Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_TUBD1_0000100
Sequence Length
1667 nt
GC Content
0.3977
GUUAUUGUUCAAAACUACAACUCCAUUUUGACACUUUCUCACUUGUACCGAUCUUCAGACGCCCUCCUUCUUCAUGAGAAUGAUGCCAUCCAUAAGAUCUGUGCAAAACUGAUGAAUAUCAAGCAGAUCUCCUUUAGUGAUAUCAAUCAAGUCCUCGCACAUCAGCUGGGAAGUGUGUUCCAGCCUACUUAUUCUGCAGAAAGCUCAUUUCACUACAGACGAAAUCCACUAGGAGACUUAAUGGAGCAUUUAGUUCCCCAUCCUGAAUUCAAGAUGCUGAGUGUUCGUAACAUUCCUCACAUGUCUGAGAAUUCAUUGGCAUACACCACAUUUACUUGGGCUGGCCUCCUCAAGCAUUUGAGACAGAUGCUCAUUUCUAAUGCAAAGAUGGAAGAAGGUAUUGAUAGGCAUGUAUGGCCUCCUUUAUCAGGACUUCCUCCUCUUAGUAAAAUGUCUCUCAACAAGGACCUGCAUUUUAACACUUCCAUUGCUAACUUGGUCAUUCUUCGUGGGAAAGAUGUGCAAAGUGCAGAUGUGGAGGGAUUUAAAGAUCCAGCUCUGUAUACUUCCUGGUUGAAGCCUGUUAAUGCUUUCAACGUGUGGAAAACCCAGCGGGCCUUUAGCAAAUAUGAGAAGUCUGCAGUGUUGGUCAGCAACAGCCAGUUCUUAGUAAAACCACUUGAUAUGAUUGUUGGGAAGGCAUGGAAUAUGUUUGCUUCAAAAGCCUACAUUCAUCAGUACACAAAAUUUGGAAUCGAAGAAGAGGACUUUUUAGACAGUUUCACGUCAUUAGAGCAGGUUGUUGCCAGUUACUGUAAUCUCUGAUCUUGAACAAUGGGAAAAGUAUACCUUAAGGCAUUUCUGGACUAAAAUAUUUUCAAUACUAUUUUCUCUGUAAAGUUUUCAAAGUUCUCCAUCCUGGCUAACACGGUGAAACACCGUCUCUACCAGAAAAUACAAAAAAUUAGCCAGGCGCGGUGGCGGGUGCCUGUAGUCCCAGCUACUCGGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUGACGUGAACCCAGGAGGCGGAGCUUGCAGUGAGCCGAGAUCGCGCCACUGCACUCCAGCCUGGGCGACAGAGCGAGACUCCGUCUCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAUGUUUUCAAAGUUCCAUUCUGUUAAAGUAACCACGUAGAAUGCUGAGUCUAUUCUGCAUACUAUGCCCACAGAAAAGGAAGAAAACUUUUUAAAAUGGAGAAUCGCAUGUUUUCAAUGAAAACAUUCACUUGGUAUUUCAUUUGUAAGAAAAAAAAAUGGUGCUUUUAUAAAGAACUUUGGGGAAACACUUUGCUGAAAUGUUGGGACUCUGGAACUAGCCAAGAAAAGAGAAUAUUCUCUUUGUCUACAUGUUCCUAAAUCUUUACUCCAAAACAACUCCAAAAACAACUCACAAAGCAUGAACCAAACUUUCACAGCAUAAUUUCAAGCUAAGGAAUUGUAAUUCUGUACUUAAUAUAUUCAUGUUUGAAAUGAAUGCUUUGAACCACAGGAGGGAGAUGUUGUCAAAUGCUACAGUGUGAACAUGUAUUUUGAAUAUUCUGUAACAGGGCAAGUUUCCACUCUAAGCAGCUAUUUAAAAAUAAAUAUGAGGAUUUUGGUAAUAAAUGCUUAUGCUUAAGUACAAAAGUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-430.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -461.98
Frequency: 0.0000
Diversity: 358.89
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((((((..(((((.((.(((((((((((((((((((((((((.((((((..((.((..((.(((((...))))).)).))..))...)))))).))))))....((.((((((((((.............((((...(......)...)))).....(((..((((((((...((((((((.....((((..((((.....))))....))))......(((.((((...)))).)))((((((((((((........)))))..)))))))(((((((...)))))))((((......)))).......(((......)))........))))))))........((((((((...)))))))).............((((.(((.((((...(((((((((.......)))).....)))))..)))).)))))))..((((((((.(((......)))...))))))))))))))))...)))..)))))).)))).))))))))))).))).))))))).)).)))))(((((((....((.(((((.(((((.((((((..(((((((((((((.....(((((.....))))).....)))))).)))))))......).))))).))))).))))))).(((((((((.