Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_UBAP2_0006300
Sequence Length
294 nt
GC Content
0.5000
GGGCUUGGAAGAAUUCUGUGGAAGAGUGGACAACAGAAGACUGGACUGAAGAUCAGGGCUUUGGCCAAGCCCUUGUCUUCACAAAUUCGCAACACAACAAUCAGAUGGCACCAGGGACUGGCAGCUCCACUGCCGUCAACUCCUGUUCUCCUCAGAGCCUGUCUGACAAGCUCAUCACUGAAUUCUGCUAGUCCAGUAGCAAUGUCUUCCUCUUAUGACCAGAGUUCUGUGCAUAACAGGAUCCCAUACCAAAGCCCUGUGAGUUCAUCAGAGUCAGCUCCAGGAACCAUCAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-92.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -97.77
Frequency: 0.0003
Diversity: 73.53
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((.(((((((.((((..(((((((.(((((.((.((((..(((((((.(((((((.....))))))).))))))).......((.................)).)))).(((.(((((.....))))))))..)).))))).)))(((((.....)))))...)))).)))).)))))))((((......)))).(((...((((.(((((..(((....)))..))))).))))...))).)).))))))(((((((((....(((....)))...))))..)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((.{(((((({(({{,,(((,(((,{{{{,...{(((({{(((((((.(((((((.....))))))).))))))}.......,...........{{{(({(((..{{(((((.(((((.....))))))))....}))),|,|,,,,|||}}}.})))))...||}}.,,,,.))}}},}||||}}}}}}),,,.,||},,{{||}||,|,.,|||}}}}))|,.},,,),}}}}...},,.))}})))))(((((((((....(((....)))...))))..)))))
Back