Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_UBAP2_0001700
Sequence Length
2619 nt
GC Content
0.5155
CUUAUGGAAGUGACAGGGAAAAAUCAGGAUGAAUGCAUAGUGGCCCUACAUGAUUGUAAUGGAGAUGUGAACAAAGCUAUCAAUAUAUUGCUGGAAGGGAAUUCAGACACAACUUCAUGGGAGACUGUAGGGUGUAAGAAAAAGAAUUUUGCAAAAGAAAAUUCAGAAAACAAAGAGAAUAGAGAGAAGAAAAGCGAGAAAGAAUCGAGUCGUGGACGUGGAAACAACAACCGGAAAGGAAGAGGCGGCAAUCGUGGCAGAGAAUUUAGAGGUGAAGAAAAUGGAAUUGAUUGCAAUCAAGUGGACAAACCUUCAGAUCGUGGCAAGCGAGCCCGGGGUAGAGGAUUUGGACGUGGCAGAGGGAGAGGGGCAGGAAGGUUCUCAACCCAAGGCAUGGGGACAUUUAAUCCUGCAGACUAUUCAGAUUCUACAUCUACAGAUGUGUGUGGGACAAAGCUAGUAGUUUGGGAAGCUGCUCAGAAUGGUGCAGAUGAGGGAACUGAACUGGCAUCAAAUACUCACAACAUAGCUCAGGAUCUGUCAAACAAAAGUUCUUAUGGACUCAAAGGGGCUUGGAAGAAUUCUGUGGAAGAGUGGACAACAGAAGACUGGACUGAAGAUCUUUCUGAAACAAAGGUCUUCACUGCCUCAUCUGCUCCAGCAGAGAAUCACAUCUUACCUGGGCAAAGCAUUGAUCUGGUAGCCUUGCUCCAGAAGCCUGUUCCUCACAGUCAAGCCUCAGAAGCCAACUCCUUUGAAACUUCCCAACAGCAGGGCUUUGGCCAAGCCCUUGUCUUCACAAAUUCGCAACACAACAAUCAGAUGGCACCAGGGACUGGCAGCUCCACUGCCGUCAACUCCUGUUCUCCUCAGAGCCUGUCAUCCGUCCUUGGCUCAGGAUUUGGAGAGCUUGCACCACCAAAAAUGGCAAACAUCACCAGCUCCCAGAUUUUGGACCAGUUGAAAGCUCCGAGUUUGGGCCAGUUUACCACCACCCCAAGUACACAGCAGAAUAGUACAAGUCACCCUACAACUACUACUUCUUGGGACCUCAAGCCCCCAACAUCCCAGUCCUCAGUCCUCAGUCAUCUUGACUUCAAAUCUCAACCUGAGCCAUCCCCAGUUCUUAGCCAGUUGAGCCAGCGACAACAGCACCAGAGCCAGGCAGUCACUGUUCCUCCUCCUGGUUUGGAGUCCUUUCCUUCCCAGGCAAAACUUCGAGAAUCAACACCUGGAGACAGUCCCUCCACUGUGAACAAGCUUUUGCAGCUUCCCAGCACGACCAUUGAAAAUAUCUCUGUGUCUGUCCACCAGCCACAGCCCAAACACAUCAAACUUGCUAAGCGGCGGAUACCCCCAGCUUCUAAGAUCCCAGCUUCUGCAGUGGAAAUGCCUGGUUCAGCAGAUGUCACAGGAUUAAAUGUGCAGUUUGGGGCUCUGGAAUUUGGGUCAGAACCUUCUCUCUCUGAAUUUGGAUCAGCUCCAAGCAGUGAAAAUAGUAAUCAGAUUCCCAUCAGCUUGUAUUCGAAGUCUUUAAGUGAGCCUUUGAAUACAUCUUUAUCAAUGACCAGUGCAGUACAGAACUCCACAUAUACAACUUCCGUCAUUACCUCCUGCAGUCUGACAAGCUCAUCACUGAAUUCUGCUAGUCCAGUAGCAAUGUCUUCCUCUUAUGACCAGAGUUCUGUGCAUAACAGGAUCCCAUACCAAAGCCCUGUGAGUUCAUCAGAGUCAGCUCCAGGAACCAUCAUGAAUGGACAUGGUGGUGGUCGAAGUCAGCAGACACUAGACACUCCAAAGACAACAGGCCCUCCCUCUGCCCUCCCGUCUGUGAGCUCCCUGCCCAGCACCACCUCCUGCACUGCACUUCUGCCGUCCACAUCCCAGCACACUGGCGACCUGACUAGCAGCCCUCUCUCUCAGCUUAGCAGUUCGCUCUCCAGCCACCAGAGCAGCCUCUCUGCACAUGCAGCCCUCUCCUCGAGCACGUCACACACACAUGCCAGUGUGGAGAGCGCCUCUUCCCACCAGUCCUCAGCCACCUUCUCCACGGCAGCGACCUCCGUCUCAAGUUCCGCAUCCUCAGGCGCCAGCCUGUCCAGUAGCAUGAACACCGCGAACAGCCUCUGUCUGGGUGGGACCCCCGCGAGUGCAUCCAGCAGCAGUAGCAGGGCCGCGCCCUUGGUGACCUCAGGCAAAGCACCCCCAAACUUACCUCAGGGGGUGCCUCCCCUGCUGCACAACCAGUACCUCGUAGGUCCCGGAGGACUGCUUCCUGCCUACCCGAUCUAUGGCUAUGACGAGCUCCAGAUGCUGCAGUCACGGCUGCCAGUGGACUACUAUGGAAUUCCCUUUGCUGCACCCACAGCGCUUGCCAGCCGAGAUGGGAGCCUAGCUAAUAAUCCAUAUCCAGGUGAUGUCACAAAGUUUGGCCGUGGGGACUCUGCAUCCCCUGCACCCGCUACCACACCAGCUCAGCCACAGCAGAGCCAAUCACAGACCCACCACACAGCCCAGCAGCCCUUCGUGAAUCCUGCACUGCCACCUGGCUAUAGCUACACUGGUCUUCCCUACUACACAGGCAUGCCCAGUGCCUUCCAGUAUGGCCCCACCAUGUUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-784.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -831.07
