Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_UBAP2_0011800

Sequence Length

1007 nt

GC Content

0.4598

GCAGGAUCUCACUUUGUCCCCUAGGCUGGAGUGCAGUGGUGUGAUCAUGGCUCACGGCAGCCUCAACCUCUGGACUGAAGCGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCCAUGUAGCUGGGACAGGUGCACACCACCACGACCAGCCAAUUUUUUUUUUUUUCCUAGAGAUGAAGCCUUACUUCUGGCCUCAAGCAAUCCUCCUGCCUCGGCUGCCCAGAGUGUUGGGCUUUCAGGUGUGAGCCACCAUUCCUGGCCACCUUCUCAACUUCUUUUUGGCAUUUCUGUUAGCAUUGUUGGUGGGUUUAUUGGUAUUCUCAUUUUGUGUAAUGACAAAUAGAGAAGUGAGUCUGCGGUUGAGCCCUGGUUUGAGUGUUUCACUGUGUUGUUUACCAUUAGUCUCAUCAUUUUCCUGAUUUGAAGUCAUUCUUGUAGGCCUUUCAAUCUAAAAUUACCUUCACUUGCAGCCGGGCGCCAUGGCUUAUACUUGUAAUCCCAACACUUUGGGAGGUCAAGGUGGGUGCAUCACUUGAGGCCAGGAAUUGGAGAUUAUCCUGGGCAACAUGGCAAAACCCUGUUUCUACUAAAAAUACAAAAAUUAGCUCGGUGUGGUGGCGCAUGCUGGUGCGUGCCUGGAGGCCCAGCUACUCAGGAGGCUGAGGCGAGAUGAUCGCUUGAACCCAGGAGGCACAGAUUGCAGUGAGCCGAGAUCACGUCACUGCACUCCUUCCUGGGCAACAGCGCCAGACCCUGUCUCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAUUGCAUUCACUUGAAAAUUACUUGUCAUGGUCACUUGUAUAUUUCAUUUUCUUUAGAAUAGCUGUUAUGCGAAGUGUAAGAGACUACUGAUGACUACAAAUGAUCAGGAAGUCAGUGUUUUGGGUUUAGUAGUAUGUAGAAUAAGAUUAAAUUUUUCAACUUUCCAUACAGCUUUCUGAAACAAAGGUCUUCACUGCCUCAUCUGCUCCAGCAGAGAAUCACAUCUUACCUGGGCAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-385.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -400.07

Frequency: 0.0000

Diversity: 158.02

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((.(((..(.((((..((((((..(((((((((((((((((((.((((((((.((((.((...(((((((..(.((((((((.((.(((((((((((((...(((((((((.(((((((...(((((((.((((((.(((((((...((((((((((.(((((..((....(((((((((((((..((.(.(((((((.((((.((((((((((((((.((.(((((((((((((.....((((((...................((((..(((.(((((......(((((((.(((.(((((.((((..(((((......)))))..))))((((((...(((.((((((....)))))).)))))))))........))))).))).))))))).....)))))..)))))))....((((((........................)))))))))))).....))))))))))))).)).)))))))))))))).)))).))))))).).))..)))))))))))))...))...)))))))))).((((.((.....)).))))......)))))...))))))).))).)))))))))).((((....)))))))))))....)))))))))...))))))))))))).)).)))))))).)..))).))))...)).)))).)))))))).)))))))))))))))))))..))))))..)))).)..))).)))))((...............................(((((..(((..((.......))..)))..))))).....(((((((.((((((.(((.(((((..((((((((.(((((...........)))))..))))..(((((((.((........)).))))))).........))))..))))).))))))))))))))))....((((.......))))....(((.((((..((((......))))..))))))).))

Thermodynamic Ensemble Prediction

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