Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_UBAP2_0010400

Sequence Length

377 nt

GC Content

0.4854

AACUGGCAUCAAAUACUCACAACAUAGCUCAGGAUCUGUCAAACAAAAGUUCUUAUGGACUCAAAGGGGCUUGGAAGAAUUCUGUGGAAGAGUGGACAACAGAAGACUGGACUGAAGAUCUUUCUGAAACAAAGGUCUUCACUGCCUCAUCUGCUCCAGCAGAGAAUCACAUCUUACCUGGGCAAAGCAUUGAUCUGGUAGCCUUGCUCCAGAAGCCUGUUCCUCACAGUCAAGCCUCAGAAGCCAACUCCUUUGAAACUUCCCAACAGCAGGGCUUUGGCCAAGCCCUUGUCUUCACAAAUUCGCAACACAACAAUCAGAUGGCACCAGGGACUGGCAGCUCCACUGCCGUCAACUCCUGUUCUCCUCAGAGCCUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-103.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -107.23

Frequency: 0.0012

Diversity: 60.20

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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