Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_UBAP2_0006200
Sequence Length
1487 nt
GC Content
0.4849
UUAGAGGUGAAGAAAAUGGAAUUGAUUGCAAUCAAGUGGACAAACCUUCAGAUCGUGGCAAGCGAGCCCGGGGUAGAGGAUUUGGACGUGGCAGAGGGAGAGGGGCAGGAAGGUUCUCAACCCAAGGCAUGGGGACAUUUAAUCCUGCAGACUAUUCAGAUUCUACAUCUACAGAUGUGUGUGGGACAAAGCUAGUAGUUUGGGAAGCUGCUCAGAAUGGUGCAGAUGAGGGAACUGAACUGGCAUCAAAUACUCACAACAUAGCUCAGGAUCUGUCAAACAAAAGUUCUUAUGGACUCAAAGGGGCUUGGAAGAAUUCUGUGGAAGAGUGGACAACAGAAGACUGGACUGAAGAUCUUUCUGAAACAAAGGUCUUCACUGCCUCAUCUGCUCCAGCAGAGAAUCACAUCUUACCUGGGCAAAGCAUUGAUCUGGUAGCCUUGCUCCAGAAGCCUGUUCCUCACAGUCAAGCCUCAGAAGCCAACUCCUUUGAAACUUCCCAACAGCAGGGCUUUGGCCAAGCCCUUGUCUUCACAAAUUCGCAACACAACAAUCAGAUGGCACCAGGGACUGGCAGCUCCACUGCCGUCAACUCCUGUUCUCCUCAGAGCCUGUCAUCCGUCCUUGGCUCAGGAUUUGGAGAGCUUGCACCACCAAAAAUGGCAAACAUCACCAGCUCCCAGAUUUUGGACCAGUUGAAAGCUCCGAGUUUGGGCCAGUUUACCACCACCCCAAGUACACAGCAGAAUAGUACAAGUCACCCUACAACUACUACUUCUUGGGACCUCAAGCCCCCAACAUCCCAGUCCUCAGUCCUCAGUCAUCUUGACUUCAAAUCUCAACCUGAGCCAUCCCCAGUUCUUAGCCAGUUGAGCCAGCGACAACAGCACCAGAGCCAGGCAGUCACUGUUCCUCCUCCUGGUUUGGAGUCCUUUCCUUCCCAGGCAAAACUUCGAGAAUCAACACCUGGAGACAGUCCCUCCACUGUGAACAAGCUUUUGCAGCUUCCCAGCACGACCAUUGAAAAUAUCUCUGUGUCUGUCCACCAGCCACAGCCCAAACACAUCAAACUUGCUAAGCGGCGGAUACCCCCAGCUUCUAAGAUCCCAGCUUCUGCAGUGGAAAUGCCUGGUUCAGCAGAUGUCACAGGAUUAAAUGUGCAGUUUGGGGCUCUGGAAUUUGGGUCAGAACCUUCUCUCUCUGAAUUUGGAUCAGCUCCAAGCAGUGAAAAUAGUAAUCAGAUUCCCAUCAGCUUGUAUUCGAAGUCUUUAAGUGAGCCUUUGAAUACAUCUUUAUCAAUGACCAGUGCAGUACAGAACUCCACAUAUACAACUUCCGUCAUUACCUCCUGCAGUCUGACAAGCUCAUCACUGAAUUCUGCUAGUCCAGUAGCAAUGUCUUCCUCUUAUGACCAGAGUUCUGUGCAUAACAGGAUCCCAUACCAAAGCCCUGUGAGUUCAUCAGAGUCAGCUCCAGGAACCAUCAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-425.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -454.44
Frequency: 0.0000
Diversity: 327.81
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..((((((((....((((((((((((........(..((((((((....(((.(((......))))))....)))).))))..)....(((((((((((((((((((..(((((((.((...))..)))))))......)))))).((((...((((((((.........(((((((.((((.........((.((((((((((((((..((..((..((((..((((((.((((((((((...((..(((.........((((((((((((..........((((....))))(((((((((.((((.....(((((.((..((.((((.(((((....(((((.(((((((((((.......)))))))))))(((((..(((((((((((..((((......))))..))))....))))..)))..)))))......)))))....)))))..)).)).))...)).))))).)))))))))))))............(((((((((.....)))))).))).........................)))))((.((..((((((((..((((....((..((((((...((((......(((((..............)))))(((((((((.(((((((.....(((....))).......))..)))))))))))))))))).))))))..))...))))(((((...((.....))...))))).........(((((((((...((......))...))))).))))((((..........)))).....))))))))..))))..(((((...)))))...........))))))).......)))..)).)))))))(((.(((.(((..(.((......))...)..))).)))...)))((((.((((((((((..((((((....))).))))))))))........))).)))).)))))))))..))))...))..))...)))))))))))).)).))..............(((((.(((.....))).))))))))).))))))).........((((((.((....)))).))))...(((((((((...(((((.....(((.((((...((.....))...))))))).....))))).)))))).)))))))))))))))....)))))))))))))..((((((.....))))))...........))))))).)))))........(((((((((((.(((.....))).)))))))))))))))))))..)))(..(((.(((.....))).)))......................(((((.(((((((..(((((((..........(((((......)))))(((...((((.(((((..(((....)))..))))).))))...)))...........)))))))..)))).....))).)))))........)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((..((((((((...,((((((((((((..,{,..{(..((((((((....(((.(((......))))))....)))).))))..)},,.(((((((((((((((((((,.(((((((.{(...,)..)))))))......)))))).{{{,..,{(((({{{.........(((((((.((((.,...,...((.({{(((((((((((..((..((.{((((..((((({,((((((((((...{{..(((......,,.(((((((...{{,...,,...{((((....))))|{{{{((((,((((.....,{{{(,((.,((.(((,.{{{{(,,,,({(({.(((((((((((.......))))))))))){{({{..({{((({((((..((((......))))..))))},,.,}}}..))|,,||}||,...},))))),...||||}..}},)).})...}}.}}|||.}}}}}}}}))))}............|,(((((((.....))))))},)},,,,.{{,,,,,{.....,,.,....,((((({,.,{((((({(((((.....)))))}}|,,{,.,,|||,,...,,|||||}},|,.}.,,,..{||,{((((((((((.(((((((.....{{,....}))...........)))))))))))))))).)}))})),..}||.,)))}|||{{,,,{|,,.,,}}...|||||{......,.{({,(((((...({......}}...))))).)}))||||....,,,}},)),........}}},,..,}},,..{||||,,.})))}...........))))))).,,....)))..}}.))))))){{{.,((.(((..{.({,,,,,,|}..{|,,|},.))),,,,,.||||}||||||{{||..,|}||,..{{|||.....,||,,,.........))}))}).)))))))))..)))),..))..))...))))))))))))}}}.,,,.,,|.........(((((.(((.....))).))))))))).)))))))....,{{,,,{{{||,{{....}|||,|}||,|,{({((((((...(((((.....,{{.((((...((.....))...))))}}}.....))))).)))))).)})))))})))))},....)))))))))))))..{(((((.....)))))}...........)))))))}})))).,......(((((((((((.(((.....))).)))))))))))))))))))..})}(..(((.(((.....))).))).............}},,.....(((((.((,(((({.,{{(({,...,{,.,,,(((((......))))){((...((((.(((((.,(((....))).,))))).))))...))}..........,}}))))},,,,,),))})))).)))))........)
Back