Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_TPCN1_0003300

Sequence Length

1220 nt

GC Content

0.5451

GUCCACGCCACCCUGGAGCUGUUUGCCCUGAUGGUGGUAGUGUUUGAACUCUGCAUGAAGUUACGCUGGCUGGGCCUCCACACCUUCAUCCGGCACAAGCGGACCAUGGUCAAGACCUCGGUGCUGGUGGUGCAGUUUGUCGAGGCCAUCGUGGUGUUGGUACGGCAGAUGUCCCAUGUGCGGGUGACCCGAGCACUGCGCUGCAUUUUCCUGGUGGACUGUCGGUAUUGCGGUGGCGUCCGGCGCAACCUGCGGCAGAUCUUCCAGUCCCUGCCGCCCUUCAUGGACAUCCUCCUGCUGCUGCUGUUCUUCAUGAUCAUCUUUGCCAUCCUCGGUUUCUACUUGUUCUCCCCUAACCCUUCAGACCCCUACUUCAGCACCCUGGAGAACAGCAUCGUCAGUCUGUUUGUCCUUCUGACCACAGCCAAUUUCCCAGAUGUGAUGAUGCCCUCCUACUCCCGGAACCCCUGGUCCUGCGUCUUCUUCAUCGUGUACCUCUCCAUCGAGCUGUAUUUCAUCAUGAACCUGCUUCUGGCUGUGGUGUUCGACACCUUCAAUGACAUUGAGAAACGCAAGUUCAAGUCUUUGCUACUGCACAAGCGAACCGCUAUCCAGCAUGCCUACCGCCUGCUCAUCAGCCAGAGGAGGCCUGCCGGCAUCUCCUACAGGCAGUUUGAAGGCCUCAUGCGCUUCUACAAGCCCCGGAUGAGUGCCAGGGAGCGCUAUCUUACCUUCAAGGCCCUGAAUCAGAACAACACACCCCUGCUCAGCCUAAAGGACUUUUACGAUAUCUACGAAGUUGCUGCUUUGAAGUGGAAGGCCAAGAAAAACAGAGAGCACUGGUUUGAUGAGCUUCCCAGGACGGCGCUCCUCAUCUUCAAAGGUAUUAAUAUCCUUGUGAAGUCCAAGGCCUUCCAGUAUUUCAUGUACUUGGUGGUGGCAGUCAACGGGGUCUGGAUCCUCGUGGAGACAUUUAUGCUGAAAGGUGGGAACUUCUUCUCCAAGCACGUGCCCUGGAGUUACCUCGUCUUUCUAACUAUCUAUGGGGUGGAGCUGUUCCUGAAGGUUGCCGGCCUGGGCCCUGUGGAGUACUUGUCUUCCGGAUGGAACUUGUUUGACUUCUCCGUGACAGUGUUCGCCUUCCUGGGACUGCUGGCGCUGGCCCUCAACAUGGAGCCCUUCUAUUUCAUCGUGGUCCUGCGCCCCCUCCAGCUGCUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-399.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -421.33

Frequency: 0.0000

Diversity: 254.54

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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