Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_VPS35_0004200

Sequence Length

440 nt

GC Content

0.3841

AUUGUUUUGACUGGCAUAUUGGAGCAAGUUGUAAACUGUAGGGAUGCUUUGGCUCAAGAAUAUCUCAUGGAGUGUAUUAUUCAGGUUUUCCCUGAUGAAUUUCACCUCCAGACUUUGAAUCCUUUUCUUCGGGCCUGUGCUGAGUUACACCAGAAUGUAAAUGUGAAGAACAUAAUCAUUGCUUUAAUUGAUAGAUUAGCUUUAUUUGCUCACCGUGAAGAUGGACCUGGAAUCCCAGCGGAUAUUAAACUUUUUGAUAUAUUUUCACAGCAGGUGGCUACAGUGAUACAGUCUAGACAAGACAUGCCUUCAGAGGAUGUUGUAUCUUUACAAGUCUCUCUGAUUAAUCUUGCCAUGAAAUGUUACCCUGAUCGUGUGGACUAUGUUGAUAAAGUUCUAGAAACAACAGUGGAGAUAUUCAAUAAGCUCAACCUUGAACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-95.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -106.42

Frequency: 0.0000

Diversity: 130.86

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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