Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_UBE3A_0004700
Sequence Length
1598 nt
GC Content
0.3892
AUGUGACUUACUUAACAGAAGAGAAGGUAUAUGAAAUUCUUGAAUUAUGUAGAGAAAGAGAGGAUUAUUCCCCUUUAAUCCGUGUUAUUGGAAGAGUUUUUUCUAGUGCUGAGGCAUUGGUACAGAGCUUCCGGAAAGUUAAACAACACACCAAGGAAGAACUGAAAUCUCUUCAAGCAAAAGAUGAAGACAAAGAUGAAGAUGAAAAGGAAAAAGCUGCAUGUUCUGCUGCUGCUAUGGAAGAAGACUCAGAAGCAUCUUCCUCAAGGAUAGGUGAUAGCUCACAGGGAGACAACAAUUUGCAAAAAUUAGGCCCUGAUGAUGUGUCUGUGGAUAUUGAUGCCAUUAGAAGGGUCUACACCAGAUUGCUCUCUAAUGAAAAAAUUGAAACUGCCUUUCUCAAUGCACUUGUAUAUUUGUCACCUAACGUGGAAUGUGACUUGACGUAUCACAAUGUAUACUCUCGAGAUCCUAAUUAUCUGAAUUUGUUCAUUAUCGUAAUGGAGAAUAGAAAUCUCCACAGUCCUGAAUAUCUGGAAAUGGCUUUGCCAUUAUUUUGCAAAGCGAUGAGCAAGCUACCCCUUGCAGCCCAAGGAAAACUGAUCAGACUGUGGUCUAAAUACAAUGCAGACCAGAUUCGGAGAAUGAUGGAGACAUUUCAGCAACUUAUUACUUAUAAAGUCAUAAGCAAUGAAUUUAACAGUCGAAAUCUAGUGAAUGAUGAUGAUGCCAUUGUUGCUGCUUCGAAGUGCUUGAAAAUGGUUUACUAUGCAAAUGUAGUGGGAGGGGAAGUGGACACAAAUCACAAUGAAGAAGAUGAUGAAGAGCCCAUCCCUGAGUCCAGCGAGCUGACACUUCAGGAACUUUUGGGAGAAGAAAGAAGAAACAAGAAAGGUCCUCGAGUGGACCCCCUGGAAACUGAACUUGGUGUUAAAACCCUGGAUUGUCGAAAACCACUUAUCCCUUUUGAAGAGUUUAUUAAUGAACCACUGAAUGAGGUUCUAGAAAUGGAUAAAGAUUAUACUUUUUUCAAAGUAGAAACAGAGAACAAAUUCUCUUUUAUGACAUGUCCCUUUAUAUUGAAUGCUGUCACAAAGAAUUUGGGAUUAUAUUAUGACAAUAGAAUUCGCAUGUACAGUGAACGAAGAAUCACUGUUCUCUACAGCUUAGUUCAAGGACAGCAGUUGAAUCCAUAUUUGAGACUCAAAGUUAGACGUGACCAUAUCAUAGAUGAUGCACUUGUCCGGCUAGAGAUGAUCGCUAUGGAAAAUCCUGCAGACUUGAAGAAGCAGUUGUAUGUGGAAUUUGAAGGAGAACAAGGAGUUGAUGAGGGAGGUGUUUCCAAAGAAUUUUUUCAGCUGGUUGUGGAGGAAAUCUUCAAUCCAGAUAUUGGUAUGUUCACAUACGAUGAAUCUACAAAAUUGUUUUGGUUUAAUCCAUCUUCUUUUGAAACUGAGGGUCAGUUUACUCUGAUUGGCAUAGUACUGGGUCUGGCUAUUUACAAUAACUGUAUACUGGAUGUACAUUUUCCCAUGGUUGUCUACAGGAAGCUAAUGGGGAAAAAAGGAACUUUUCGUGACUUGGGAGACUCUCACCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-391.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -427.32
Frequency: 0.0000
Diversity: 491.37
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((.((...(((.(((...(((((...........)))))......))).))).......((((((........))))))..(((((((..((((((...((((((((((.(.((...((.((((((((((((...(((....)))...))..)))))..........((((((.........))))))(((((..(((((((..........(((.(((.((...))))).))).((((((((..((..(((((((((((((((..(.((((((((((...(((((((((...(((((((.......((((((((..(((((((((..........)))).)))))..))))))))...))))))).))))..........(((((...........)))))...)))))....)))))))))).)((((.((((......)))).)))).......(((((.....((((.....((((...((.(((((((...))))))).))))))..((((((((.((((((..((((((.((((((...))))))..((((((.(((.........)))...(((((.....)))))......(((((.....))))).........)))))))))))))))).)).)).))))))...((((....(((((.