Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_TUBD1_0002800

Sequence Length

352 nt

GC Content

0.4233

GUUGUUUUUAGAGGUAAUACACCUAGUUUGUGGCUCAGCAUGUCAAUUGUAACAGUGCAACUUGGUCAGUGUGGCAAUCAGAUUGGUUUUGAAGUUUUUGAUGCUUUGCUUAGUGACUCACACAGUUCCCAGGGACUCUGCUCUAUGAGAGAGAAUGAGGCAUAUCAAGCAUCUUGCAAAGAAAGAUUCUUCAGUGAGGAGGAGAAUGGAGGUAUUGAUAGGCAUGUAUGGCCUCCUUUAUCAGGACUUCCUCCUCUUAGUAAAAUGUCUCUCAACAAGGACCUGCAUUUUAACACUUCCAUUGCUAACUUGGUCAUUCUUCGUGGGAAAGAUGUGCAAAGUGCAGAUGUGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-86.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -94.66

Frequency: 0.0000

Diversity: 84.81

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((.((.(((((((((.(((..((((((((..(((..((.(((((((((((....))))).)))).))))..)))...))))))))..(((((((((((..(((..(((((.(((.((((((.(((((....))))).))((((.....))))..)))).)))...)))))....)))..)))))...))))))..(((((((....((((((.(((((((((.......)))).....))))).))))))))))))).)))...))))))).)).)).)))((((((((...(((((....(((..((((..((((.....))))..))).)..)))))))).))))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((.((.(,((((({{.{{{,{({((((((..(({..((,(((((((((((....))))).)))).))}),})))...)))))))),.{((((({{(((..(((..(((((.(((.((({{{.(((((....))))),|}((((...,}))))..}))).)))...)))))....)))..)}))),..)))))}.{((((((({...((((((.,{{((({{{.,,,...)))),,..,}}}},.}})))))))))},.}}}...}}))))).)).)).)))((((((((...((((,...,(((..,({{..(({(,.,..}})),,)}),),.)))))))).))))))))