Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_UBAP2_0022700
Sequence Length
2933 nt
GC Content
0.4507
GAAUUAAGAGCAGGCUGGGCAACAUAGUGAGGACCUUGUCUCUACAAAAAGUUUAAAAAGUAGCUGGGCAUGAUGGCUUCCAUUUGUAGUCCCAGGUACUUGGGCGGCUGAGGUGGGAGGAUCACUUAUGAUGAUGCUACUGCACUCCAGCCUGGGUGACAGAGUGAGACCUUGGCUCAACAAAAAAGCAAAAACCUGCCUUUUCUUCAAAGCACAAGGAAGAGUGCUUGAAUCUUAGAAUGGCUUUUAAUGAUCAAGAUCCACUUGAGGCCGGGCGCAGUGGCUCAUGCCUGUAAUUCCAGCACUUUGGGAGGCCGAGGUGGACAGAUCACCUGAGAUCAGGAGUUCGAGACCAGGCUGGCCAACAUGGUGAAACCCUGUCUCUACUAAAAAAAAAAAAUACGAAAAUUAGCCAGGCAUGGUAGUGGGUGCCUGUAAUGGCAGUUAGUCGGGAGGCUGAGGCAGGGAGAAUUGCUUGAACCCGGGAGGCAGAGGUUGCAGUGAGCCAAGAUCACACCACUGCAUUCAAGCCUGGGCAACAGAGCGAGACUCUGUCUCAAUAAAACAAAGACCCAUUUGAAUAAAAUUUUUAAUGUUAAAUACUCCCUCCUCCUCAAUUUGGUUAUAUUAUUAUUUUAAGUGAAGUGAGAUAAGUGCUAAGCACAGUACCUGGUGCAAAAUUAAGCAUUAUAUACAUGUUAUUGACUAGAUUGGCAAACCCUUUUUCAUAGGCAAUAUGCAAGUAAGUAAACUAUAUCCAGUUUGUCUUACUUGCAGAUUGAUUUGACUAUACUUUGAUAGUUAAUUAAAAGUGCUUCUUAAAAUCACUCAUUUAUACCCAAGUGCCCUGUUGAUGUUAGGGGACAUAGUGAGGAGAUUUAAGUGUUGCGUUACAUUUUUCAGUAUAAAGUUAGUGUAGUAUUCUGCUGGUAUUAACAGACAGAUAUCUCUGCUACUCAGUGCUUGAUCCUAAAUACACUUACUCUGAUAGGAAUUUAUUCACAAACUGAUCUAGUCCAGUGAUGGAAAAAUUUGGAGGUUUUAGGCUAGGUCCUCCUUUUAUAGUUGAAUUUACUUAGGAAAAAGUUUGCUUAAUGAAUGGUCUUUUUUUUUUUUUUUUUGAGACGGAGUCUGUCGCAGUGGCCAGUCUCGGCUCACUCCAACCUCCACUUCCCGGGUUCAAGUGAUUCUCUUGCCUCAGCCUUCCAAGUAGCUGGGACUACAGGCAGGCAACAUCAUGCCUGCCUAAUUUUUUUUUGUUUCUUCGAGAUGGAGUCUCCUUCUGUCGCCCAGGCUGGAGUGCAAUGGUGCCAUCUCAGUUCACAGCAACCUCCGCCUCCUGGGUUCAAGCGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCUCAAGUAGCUGGGAUUACAGGUGCCUGCCUCCACCUCCAGUUAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACAGGGUUUCACCAUGUUGCCCAGCCUGGUCUCCAACACCUGAGCCCAAGUGACUGCCCCCUUAGCCUUCAAAGGUGCUGUGAUUAUAGGCGUGAGCCACCGCACCUGACCUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGAGACAGUCUCGCUCUGUAGCCCAGUCUAGAGUGCAGUUACUCUAUCUUGGCUCAUUGUAACCUCCGCCUCUGGGGUUCAGGCGAUUCUCCUGUCUUAUCCUCCCCAGCAGCUGGGAUUACAGGCGUGAGCCACCAUGCCCGGCUAACUUUUUUGCAUUUUUAGUAGAGAUGAAGUUUCACCAUGUUGGCCAGGCUGGUCUCAAACUCCUGACCUCAAGUGAUCUGUCCCCCCCUUGAUCUCCCAAGGUGUUGGGAUUACAGGUGUGAGCCACUGCACCUGGCCCUUUUAAAUUUUUUUCUUUUAAACACUAGUAUGCAUUAGGAAAAUUAUUGAUGUUUAUUUAUUCAUUAAUCCUAUUCUGGGAAGUAUUUGCUAAGAAAGUAAUCUUAAAUUGGUGUCAUAAAAAGUGGCUUUAUUUGGCAAUUUUUUUCUUUCUUUUUUUUUUUGAGAUGGAGCCUCGCUCUGUCGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCGCGUUCUCAGCUCAUUGCAACCUCUGCCUCCUGGGUCCAAGCGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCUGGAGUAGCUGGGAUUGCAGGCAUGUAUCACCAUGCCUGGCUAAUUUUUGUAUUUUUGGUAGAGACGGGGUUUCGCCGUGUUGGCCAGGCUGGUUUCAAACUUCUGACCUCAGGUGAUCCGCCCACCUUGGCCUCCCAGAGUGCUGGGAUUAAAGGCAUGAGUUACCACGCCCUGCCGGUAAGAUGUUAAUUACUCAAUUUUAAAUGUCCAGUGUUAUGUUAGAGGUGUUCUGAGAUAACCUAUUCAGGUUGCAUGAUGAAAGAGAGUUUUUUAUUUUUUGAGACGGAGUUUUGCUCUUGUUGUCCAGGCUGGAGUGCAAUGGUGCGAUGUCAGCUCACUGCAACCUCUGCCUCCACCUCGCCUGGCUAAUUUUUUGUAUGUUUGGUAGAGACGGGGUUUCACCAUGUUGGUCAGGCUGGUCUUGAAUUCCUGACUUCAGGUGAUCCACCCAGCUCCGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCGUGAGCCACUGCAGCAGGUGGUGAGAGUUCUUUUGAAUCCGUAUAAACCAGGAUUUUUGUCCUGGGUCUAGCACUUAGUAAUUAGAUGAGUUACUUAAAUCUCCUUUAACCUCUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGAGCUAGAGUCUCACUCUGUUGCCCAGGCUGCAGUGCAGUGGCUUGAUCUCGGCUAACGGCAACUGUGCCUCCUGGGUUCAAGUGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCAGAGUAGCUGGGACUACACUUGUACAUCACCACACCCGGCUAAUUUUAGUAGUUUUAGUAGAGAGGGGUUUCACCAUGUUGGCCAG

Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1263.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1310.30
Frequency: 0.0000
Diversity: 543.43
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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