Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_UBAP2_0013700
Sequence Length
279 nt
GC Content
0.5556
GAUUUGGACGUGGCAGAGGGAGAGGGGCAGGAAGGUUCUCAACCCAAGGCAUGGGGAUCUCACUUUGUCCCCUAGGCUGGAGUGCAGUGGUGUGAUCAUGGCUCACGGCAGCCUCAACCUCUGGACUGAAGCGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCCAUGUAGCUGGGACAGGUGCACACCACCACGACCAGCCAAUUUUUUUUUUUUUCCUAGAGAUGAAGCCUUACUUCUGGCCUCAAGCAAUCCUCCUGCCUCGGCUGCCCAGAGUGUUGGGCUUUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-97.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -102.28
Frequency: 0.0003
Diversity: 79.13
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((((((..((((....(((((((((.((((.(((..((((((...((((((........)))))).((((((..(((.(((.(((....))).))))))..))))))...))).)))..)))...)))).)))))))))..)))))))))).(((((....((((.....))))....))))).................)))))..((((((((.((((((((((....(((.......)))...)))....))))).)).)))).)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
...,{(((((,(({,({(({{,.(((((((((.((((((((..((((((...((((((........)))))).((((((..(((.(((.(((....))).))))))..))))))...))).)))..))).,.))}),)))))))))..})))))}}}}.(((((....((((.....))))....))))).........,,,.....,.)))}}(((,(((...,.,,,||}.}}}.,,,..,,,.,}))}.,}},.{{{{||,...}})))).,})),
Back