Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_XPO1_0000400
Sequence Length
2865 nt
GC Content
0.3696
AUACUGAAACAAGAAUGGCCCAAACAUUGGCCAACUUUUAUCAGUGAUAUUGUUGGAGCAAGUAGGACCAGCGAAAGUCUCUGUCAAAAUAAUAUGGUGAUUCUUAAACUCUUGAGUGAAGAAGUAUUUGAUUUCUCUAGUGGACAGAUAACCCAAGUCAAAUCUAAGCAUUUAAAAGACAGCAUGUGCAAUGAAUUCUCACAGAUAUUUCAACUGUGUCAGUUUGUAAUGGAAAAUUCUCAAAAUGCUCCACUUGUACAUGCAACCUUGGAAACAUUGCUCAGAUUUCUGAACUGGAUUCCCCUGGGAUAUAUUUUUGAGACCAAAUUAAUCAGCACAUUGAUUUAUAAGUUCCUGAAUGUUCCAAUGUUUCGAAAUGUCUCUCUGAAGUGCCUCACUGAGAUUGCUGGUGUGAGUGUAAGCCAAUAUGAAGAACAAUUUGUAACACUAUUUACUCUGACAAUGAUGCAACUAAAGCAGAUGCUUCCUUUAAAUACCAAUAUUCGACUUGCGUACUCAAAUGGAAAAGAUGAUGAACAGAACUUCAUUCAAAAUCUCAGUUUGUUUCUCUGCACCUUUCUUAAGGAACAUGAUCAACUUAUAGAAAAAAGAUUAAAUCUCAGGGAAACUCUUAUGGAGGCCCUUCAUUAUAUGUUGUUGGUAUCUGAAGUAGAAGAAACUGAAAUCUUUAAAAUUUGUCUUGAAUACUGGAAUCAUUUGGCUGCUGAACUCUAUAGAGAGAGUCCAUUCUCUACAUCUGCCUCUCCGUUGCUUUCUGGAAGUCAACAUUUUGAUGUUCCUCCCAGGAGACAGCUAUAUUUGCCCAUGUUAUUCAAGGUCCGUUUAUUAAUGGUUAGUCGAAUGGCUAAACCAGAGGAAGUAUUGGUUGUAGAGAAUGAUCAAGGAGAAGUUGUGAGAGAAUUCAUGAAGGAUACAGAUUCCAUAAAUUUGUAUAAGAAUAUGAGGGAAACAUUGGUUUAUCUUACUCAUCUGGAUUAUGUAGAUACAGAAAGAAUAAUGACAGAGAAGCUUCACAAUCAAGUGAAUGGUACAGAGUGGUCAUGGAAAAAUUUGAAUACAUUGUGUUGGGCAAUAGGCUCCAUUAGUGGAGCAAUGCAUGAAGAGGACGAAAAACGAUUUCUUGUUACUGUUAUAAAGGAUCUAUUAGGAUUAUGUGAACAGAAAAGAGGCAAAGAUAAUAAAGCUAUUAUUGCAUCAAAUAUCAUGUACAUAGUAGGUCAAUACCCACGUUUUUUGAGAGCUCACUGGAAAUUUCUGAAGACUGUAGUUAACAAGCUGUUCGAAUUCAUGCAUGAGACCCAUGAUGGAGUCCAGGAUAUGGCUUGUGAUACUUUCAUUAAAAUAGCCCAAAAAUGCCGCAGGCAUUUCGUUCAGGUUCAGGUUGGAGAAGUGAUGCCAUUUAUUGAUGAAAUUUUGAACAACAUUAACACUAUUAUUUGUGAUCUUCAGCCUCAACAGGUUCAUACGUUUUAUGAAGCUGUGGGGUACAUGAUUGGUGCACAAACAGAUCAAACAGUACAAGAACACUUGAUAGAAAAGUACAUGUUACUCCCUAAUCAAGUGUGGGAUAGUAUAAUCCAGCAGGCAACCAAAAAUGUGGAUAUACUGAAAGAUCCUGAAACAGUCAAGCAGCUUGGUAGCAUUUUGAAAACAAAUGUGAGAGCCUGCAAAGCUGUUGGACACCCCUUUGUAAUUCAGCUUGGAAGAAUUUAUUUAGAUAUGCUUAAUGUAUACAAGUGCCUCAGUGAAAAUAUUUCUGCAGCUAUCCAAGCUAAUGGUGAAAUGGUUACAAAGCAACCAUUGAUUAGAAGUAUGCGAACUGUAAAAAGGGAAACUUUAAAGUUAAUAUCUGGUUGGGUGAGCCGAUCCAAUGAUCCACAGAUGGUCGCUGAAAAUUUUGUUCCCCCUCUGUUGGAUGCAGUUCUCAUUGAUUAUCAGAGAAAUGUCCCAGCUGCUAGAGAACCAGAAGUGCUUAGUACUAUGGCCAUAAUUGUCAACAAGUUAGGGGGACAUAUAACAGCUGAAAUACCUCAAAUAUUUGAUGCUGUUUUUGAAUGCACAUUGAAUAUGAUAAAUAAGGACUUUGAAGAAUAUCCUGAACAUAGAACGAACUUUUUCUUACUACUUCAGGCUGUCAAUUCUCAUUGUUUCCCAGCAUUCCUUGCUAUUCCACCUACACAGUUUAAACUUGUUUUGGAUUCCAUCAUUUGGGCUUUCAAACAUACUAUGAGGAAUGUCGCAGAUACGGGCUUACAGAUACUUUUUACACUCUUACAAAAUGUUGCACAAGAAGAAGCUGCAGCUCAGAGUUUUUAUCAAACUUAUUUUUGUGAUAUUCUCCAGCAUAUCUUUUCUGUUGUGACAGACACUUCACAUACUGCUGGUUUAACAAUGCAUGCAUCAAUUCUUGCAUAUAUGUUUAAUUUGGUUGAAGAAGGAAAAAUAAGUACAUCAUUAAAUCCUGGAAAUCCAGUUAACAACCAAAUCUUUCUUCAGGAAUAUGUGGCUAAUCUCCUUAAGUCGGCCUUCCCUCACCUACAAGAUGCUCAAGUAAAGCUCUUUGUGACAGGGCUUUUCAGCUUAAAUCAAGAUAUUCCUGCUUUCAAGGAACAUUUAAGAGAUUUCCUAGUUCAAAUAAAGGAAUUUGCAGGUGAAGACACUUCUGAUUUGUUUUUGGAAGAGAGAGAAAUAGCCCUACGGCAGGCUGAUGAAGAGAAACAUAAACGUCAAAUGUCUGUCCCUGGCAUCUUUAAUCCACAUGAGAUUCCAGAAGAAAUGUGUGAUUAAAAUCCAAAUUCAUGCUGUUUUUUUUCUCUGCAACUCGUUAGCAGAGGAAAACAGCAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-702.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -764.09