Frequency: 0.0000
Diversity: 709.78
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((.((((.(((((.....(((.((.(..(((...(.(((..((((....)))).((((.(((.((....(((((......(((((((((((((((((((.........(((((((.((.((((.(((((((.......(((((((.......)))))))...........(((.(((((...........((((..((.(((.((((((((.((((........((.((...((((((((((((...(((((((((((.......((((.......((((.(((((....)))))((((((............((.(((......)))))((((((.(((((((((((.((((((((((...((((.((((((((((..(((((((...((((((((((((((((((..(((.....((((.....))))...(((((((.((((.........((.((((((((((((((..((..((..((((..((((((.((((((((((...((..(((.........((((((((((((..........((((....))))(((((((((.((((.....(((((.((..((.((((.(((((....(((((.(((((((((((.......)))))))))))(((((..(((((((((((..((((......))))..))))....))))..)))..)))))......)))))....)))))..)).)).))...)).))))).)))))))))))))............(((((((((.....)))))).))).........................)))))((.((..((((((((..((((....((..((((((...((((......(((((..............)))))(((((((((.(((((((.....(((....))).......))..)))))))))))))))))).))))))..))...))))(((((...((.....))...))))).........(((((((((...((......))...))))).))))((((..........)))).....))))))))..))))..(((((...)))))...........))))))).......)))..)).)))))))(((.(((.(((..(.((......))...)..))).)))...)))((((.((((((((((..((((((....))).))))))))))........))).)))).)))))))))..))))...))..))...)))))))))))).)).))..............(((((.(((.....))).))))))))).)))))))...((((..((((((.((....)))).)))).)))).((((.((....)).).))).....(((......)))..))).)))))))))))))...........)))))...))))))).)))))))))).....((...((((((.(((......((((((....(((..(((((((..........(((((((((((.(((.....))).)))))))))))........((((((..(((.(((.....))).))).............)))))).........)))))))...)))..))))))......))).))))))...)).(((((((((.(((((..(((....)))..))))).))))..............((((.(((((.((....)).))))))))).(((((((((......))))))))).(((...(((....)))....))).......)))))....))))))))))))))....)))))..))).))))))))).(((........)))...(((....))).))))))....(((....)))((((.(((.(((((..............)).)))))).))))..))))..)))).........))))))).))))..)))((((((.((.(((.((.......)).)))...)).)))))).)))))))))..)).))......))))....))))))))..)))..))..))))..((((.((((...(((((....)))))....)).))..))))...((.....))))))))))..(((((...)))))...))))))).(((((.(((((((((....(((...((...))...)))...((((((((............))))))))...)))))))))..............((((((...(((((....))))).))))))...((((..((((......))))..)))))))))....)))))).))).))))........))))))))))(((((......)))))....)))))...))))......))))).....))))).))))((((..(((.....((.(((..(((((.....((((.....)))))))))..))).))..((((.((....)).))))........))).)))).....)))).)))..)..)).))).)))))))))(((....)))....((((.(((((...............((((((.....)))))).))))).))))....)))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
