Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_TUBD1_0002900
Sequence Length
1110 nt
GC Content
0.4189
GUUGUUUUUAGAGGUAAUACACCUAGUUUGUGGCUCAGCAUGUCAAUUGUAACAGUGCAACUUGGUCAGUGUGGCAAUCAGAUUGGUUUUGAAGUUUUUGAUGCUUUGCUUAGUGACUCACACAGUUCCCAGGGACUCUGCUCUAUGAGAGAGAAUGAGGCAUAUCAAGCAUCUUGCAAAGAAAGAUUCUUCAGUGAGGAGGAGAAUGGAGUUCCAAUUGCCCGGGCUGUUCUUGUUGACAUGGAACCCAAAGUUAUCAAUCAAAUGCUGUCAAAGGCUGCCCAGUCUGGCCAAUGGAAAUAUGGUCAACAUGCAUGCUUCUGUCAAAAACAAGGUUCUGGAAACAACUGGGCAUAUGGUUACUCUGUUCAUGGACCCAGGCAUGAAGAAUCUAUAAUGAACAUAAUCCGGAAGGAAGUGGAGAAAUGUGACUCUUUCAGUGGUUUUUUCAUCAUAAUGAGUAUGGCUGGGGGCACAGGAUCAGGAUUAGGAGCUUUCGUUACACAGAAUUUAGAAGAUCAGUACUCAAACUCAUUGAAAAUGAAUCAGAUUAUUUGGCCUUAUGGAACUGGUGAGGUUAUUGUUCAAAACUACAACUCCAUUUUGACACUUUCUCACUUGUACCGAUCUUCAGACGCCCUCCUUCUUCAUGAGAAUGAUGCCAUCCAUAAGAUCUGUGCAAAACUGAUGAAUAUCAAGCAGAUCUCCUUUAGUGAUAUCAAUCAAGUCCUCGCACAUCAGCUGGGAAGUGUGUUCCAGCCUACUUAUUCUGCAGAAAGCUCAUUUCACUACAGACGAAAUCCACUAGGAGACUUAAUGGAGCAUUUAGUUCCCCAUCCUGAAUUCAAGAUGCUGAGUGUUCGUAACAUUCCUCACAUGUCUGAGAAUUCAUUGGCAUACACCACAUUUACUUGGGCUGGCCUCCUCAAGCAUUUGAGACAGAUGCUCAUUUCUAAUGCAAAGAUGGAAGAAGGUAUUGAUAGGCAUGUAUGGCCUCCUUUAUCAGGACUUCCUCCUCUUAGUAAAAUGUCUCUCAACAAGGACCUGCAUUUUAACACUUCCAUUGCUAACUUGGUCAUUCUUCGUGGGAAAGAUGUGCAAAGUGCAGAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-288.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -311.13
Frequency: 0.0000
Diversity: 234.44
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((........((((.((((.((((..(((((((..(((((.(((.(((......).)).))).)))))((((((((......((((((((((((((((.((.((((((..((.(((((....))))).)).(((.((.(((((..(((......)))..).)))).)).)))...(((((((........)))))))((.((((((......((((.....))))......))))))))..)))))).)).)))).)).))))))))))..))))))))((((((....)).))))......)))))))...)))).)))).))))))))))))))))((((..(((((.........)))))..))))..((((((((.......((((.((.......((.(((((((..((((((((..(((((.(((((((((.((..((.((((((((.((((((((.((((...((((((..(((((....((((............(((((((.((((((((.....))))((((((......))))))..((....))....(((((((....(((.(((((...........))))))))...))))))).)))).))))))).))))..)))))..))).)))((.(((((.(((.....((((((((....................))))))))......))).))))).))...((((.((......)).))))..)))))))))))))))))))).))..((((.....))))......)).)))).))))).((((((.....(((((.....)))))......(((((((.(((((..(((((((...)))))))..))....)))..)))))))..(((.((..(((........)))..)))))......((((((((...)))))))).........(((.((((.(((.((((...(((((((((.......)))).....)))))..)))).))))))).)))....))))))....)))))..))))))))..))))))).)).......)).))))))))))))......((.((((...)))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((((((((........((((.((((.((((..(((((({..{((((.{((.({{....,,|,|}.}}},|}}}|((((((((....|.((((((((((((((((.((.((((((..,,.(((((....))))},|,,(((.((.{((({..(((......)))..}.}))}.)}.})}.,,|{(((((......,,)))}}}|((.((((((..,{,.,{{{,....}}}}..,.,,)))))))),.)))))).)).)))).)).)))))))))),}))))))))|||||{,....},)))},.....)))))))...)))).)))).))))))))))))))}(((((..(((((.......,.)))))..))))}.(((((((({......,(({.((......,,(,(((((((..((((((({..(((({.(((((.,{((((..{,.{(((((((.(((((((((((((...((((((..(((((..,{(,,,.....}},....(((((((.((((,{{,..,,,||},.|||||.,{{{....)))},((....))....(((((((....(({{(((((...........))))))))...))))))).)))).))))))).},,}..)))))..))).})}{{.(((({.(({.....((((((((.......{{{{....|}},.))))))))......})).))))).))...((((.((......)).))))..)))))))))))))))))))}.||..{|{{.....}}}}.....,)}.)))).))))).|||||,.....(((((,,,..}}}}}.,,,,.(({{{{|,{||||.,(((((({...})))}}}||||..,|}}),,)}}}}}}..(((.,,..(((........))),.,,)))......((((((((...)))))))).........(((.((((.(((.((((...(((((((((.......)))}....,)))))..)))).))))))).)))....||||},....,}))),.,)))))))..))))))).)).,.....)).))))))))))))....,.((.((({...}))).))
Back