Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_TUBD1_0001700

Sequence Length

356 nt

GC Content

0.4775

GUGGGACGAUUGCUUGGGCCCAGAAAUUUGAGACCAGCUCGGGCAACAUAGUGAGACCCCAUCUCUACAAAAAAUAAAAAUAUUAGGCAUGGUGGCGUGUGCCUGUAGUCCCAGCUACUUGGGAGGCUGAGGUGGGAGGAUCACUUAAGGGCAGGAGGUGAAGGCUGCAGUGAGCUGUGAUAGUGCCUCUGCACACCAGCCUGGUGACAGACCAAGAUCCUGUCUCAAAACAAAACAAAACAAAACUGGCAGUAUAUUAUUUUCGAAUAAAUGAUCCAUAUUCAUUGUACAGAAAAGAAAGGGACCAGUGCAGUGGCUCAUGCCUAUAAUCCUAGCACUUUGGGAGGCUGAGGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-105.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -111.91

Frequency: 0.0000

Diversity: 45.55

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((.(.(((((((((.(((.....((((((((((.(((..((.....(((((..(((((((((...................(((((((......)))))))((..((((((....)))))).)).)))))))).)..))))).....))..))).)).((((((..(((((..((......))..)).)))..))))))(((.....)))........))))))))..............................(((((.....(((((.......))))).....)))))....))).)))).))))).)))))(((((....((((((....)))))).....))))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

,((((.(.(((((((((.(((.....((((((((((.(((..((.....(((((..(((((((((..,...............{(((((((......)))))))},..((((({....}))))).},.)))))))).)..))))).....))..))).)).{((((({{({(.((,{.,...,,||..}})))}.,)))))}(((.....)))........))))))))................,|,..,}}...,,.(((((.....(((((.......))))).....))))}....))).)))).))))).)))))|((((....((((({....}))))).....))))}.