Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_TULP4_0006600

Sequence Length

343 nt

GC Content

0.5423

GUGAGUGAUUUCACGUGGAGCCAUGAUGGAACUCAAGCACUUAUUUCCUAUCGAGAUGGGUUUGUCCUGGUUGGGUCUGUCAGUGGACAAAGACACUGGUCAUCCGAAAUCAACUUGGAAAGUCAAAUUACGUGUGGCAUAUGGACUCCUGACGACCAACAGGUGCUGUUUGGCACGGCCGAUGGGCAGGUGAUUGUCAUGGAUUGCCACGGCAGAAUGCUGGCCCACGUCCUCUUGCACGAGUCAGACGGUGUCCUCGGCAUGUCCUGGAACUACCCGAUCUUCCUGGUGGAGGACAGCAGCGAGAGCGACACGGACUCAGAUGACUACGCCCCUCCCCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-106.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -112.36

Frequency: 0.0001

Diversity: 108.72

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((..((((((((((((....)))).))))).)))..)))(((((((.....)))))((((..(((....(((((((((((((((........)))))....(((((.......)))))............(((.(((...((((.(((((((((.((.....((((..(((((...)))))..))))..)).)))))).))).).)))(((((...)))))))))))((((((((((.((((.((.....))..))))((.((((((....(((((.(......).))))))))))))).))))))).)))))))))))))..)))...)))).......))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((,,(({(((((((((....)))).)))}}.}}}..}}}{{{{{{{.....|}|},((((..(((....(((((((((((((((........))))),.,.(((((.......)))))..,,.......,{(({({(,.,{((.{,((((,,,,.,..}}}},|||}},||||}},|}||,{{|||.{{||.|||||,,||}.,,))){||||,..})))})))))}((((((((((.((((.{,,,{..})}}))))((.((((((....(((((.(......).))))))))))))).))))))).)))))))))))))..)))...)))),}}....})