..))).))...)))....)))))....)))))...))))))))(((((.........)))))....(((........))))))))).))))).))))))))))(((.((((...((.(((((((......((((((.....))))))..)))))).)..))...)))).)))......((((((((.(.(((.....)))).))))))))..((........))((((((.....))))))((((((((......((((..(((............))).....))))......))))))))........)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((......})(((((...{{(((....(((((.(((((((((((........,,,((((((((...(((((..(((((....(((.((.((({.....||||................||,..........)))}{(((((((((....)))))),..,}}}.,,,,.....,}}},..,,,.))...)))....)))))....)))))...)))))))|(((({.........))))),....,{...,},,,,,,))))))}))))).)))))}}}}|{((.(({{...((.(((((((......((((((.....))))))..)))))).}..}}...)))).})}{{,....{((((((.,.(((.....)))}.))))))))},{{........))((((((.....))))))((((((((...{{.(((({.(((............))),,...})))......})))))))........)))))
Back