(((((...........(((((((....)))))))..(((.((((((.((((((....((((((((.(.(((.((.((.(.(((...)))).)).)).))))))).))))))))))))))))).)))...))))).)))))))))..........)))))))....)))))))))))...........((((((((((((....((((((..(((((((....((((((((((((......((((..(((((((..(((((((((.((((((...)))))).(((...)))............)))))))))(((....)))..(((((....((((........)))).....))))))))))))....))))((((((....((((..(((((((.((((....)).)))))))))))))..))))))..)))))).(((((...)))))......................((((((....((((.((((((...........(((((.((((.((......)).)))).)))))...))))))..))))))))))((((((((((((((.((((.((((((((...)))))))).....)))).)))))))).))))))....(((((((((((...........(((((.......(((((.(((..((((.(((....(((((......((((((((((....))))))).)))....)))))......................)))...))))..))))))))......)))))..((((.(((((.(((((((((....((((..(((........)))....))))..)))))))))..))))).)))).....((((((((((.(((((...((.(((((.(((..((.......))..))).))))).)).))))))))))).))))))))).)))))).))))))....)))))))))))))...)))))).....))))))...........
Thermodynamic Ensemble Prediction
({,..{(({,,,||,.,.}}}{...{{{({|||,,..,,...((((((.((((((..((.({..((.(((((...))))).)).),,.}}...)))))).)))))}...((((..((((((...{(.....}}....))))))..))))((((((.(((..(((((...(((((((.{(((..((,,....((((...(((((((((((({..((((((.((((((((...((((((((.((((((.{..((((,.(((((..((..((((((((.{.(((.,,,,((((((((((((,((((({(({{,...,...(((.....(((........))),.},)))......((((((((...)))))))).........{((.((((.(((.((((...(((((((((.......)))}....,)))))..)))).))))))).))},|||{{,|||,.....})),{{({{{{{{.,((({({{,{{{({,...,||,,,,,,,..,}})})},),))),,))))))))))))))))))))).....((.(((((.(((((.((((((..(((((((((((((.....(((({.....}}))).....))))))},))))))......).))))).))))).))))))).(((((((((.(((((.{{,.......(((((((....)))))))..(((.((((((.((((((....((((((((.{.(((.((.({.,.((,...,)),.}}.)).)))}))).))))))))))))))))).))),}}))))).)))))))))..))))).}.,,.))).}))))))))))))))).,,{{{,,.,{...,|,.....,}},,,,,,.,,,,,},....})))..}.)))))).))))))))...(((((((..(((((((((.((((((...)))))).({{...))}............}))))))))(((....)))..{((((.,{{((((.,......))),.,}}}))))}))))))}...{({{.((((((....((((..(((((((.((((....)).)))))))))))))..)))))).......((((..((((({.,.,................{{{,.((((((....((((.((((((....,,.....{((((.((((.((,....})).)))).)))))...))))))..))))))))))}))))...))))))..))))((((((((...)))))))),},}.))).))))).)))))).),.....,})))).))))))....))))...,)))))}))))))))))))..))).))))))..(((((,.{,,.{{{{((((((....})))))}.}}},|.,|||}}................,.....,,,.........,,...,,{,,||,.,,.....{(((.(((((.(((((((((....((((,{({,..........,.},,))))..)))))))))..))))).)))}.....||||||||{|,||{{{...{{.{{{{{,|,|,,||,,,,...}),,))),))})}.)}.)))}})))))),}}}|,,|{|..{(((({....}}}}}},}||,||}}}}},...},}}|}}}|}}}})}})).}}})),,.)
Back