Frequency: 0.0000
Diversity: 795.64
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((...(((..(((((........))))).)))...))))))...(((((((..(.....)..))))))).((((.((((.........)))).))))(((((....)))))...((((((.....))))))((((.(((((((((..(((..((((((((.(((((((..(((...((((((((((((((((..(((((.........)))))..)))))))..((((..(((.....)))..))))..)))))))))...)))..)))...)))).)))))..)))..))).......((((((((............((((((((......))))))))............))))))))((((((....((((.((((((((((((.(((((.((.((((...(((.((.(((((....((((((......))))))......))))).)).))).....))))))...((((((...(((((((.((((((((((((.(.(((......))).).)))...((((((((..(..((((((...............(((((((((....(((((((((............)))).)))))..((((...)))))))))))))....))))))..).))))))))....))))))))).((((.(((........(((((((((.((((...(((((((..(.(((((..(((((..((((((((((......))))).(((((((((((.((((((((..((((.(((((((.((..(((((....))))).)).))))))).)))).........((.((.....)).)).(((((....)))))((((((....))))))...)))))......))).)))))))))))...(((((((....((.(.(..((((.(((((((((((((((.....)))))))))..........((((((((.((..............((((..((.....))..)))).(((((..((((((.((((.(((((......)))))...(((((.(((.(((..........))).))).)))))((((((....((((((((((.(((..(.(((((((((..(((((...........((((((((((........(((((((((....(((((((........((.((((.((((.......)))).)))).)).....)))))))..))))))))).........((((((.((((..((....))..)))).))))))..))).))))))).)))))...)))))))))..)..)))))))))))))((((......))))(((.....)))........)))))).((((((...))))))((((((..(((((((.((((((((((....))))).((((((.............))))))(((........)))..)))))((((((.(((.((((((.....)))))).)))))))))...(((((.((......)).)))))............(((((((((((...((((.....))))..)).)))))))))(((((((((((.((((.((............)))))))))))).....)))))......(((.((((((((.(((((((((((....)))).))).....)))).)))))))).)))..((((((..(((((.........)))))(((((.(.(((((.....)))))))))))...((((....(((((((((.((((.....))))((((((....((....)).....))))))...)))))))))....))))...))))))...((((((((((..(((((((((((((......)))))))......))))))...((((.......(((((((((((((((((..(((.(((((..(((...)))))))).))).)))))....))))..(((..(((((...))))).)))...(((((.......))))))))))))).....))))(((......))).((((((((((.(((........)))))))))))))..........)))))))))).....)))))))...))))))..............))))...))))))))))))).))))))))((((.....))))..((((...(((.(((....))))))..)))).((((.....)))).....(((((((......(((((((((((((...(((((..(((...((((((........(((...)))........))))))))).))))).((((((.....))))))...)))))))))))))((((((..........(((((((........))))).))))))))...........(((((........))))).))))))).(((((((((..((.(............).))........((((....))))....)))))))))...)))))).)))).).).))...))))))).....((((((...((((....((((.(((.......))))))).)))).))))))..))))).....)))))..))))).)..)))))))...)))).)))))))))))).))))..))))))))))))).))))).).))))))..((((.(((((.....))))).))))((((........)))).....))))).))))))))))....)))))))))))))....((((((((((((...............))))).)))))))