Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_UBE3A_0014300
Sequence Length
249 nt
GC Content
0.4016
AGAUGAAGUUUCACUAUAUUACCCAGCCUGGUCUUGACUCCUGGGCUCAAGUGAUCCUCCUGCCUUGGCGUCCCAAAGUGCUGGGAUUAUAGACAUGAGCCACUGCGUCCAGCCUGUAUCAUAUUUUUAUUCUGAUAUCUUUUGUAAUUUUGUUUUUAGUGAAGUAGGGAGGUUUAUAUUAGAUAAUCUUCCAAGAUUUUCAUAGAUGACAGUUGAGAACUACUCUCAGAUGAGAUUCUUCCAUUGCUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-58.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -63.27
Frequency: 0.0003
Diversity: 31.64
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((.((((((((((((.(.((((((((......(((.((.((((...((.....))...)))).)).)))....)).))))))).)))))...))))..))).))))((((..((((((...........))))))...........(((((.((.((((((...(((((.((((.....)))).))))).....)))))).)).))))).(((((.....)))))((((.((....))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((.((((((((((((.{.(((((((({{....(((.((.((((...{{.....,}...)))).)).)))}}..}).))))))}.)))))...))))..))).))))((((..((((((.{.....,...))))))...........{((((.((.((((((..,(((((,({((.....)))),))))).....)))))).)).))))}.(((((.....))))){(((.((....)))))}))))
Back