Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_TPCN1_0002100
Sequence Length
339 nt
GC Content
0.5221
GCCCCCAGUCUCAGCUCUGGGGGUGAGAGUUCCCCCUCCAGCCCCGCACACAACUGGGAGAUGAAUUACCAAGAGGCAGCAAUCUACCUCCAGGCCAAGAAAAACAGAGAGCACUGGUUUGAUGAGCUUCCCAGGACGGCGCUCCUCAUCUUCAAAGGUAUUAAUAUCCUUGUGAAGUCCAAGGCCUUCCAGUAUUUCAUGUACUUGGUGGUGGCAGUCAACGGGGUCUGGAUCCUCGUGGAGACAUUUAUGCUGAAAGGUGGGAACUUCUUCUCCAAGCACGUGCCCUGGAGUUACCUCGUCUUUCUAACUAUCUAUGGGGUGGAGCUGUUCCUGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-103.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -108.70
Frequency: 0.0001
Diversity: 97.76
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((........))))))))((.((((((..((((((....((((....((.(((((.((((..(((.....(((((..(((((.(((((.((.((((.((.(((.((..(((..(((.((((...((.....)).)))).))).(((((((((.........)))).))))).)))..)))))...)).)))).))..))))).)))))..(((.((((((.......))))))...))).....))))).....)))..).))).))))).))...)))).))))))..(((((((..............))))))))))))).)).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((........))))))))(({((((((((((((((((((((.(((.(((((((.(((((.(((...((((.((....}}.}}}|,(((((..........(,{{{{.|||,.{((,.{,,,..,,},},.})).)))}.))..(((((((((.,,....,,)))).))))).....))))),...))).))))).).)))))).))))}......})))).)))),,({.||||||..,.,..,,}..|{,|||,|||}}}}}},,(((((.((....))..)))))..{{|{|||,,,,,.........))))))}|||}}}.}),,.....
Back