..{{(((.{(((.{((((.....{(({{{{{..{((.,,,{{(({{((((...{|,|,,(((((.((((.....,{{,,........,,|||{(({,,...|||,,.}}}}.}}}}}}|,,|,.||||}||||{{........(((((((.......)))))))............,..,.{,{.,..,.....,((((..{{.(((.((((((((.((((........((.((...((((((((((((...(((((((((((.....((((((..,....,((..((({{,,,.}}}},{((((,.....,,,,...((.(((......)))))((((((.((({(((((((.(((((((((({.(((({,((((((((((..(((((((((.(((((((({{{,,(((((,,{((...,.((((.....))))...(((((({.{(((.....,...{{.({{(((((((((((..((..((.{((((..((((({,((((((((((...{{..(((......,,.(((((((...{{,...,,...{((((....))))|{{{{((((,((((.....,{{{(,((.,((.(((,.{{{{(,,,,({(({.(((((((((((.......))))))))))){{({{..({{((({((((..((((......))))..))))},,.,}}}..))|,,||}||,...},))))),...|||}}..}},)).})...}}.}}|||.}}}}}}}}))))}............|,(((((((.....))))))},)},,,,.{{,,,,,{.....,,.,....,((((({,.,{((((({(((((.....)))))}}|,,{,.,,|||,,...,,|||||}},|,.}.,,,..{||,{((((((((((.(((((((.....{{,....}))...........)))))))))))))))).)}))})),..}||.,)))}|||{{,,,{|,,.,,}}...|||||{......,.{({,(((((...({......}}...))))).)}))||||....,,,}},)),........}}},,..,}},,..{||||,,.})))}...........))))))).,,....)))..}}.))))))){{{.,((.(((..{.({,,,,,,|}..{|,,|},.))),,,,,.||||}||||||{{||..,|}||,..{{|||.....,||,,,.........))}))}).)))))))))..)))),..))..))...))))))))))))}}},{{,,..|,.....,,.{||{|,|{|,...,))),)}}}})))}.}))))))...,,{{,.,{(({(.((....)))).)))|,||||,{((({(,..{{||{,.},,..,.{(((...{{.,,,.}),}.))))))),,,}})}}}}.}}}}}}})})}},.,)))))).)))))))))},,,,}|{...((((({.{((...,..((((((....(((..(((((((......,{..(((((((((((.(((.....))).)))))))))))........((((((.,(({.{((.....}}}.}}}.......,,,...))))))......,}.)))))))...)))..))))))......))}.})))}},,,}}.(({{{((((.(((((.,(((....)))..))))).))))...,..........((((.(((((.{,....}}.))))))))).(((((((((......))))))))),(((...(((....)))....))).......}))},...,})))))))))))))....)))))..})}.))))))))).{{{.,,,,,,.}|}.,.(({...,}}|.|}}}},.{{((((....)))).||.{{{.|,,||||............))},,)))).},||{{{.........})))}.,,.))))))).))))..)))((((((.{{.(((.{{.......}}.)))..,)),)))))).)))))))))..)).))......))))....))))))))..)))..))..))))..||||.,|,}}}}(((((....)))))..||||,|||,|,,,..(((({{..({..|{(,((((((((((((...((((((((.....{{{({{({{,((((({...|||},.|{||.,,...||,...((((((((............))))))))...}}))))))).......))}.})))).))))))(((((,...}}))),,}}.,|{(.((((.{((((..{.((((({{{{..|{{{(((({...,)))}}})}))}}.......||,...,)}...((((......))))))))),}))))}))))}))||{..,))}.....,,,,,.,,..((((..(({.....{{.(((..(((((.....((({.....)))))))))..))).}}..((((.((....)).))))........))).)))).....)))))))))}..))))))..))))))))){{{....}))....|||{.{{(((,...,|||.......((((((.....)))))).))))},}))}....))))),..
Back