Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_UBE3A_0014600
Sequence Length
386 nt
GC Content
0.3238
AUAAUUUCUAUUUCGAUCAUUUCUAUUUCAAUCUCCUCCCUCUCCCCUCCAAAAAAAUUUACUGUGUAAACUGUGAUAAUACACUGUUUCUCUCAGUGUCAGUCAGUGGAAUGAUCCAGAUUUAUAGGUCAUAGCAAAAUUUUUCAUCCCAAGCUCUUGAAAUGAUGUUUCCAAAUGUCCAUUUUCUUAAAUGACUGCUAGUUAUGUUCUCCAAUCAUGUUACACAUAUUUUGUUUAGACUUAUAAUUGUGUAGGUCUAAAUGUAGAAACAUUACAUUAUGUACAUAUGCAGCUGCUGAAAGAAAAUUAGUUUUCUAAUUUUUAGAUCGGGGUGAAGACAAACUUUUAGAAGUGAUCUUUCGGUAAAAUACUGGAUGAAGUCUUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-74.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -82.69
Frequency: 0.0000
Diversity: 108.50
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.....)((((((((((((((((((......................((((........(((((.(.((((.(((......))).))))..).)))))........))))((((((.(......).))))))........((((((((((........(((((((((((....))))).)))))).....((((((...))))))...........((((...)))).....(((((((((((((....)))))))))))))((((...(((((((...))))...)))...)))).....(((((((((....))))))))).....))))))))))........))))))))))).(((((((...))))))).)))))...))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.....)((((((((((((((((((......,,{..,,,.{{.{,,,,,,,........{({((,(,(({(.(((,,...,|||{|,,,....)))))},,{,{,,||||{{{{||,|......,.}}})}|,{{,.....,{((({..{,,.....}}||}|||{{{|.....,,||}{{{{{....}}}))}|||,..|,|||{,......,,,||||,,,})},,...,(((((((((((((....))))))))))))){{{|..|||||||,...}}}}..,}})},,}})),},..(((((((((....))))))))).....)))).))}))........))))))))))).(((((((...))))))).)))),..}))
Back