Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_UBAP2_0005800
Sequence Length
1131 nt
GC Content
0.4907
CUUUCUGAAACAAAGGUCUUCACUGCCUCAUCUGCUCCAGCAGAGAAUCACAUCUUACCUGGGCAAAGCAUUGAUCUGGUAGCCUUGCUCCAGAAGCCUGUUCCUCACAGUCAAGCCUCAGAAGCCAACUCCUUUGAAACUUCCCAACAGCAGGGCUUUGGCCAAGCCCUUGUCUUCACAAAUUCGCAACACAACAAUCAGAUGGCACCAGGGACUGGCAGCUCCACUGCCGUCAACUCCUGUUCUCCUCAGAGCCUGUCAUCCGUCCUUGGCUCAGGAUUUGGAGAGCUUGCACCACCAAAAAUGGCAAACAUCACCAGCUCCCAGAUUUUGGACCAGUUGAAAGCUCCGAGUUUGGGCCAGUUUACCACCACCCCAAGUACACAGCAGAAUAGUACAAGUCACCCUACAACUACUACUUCUUGGGACCUCAAGCCCCCAACAUCCCAGUCCUCAGUCCUCAGUCAUCUUGACUUCAAAUCUCAACCUGAGCCAUCCCCAGUUCUUAGCCAGUUGAGCCAGCGACAACAGCACCAGAGCCAGGCAGUCACUGUUCCUCCUCCUGGUUUGGAGUCCUUUCCUUCCCAGGCAAAACUUCGAGAAUCAACACCUGGAGACAGUCCCUCCACUGUGAACAAGCUUUUGCAGCUUCCCAGCACGACCAUUGAAAAUAUCUCUGUGUCUGUCCACCAGCCACAGCCCAAACACAUCAAACUUGCUAAGCGGCGGAUACCCCCAGCUUCUAAGAUCCCAGCUUCUGCAGUGGAAAUGCCUGGUUCAGCAGAUGUCACAGGAUUAAAUGUGCAGUUUGGGGCUCUGGAAUUUGGGUCAGAACCUUCUCUCUCUGAAUUUGGAUCAGCUCCAAGCAGUGAAAAUAGUAAUCAGAUUCCCAUCAGCUUGUAUUCGAAGUCUUUAAGUGAGCCUUUGAAUACAUCUUUAUCAAUGACCAGUGCAGUACAGAACUCCACAUAUACAACUUCCGUCAUUACCUCCUGCAGUCUGACAAGCUCAUCACUGAAUUCUGCUAGUCCAGUAGCAAUGUCUUCCUCUUAUGACCAGAGUUCUGUGCAUAACAGGAUCCCAUACCAAAGCCCUGUGAGUUCAUCAGAGUCAGCUCCAGGAACCAUCAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-294.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -316.23
Frequency: 0.0000
Diversity: 297.26
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((......(((.(((.((((.......(((.((((..((((......))))..))))))).((((....(((((.(((...))))))))....)))).....)))).))))))....(((..((((...((((.(((.......((((((((((((...((((((((((.((.......................)).))))..)))).))(((((.....)))))......(((((((...(.(((((((((((((.......(((((((((((((((.(((((((.....(((....))).......))..)))))))))))...((((....(((..(((..((..(((((...((((........((((((.........((.(((((...((......))...))))).)))))))).....)))).)))))..))..)))..)))))))..(((((...)))))...........))))))))).(((.((((((.((((.((((......))))..........((((((((((.(((((((.......(((((...((((....))))...)))))..................(((.(((((.......)))))..)))...(((((.....)))))...((((......((((........(((((.(((.....))).)))))..........))))...))))((((((.((....)))).))))...(((........))))))))))...))))))))))..(((((..((((........))))..))))).))))..)))))).)))(((((..........)))))..((((((.(((......((((((....(((..(((((((..........(((((((((((.(((.....))).)))))))))))........((((((..(((.(((.....))).))).............)))))).........)))))))...)))..))))))......))).))))))..................)))).))).)))))).)...))))))).......)))))))))))))))))))...))))..))).)))))).((...))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,((((((......(((,,,,.,,{||},....(((.((((..((((......))))..))))))).}|{{.,||(((((.(((...)))))))).,.,{{{,....,))),.,,}}||..{.(((..((((...((({{(((.......((((((((((((,,,{(((((,{{(,,(,{,....................||{|||}..||||{{|(((((.....)))))},,..,{{{{({{...,.{|((({{{{{{{,.......{(({(((((((((((.(((((((.....{{,....}))...........)))))))))))}}}||,|,}},|||..|{{..|||{(((((...({.....,,...||||||.....,},{(({(((((...({......}}...))))).))))|(((.......,,.)}}},..,},,}}},,,.|||||..{((({...})))}......{{{{{|||||||,,......|,,|,.,}||,}}}))}...{,{{{,.,.||....((((((((((.,,(((((..,,,{.(((((,,,((((,...|}||...}}))).,..,,,,,}},...,...,,.,})}}}}}}}..,||||{{||{...{((((...,,,|||,...|||{.,....,(({........(((((.(((.....))).)))))..........}}},.|.|}}}{(((((.((....)))).)))}...||,....,},,)}})))))))}..)))))))))).}|,|,|}}|,|{}},,....)))).})}}})))))).}))},,|||||{{(((..........))))).,{(((({.{{{,,,,,.((((((....(((..(((((((......,{..(((((((((((.(((.....))).)))))))))))........((((((.,(({.{((.....}}}.}}}.......,,,...)))))).......}.)))))))...)))..)))))).....,|||,}}}}},,,}},,,,...{{{{.{{|||,,{||.,,,))).,})})),))))...}},.)))))))))))))))))))...))))..))),)))))).,,...})
Back