Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_UBE3D_0004400
Sequence Length
645 nt
GC Content
0.4264
GAAGCUCCUCAGGGUGCUCCCACUGCCGAGUGAGAACUGGGGAGCUCUAGUUGGAGAAUGGUGUUGUCAUCCUGACCCCUUUGCUAAUAAAUCACUUCAUCCGCAAGAGAAUGACUGUUUUAUUGGAGACUCUUUCUUCUUGGUGAAUUUAAGAACCAGUUUGUGGCAGCAAAGACCUGAACUAUCCCCAGUGGAGAUGUGCUGUGUUUCUUCUGACAACCAUUGUAAAUUGGAACCAAAGGCAAAUACCAAAGUAAUUUGUAAGCGUUGCAAGGUAAUGUUGGGAGAGACCGUGUCAUCAGAAACCACCAAGUUUUAUAUGACAGAGAUAAUUAUUCAGUCAUCUGAGAGGAGUUUUCCUAUCAUACCAAGGUCUUGGUUUGUCCAGAGCGUGAUCGCCCAGUGUCUGGUGCAGCUCUCCUCUGCUAGAAGCACUUUUAGAUUCACGAUUCAAGGUCAGGAUGACAAAGUGUAUAUCUUGCUAUGGCUUUUAAAUUCAGACAGUUUGGUGAUUGAAUCUUUGAGAAAUUCCAAAUAUAUCAAAAAAUUCCCCUUGUUGGAAAACACAUUCAAAGCCGAUUCUAGUUCUGCCUGGAGUGCUGUCAAGGUCCUCUACCAGCCAUGCAUCAAAAGCAGGAAUGAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-172.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -185.78
Frequency: 0.0000
Diversity: 144.02
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((((((((..(((((........)))))....)))))))))))(...............((((((((((((((..........................((((((((.((..(((((....))))))).))).)))))((((((((((((....((((.((((((...(((.(((.((((....((.(((.(((.((((.(((((((((((((((((.((((((.............((((((((....)).)))))).....)))))))))..))))))))))))(..((((((..(((((......)))))..))))))..)........((((....)))).((((....))))..((.(((((....))))).))..)).))))..)))..))).))..)))).))).)))...)))))).))))..)))))))))))).......))))))))))))))........(((((((((((((..........((((((.((((..((((((...((.....((((((......................))))))..)).)))))).))))(((((((......)))))))))))))..(((.....)))))))))........)))))))......)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,{(((((((((..,,(((.,{{{...,)))),}..)))))))))))(..,.,,,..,{,...((((((((((((((....,.{,{{{{{{.{{..{{{{.{.,,,|,|{|}||.,|,|||}}}})|||,,,.,}},,}}|,((((((((((((....((((.((((((...{((.(((.{{{{....{|,{((,(({,{((({,((((((((((((((((.((((({.,{{....,....((((((((....)),,)))))....,)))))))))..))))))))))))),.((((((..(((((......)))))..))))))..,.......,{(((....)))}.((((....))))..|{.{((({....))))}.}}.|||{||||...,},,|}}.,,.}))),}))),)))...)))))).))))..)))))))))))).,.....))))))))))))))....},,.||{((({((((((..........((((((.((((..((((((.{{((,....{{{{{{,,....,,,...........,,}})))}..,..}))))).))))|((((((......))))))}))))))..(({.....)))))))))|,......,)))))}......)
Back