..........(((((((((...((((((((.........)))))))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,(((((...(((..(((((........))))).))).,.)))))|,{{((((((({,(,.{{,(,,|,,|,{|,{({,{((((((.{{,{{{{{{,(({,....{{{{{{{.((((((((((((((((({{{((((((({({,,,,,,...(({.,((((((((.(((((((..(((...((((((((((((((((..(((((.........)))))..))))))}..((((..(((.....)))..)))).,)))))))))...)))..)))...)))).))))),.})},|}||{{{{{.,,|||||.,.{{((({.,,,|||{{{{,((((((({.(((((({....{((({(({{{..,{{{{{{|||,..{(({({(((({..,(((((((((..(((((.{({.(((((.(((((((((({{{{{......}}}}},.{{{.,{{{.((((,((({(..(((((((,.....{(((((((((((.........(((((((((.{(,,....(((((((,,{(((((((((......}))))),......(((((({,((({(((({.{{((,,..|||}......{,{{{|,||,||,,...{(({...}))}.{(((...((((...}))).)))).|,.,,}}.},}),}})}.,,},.,)})))},))))))).}}}}}}........{((((((((((((....,..((((((.......,..,{{({({{{.....})))),.....,..,{{{{,..{..,,,,(({((,{((,,,..,})),))}),.,}})))),)))))).......))).),})))))))})))))))....,,,)}.)))))))))........))))))))))))))))))).....},.)),.,}}}}})),))}}}}}..{(((((....(((((((((.....))))))))).....)))))}.....,))))))))))}}}))||,((((.{((,{...,,..,,,.....,}}}}..}}}},,..,,}}}))))).)))))..))))))))).)).)))}))).....))))}.)).)))))}}|,,.....((((((....}))))).(((((((((..(((({.........,,((({{{,((({{.,....(((((,,,,}}}}|,|{|||}}}}..,.||,{{{,.,{{{......,|||||||||,|,.....,,))))).,))))))|},.......{,((((((.((((..((....))..)))).)))))),}}||||,,},)),)))))...)))))))))((({(((((((((((((((((((({.((((,{(((,....}})},,....})))...(((((((...))))))).{{{{{{{,{{(((((((((({(((....}}}},.||||||......,,,.,..}}}},.(((........}}|.}|}}}}||||{.((((.((((((.....)))))).))))|||||,,.{(|({|((......},.,)))}....,}||....(((((((((((...((((.....))))..)),})))))))){(((((((((,{((({.((............))))))))))))}....})))),.,.,.(((.{(((((((.(((((,((((,....,,,,,}}}})},.)))).}))))))).))).,,,,.,,,,,....{(((((((.......,,,,.{.(((((.....))))),,,},{{..(((.{{.....}},)))..)),.))))))))|||||||.{{(({{{.,.....}))))))...,,.,|||.,,.(((((((.....((((((({((((((((..,{{{{{((((({{...,,,)))))}},{,({,,,,,})}}}((((.......(((((((((((((((((..(((.{((((..{{{...}))))))}.))).)))))....))))..(((..(((((...))))).)))...{{{((,......}}}}})))))))).....)))){((......}}}.((((((((((.(((........))))))))))))),,........))))))))}{,{({.((((((..(((,{.(({....))),,.))).)))))).))),..........)))))))((((.....))))...........})}}}}}..,},)))))))))))))))))..}))).)))).....,,}}}.)}}}|||((({{,,....||||...)))))))))))}.))))).........((((({,........},)))))),.,||||||..,,,}}}}}}...}}}})))}},,},||||||}}}......}|}|,}||}}}}.}}})},},..})))))}}}}|||||||.(((((........))))).,,},,,,,||{{{{(((.,||,{,,...............,,,..,,||((....)))),,..}}}}}}}}}.{((({{{.|{||{{{{||{....((((.{{..((((((((.((.,,,,.{{{((((.(((.......))))))},)))..(((((({(({..{{{,,,{..,{{{.(((((.......))))).)))).,}...,{((((..(((({,.,{(.(((({.{.(((((....)))))).))))).))))))))..}),)})))}.))))))..)).)))))))).},)))).........,,...,||||}}}}.,,))}}}.,{{{{,||||||....}}}}.}}}}}})}}}|.|||},,,,,},,.....((((((((,,,{((((((((.........)))))))))))))))))
Back