Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_TPCN1_0000800
Sequence Length
513 nt
GC Content
0.5185
GAAACUGGAGGGUUUGGGUUUUUCUCCUUAUAUGGGCAAUUGUGGAUUUAAUCCAAGACUCAGACAUCUUUGGGCUCUAAGUGCGGCUGCUGCAGUGCUAAUGAAUGACUCACAGGCAGCAUGGUGUCAGGUUGAUAAAGGAGGCAGGUAUGAGCAGAGGUAUUUAAAGCCUGGAAACUAGGAAUAACCUUGAAAACAGUCAGCGGGGCCACUGUUAGAGCAGUGUAGAGACAGACCACAGUCCACACCGCGUGACAGGCGGUGGUCUCACCCACCACAUUCAGGGAAUCAGGACGAGUCUGAAUGUAGUGGGCAGUCCAAGGAAUUUCCCAGGGUAACUCUGGUCACACUCAGCUCUGCCUUCUCCCUGCCUUUAAAGCCAGCUGCUGCCUAAGAUGGGCUGGACCAUGUGCCUUUUCUGAGUGAAGGAAGGAUUGGGCUCGCGGGGGCUGGCUGAGGUCUGAGCAGGAUGCUCCGUCUCUGCUUUGGUGCCGGGUUGUUUAUGGUUUUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-177.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -185.80
Frequency: 0.0000
Diversity: 147.25
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((((((((((((((((...(((......)))......(((((...))))))))))))))).)))))))(((.(((((((..(((((.((.((((......((.(((.....((((.((....)).))))......))).)))))))))))))..))))))).)))((((((((((.((((((((((((......))))(((.((((((((((..((.((((.(.(((........)))))))).)).))))))(.(((((......))))).)...((((((...(((..(((.((((..((.((((.((((((..(((...)))..))).....))).)))))))))))))..)))..))))))((((...((((((((.((((.......(((((.((((.....(((((.......)))))..)).)).))))))))).))))))))))))...((((((((((...)))).)))))))))).))))))))))).))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{...(((((((((((((((((,..,((......))}......{((((...))))))))))))))).))))))),((.(((((((..(((((.{,,((((..,...((.(((...,,(({(.{{.,,,)}.}}))......}}),)}}})})})))))..))))))).)))((((((((((.{(((((((((({......})}{((({(,,,,,({{({{(({((((.({(((.(((....))).,{{{{{{.,....,))))))))))}.(((((.(((((((((...,,.....}|.})))))))).)))))..,{{,..{|,....,|{{{||...)))))},,))))),.)))))))},..,)))))|{{,...((((((((.((((.....,,(({{{.{,||,,...((((({{,....,,))),,)).}},)))}))))).))))))))}}|||,.((((((((((...)))).)))))),)},}))))))))))).))))))))))
Back