Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_TPCN1_0001300
Sequence Length
310 nt
GC Content
0.5742
CUUUUGAGGAGGACCAGACGUUGUCUCCCCACCAGGAACGGGCUGAGAGAGCCUCCUGAGCACAAGGAGGAAGCUCCUGUCAAUUCGAGGAGACCCCUGUGUGAGAAGAAGGGCAGGAAGGCUCCAAAGGGGGUCUUCACGGCAGCCGCUCACAUAGACACUCGUGUCUAGUGUCAAGUGGGAGGGUGGCACUAAUGGCUGCUGCCAUCUGUGCCAGCUAGCAGCUGCCUGCUCCGCUCCAUCAUUGUUAUUUAUGUUACCUAGGACUCUUCUGUGUUGCCGGUGCCAGCCCCUGCUGGGGCAUGUGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-119.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -126.11
Frequency: 0.0000
Diversity: 48.99
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(...((.((.((((........)))).)))).(((((...((((.....))))))))).(((((.((.((...(((((.........))))).)))))))))........(((((.(((((((((....)))))))))..((((((.((((((...((((((.......))))))..)))...((.((((((..(((((....)))))..)))))).))))).))))))))))).)(((((.(((.........((.((((...(((........)))...)))).))(((((....)))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(...{(.(((((((........)))))),)}.(((({..,((((.....))))))))).{((({{((.((...(((((,........))))).)))))})))........(((((,(((((((((....)))))))))..((((((.((((((.(,((((({.....},)))))}..))),..((.((((((..(((((....)))))..)))))).)),}).)))))))))}),)(((((,{{{.........{(.((((...(((.,....}.)))...)))).)}(((((....))))),}))))))
Back