((((...)))).)))))...))))....(((..((((.((((.((.((((((.((((.(((.((((.((((((.........((((((.(((.((((((......))))))(((((((((((((.......................((((.......))))....(((((((.(...(((((((((((...((...(((......................(((((......)))))))).))...))))....)))))))...).)))))))........)))))).)))))))......(((((((...(((((.(.....).)))))....))))))).........))).)))))))))))).))))(((((....)))))((((.(((((.((...((((...)))).))))))).))))....))).))))))))))..)).)))).))))..)))(((((((........)))))))..((((((((((..((((((....((((.....((((((..(((..(((..((((.((((((....(((((....))))))))..))).)))).)))....))).)))))).....))))...)))))).)))).......))))))......))))......)))))...)))))))))))))))...))..)))))))).(((((((.(((.....))).))).))))......(((((....)))))((((((((.(((....)))...))))).)))))))))))))))(((((((...))))))).))))))))).).))))))))))...)))).))..)))))))((((((.....))))))(((((((((((((.(((...))))))).))))))))).............)).)))((((.((...)).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.((.((,,.(((.(({...{{{((,..........}))))...,..))).))).,,{,{.((({{{.,,,.,,,)}}}}}..(((((((.,(,((((...((((((((((.(.((.,{({.((({{(((((((...(({....}))...))..)))))..}}},..,,((((((,.{,...{,|||}||{{{({,.{{(((((,..,,,,...(((.(((.,,...})})).}}}.,(((((({,.((..{{{||{||||||((,..{.((((((((({.,,({(((((({...(((((((.......((((((((..(((((((((..........)))),}))))..))))))))...))))))),))))}..|,,....,||{{,,...,.,|,,,,}||||.,}})),,..}))))))))).}((({.{(((......}}}},}}))...,.,,||{,|||,,.||||..|},|||,.,||||{{{{{{{,,.|,,||||{|,,.,,..|||||(((,((((((..,{((({..((.(((((((.{.....,,))))))).))..{({{{.....,||||}....},}}}.....,{{|||}}}},}||||{........,..}}})))})})))),|}.}|,||}}},,}}|{((....(((((.((({...}}}}.)))))..,))),....{{{,,(({{.(({{.{{.{{{({{{{{{{.{{|,||||,{|{||||||,.,|||||||.,.||||{(((((,.....)))))}{((((((({((((......,((,..........|.}|||,......,)})),}}.{{{{{((.{,,,(((({((((((...,((({(((,,,,,,..,......,......(((((......))))),}},|},..}}}}....|}}}}}}...},)}))}}},,.,....))))}}.}))}}}|{,,,,,{((({((...{((((,(,,,..|,|||||,...}}||||}.,,,.....,}}|},}))})))))}.,}}|(((({....}))))}{||.{((((,{(,,{{{,....,|,,.}||||}}.|},|,,,,}}}.))}}}}}}))..}}.)))),)))}..))){((((((........))))))|{{{{((((((({..((((((..,.((((.....((((((..{((..(((..((((.((((,(..,,((((,..,,))))),,}.,))).)))).)))....))).)))))).....)))).,.)))))).,}},}}}}}},.,,))}...,..,))),,,},.}}}}),..)))))))})))))))...)),,)))))))),{|||||{.{{{.....)))}))).))))....,.(((((....)))))|||{{{|{.{{{....}}),,,)))))..}))}))))))))))|||||||,,,))))))).))))))})).).))))))))))...)))).}),.)))))))((((((.....)))))){((((((((((((.(({...))})))),})))))))}..,{{,.,,,}}})).)))((((.({...}).))))
Back