Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_VPS13C_0034900

Sequence Length

606 nt

GC Content

0.3630

ACUGCAAAUGAACACUGGACUCCAUGCAUAUUAAAUGAAGCAGACAAAAUUAUAUACAAGCUUAUACGACUUGAUAGUCUUAGCGCCUACUGGAAUGUAAAUUGCAGCAUGUCUUACCAGAGAUCAAGGGAACAGAUUUUGGAUCAGCUGAAAAAUGAAAUUCUUACAAGUGGAAAUAUACCCCCAAAUUAUCAAUACAUUUUCCAGCCAAUAUCAGCCUCUGCAAAACUCUACAUGAAUCCUUAUGCAGAAUCAGAGCUCAAAACGCCCAAACUGGAUUGCAACAUAGAAAUACAAAAUAUUGCCAUUGAACUGACCAAACCUCAGUACUUAAGUAUGAUUGACCUUUUGGAGUCAGUGGAUUAUAUGGUUAGGAAUGCGCCUUAUAGGAAAUACAAGCCUUAUUUACCACUUCAUACCAAUGGUCGACGAUGGUGGAAAUAUGCAAUUGAUUCUGUUCUUGAAGUUCAUAUAAGAAGGUAUACACAGAUGUGGUCAUGGAGUAACAUAAAAAAGCACAGGCAGUUACUCAAGAGUUAUAAAAUUGCCUACAAAAACAAGUUAACACAGUCUAAAGUCUCAGAAGAAAUACAGAAAGAAAUUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-104.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -118.66

Frequency: 0.0000

Diversity: 135.04

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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