Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_UBE3A_0008100
Sequence Length
275 nt
GC Content
0.4509
AGUUAUUAAGCCUACGCUCAGAUCAAGGUAGCAGCUAGACUGGUGUGACAACCUGUUUUUAAUCAGUGACUCAAAGCUGUGAUCACCCUGAUGUCACCGAAUGGCCACAGCUUGUAAAAGAUCAGGAGAACCUCAGUCUGACGACAUUGAAGCUAGCCGAAUACACAGGAGCCCAUGAAAGGCAUCACGUGUGGAAGGAAGUGACACGAGUCAUAGUCUGCCCUGCUUUUCUACCACCUGAAGCAUCAUAUAAACCUAUAUCUUCUGUUUCAAAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-62.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -67.00
Frequency: 0.0005
Diversity: 50.81
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((....((((..............(((..(((((((((((.((((.((..(((........((.((((((((..(.((....)))..))).))))).))..(((...(((((((...((((.(((....)))..))))....)))....)))).)))...(((((..(((((.......))).))..)))))..)))..)).)))).)))).))).)))))))))))....))....(((((((..(((((....)))))....)))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,......(((....})}.{{{..,((({,(((((((((((.((((.((..(((........((.((((((((..(.((....)),..))).))))).)}.,(((...(((((,,...,{,({(((.,..,})}.,)))}}..,,,...})))).)))...{((((..(((((.......))).))..)))))..)))..)).)))).)))).))).)))),,))))),,,,......(((((((..(((((....)))))....)))))))...
Back