Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_XPO1_0001100
Sequence Length
2844 nt
GC Content
0.3942
GAGAAUCUCUUGAACCCAGGAGGCGGAGGUUGCAGUCAGCUGAGAUUGCGCCACUGCACUACAGCCUGGGUGACAGAGUGAGACUGUUUAAAAAGAAAAAAGAGAUAAAAGAUACGUUAAGUGGACACAUUUACACGGUAACUUAAAUUUUUUUGUAAUCUGUAGUGGUGAUUUCAAAUUAAAAACAAAAGUGAUAGUAGUAGUCUUAUGGUAAUAAUGGUUUAGAUGAGUUCUCUAUUAAAAAGGUUGUCUUUCUCCUUCAAUUUGAUAACUCAUGUGCGUAACGGGACAGUUUCAUUUUCCGUGAGAGGUGGAUUGUAUUUUACUUGGGUUUACCUUUCAGGAGGCAUUCUAUCUUCUGUGGUUUAUUGAAAACUCCAAAUAUUUAUACUGGAUUAAGCCUUGCUUUUCCCCUCCUGUCUAGCACAACAAAGACACUGAAACAUUAUUUUGUUUCCACCACUUAUUUUUAGGACUUUGAAGAAUAUCCUGAACAUAGAACGAACUUUUUCUUACUACUUCAGGCUGUCAAUUCUCAUUGUUUCCCAGCAUUCCUUGCUAUUCCACCUACACAGUUUAAACUUGUUUUGGAUUCCAUCAUUUGGGCUUUCAAACAUACUAUGAGGAAUGUCGCAGAUACGGGCUUACAGAUACUUUUUACACUCUUACAAAAUGUUGCACAAGAAGAAGCUGCAGCUCAGAGUUUUUAUCAAACUUAUUUUUGUGAUAUUCUCCAGCAUAUCUUUUCUGUUGUGACAGACACUUCACAUACUGCUGGUUUAACAAUGCAUGCAUCAAUUCUUGCAUAUAUGUUUAAUUUGGUUGAAGAAGGAAAAAUAAGUACAUCAUUAAAUCCUGGAAAUCCAGUUAACAACCAAAUCUUUCUUCAGGAAUAUGUGGCUAAUCUCCUUAAGUCGGCCUUCCCUCACCUACAAGAUGCUCAAGUAAAGCUCUUUGUGACAGGGCUUUUCAGCUUAAAUCAAGAUAUUCCUGCUUUCAAGGAACAUUUAAGAGAUUUCCUAGUUCAAAUAAAGGUAUGUAUUUAUUUGCUCUUGCAGAAAUAUUAGGGGUAGAUGUGACCACUUUUAUGUUACAUUGUAGAAUUUUUAUCACUUGAUUUGUCAUGCCAAAUAAAUGGGGUUUCAAGAUAAUACGUUUACACAAUCUCUGUAAUCAAAAAACCUGAGACUGGUAAUACAGUGAAAAACUAAAGUCCAAUAAGGAUAGAUAUGUUUGAGAUGUUAUUCGGAUAAACUUAUUACUAAUGUAAUUCAUUUUAGGUAGUCUUAAAUGUAUAAUGGAAUAUUGGGUAAGAAAAACGUUGGUAGUUCUUUUUAUAAUUUUAUACCAAUUUUGUUAGUUGAGGGAACUUGUGAAAGUUACUAGAUAGAAUGUCUUUCUUCUGCUGUUAUACAGUGCUUUAUUCAUACUUUUGGGAAGGGUUUUUCUUUGAACAUCUUGCUUUAAAGAAAUUUGGAAGUACUGUGAAACCCUAAGUAGUUGAUGAAUAGUUUAUCCAUGAUUGUUGAAUAAGAAUUAGUCUCUUAGCUCUUAAAUAUUUUCUCCAAAAUACAAAGGUUUUUUUUUUUUACUGUAAAAAUAUUAGCCAAUUUUUAAAAAACUAAUGAAAGUUACCUAGGCUGGGCGCAGUUGCUCAUGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCAAGGUGGGUGGGUCACCUGAUGUCGGGAGUUUGAGACUAGCACGGCCAACAUGGUGAAACCCCCGUCUCUACUAAUAAUACAAAAAUUAGCCAGGCGUGGUGGCGCACAGCUGUAUUCGCAGCUACUUGAGAGGCUGAGGCAAGAGAAUUGCUUGAACCCACGAGGCAAAGGUUGCGGUGAGCCGAGAUCACGUCAUUGCACUCCAACCUGGGUGACAAGAGUGAAACUUCAUCUCAAAAAAAAAAAAAAAAAGUUAACUGAUAGCUACGAAGUCAAUGAUAAUAUAACUAAACUUAAUUUAAUGACAGUUAUUAAUUAGCCUUAGGAGAAACAUCUUUCUUGGUAUCUUGGCAUAUGAAGAAUUUUUAGCUGGGCACAGUGGCUCACACCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCGAGGCAGACAGAUCAGUUGAGGUCAGGAGUUCAGGAUCAGCCCGGCCAACAUGGUGAAACCUCAUCUCUACUAAAAAUACAAAAAUUAGCCAGGUCUGGUGGCAGGUGCCUGUAGUCCCAGCUACUCGGGAGGCAGAGGCAGGAGAAUCACUUGAACCCAGGAGGCAGAGGUUUCAGUGAGCUGAGAUCAUAACACUGCACGCCAGCCUGGGCGACAGAGCAAGACUGCCUCUCAAAAGAAAAGAGAAAAAAGUGUCUGGGUGCAGUGGCUCAUGCCUGUAAUCCUAGCACUUUGGGAGGCCGAGACAGGUGGAUUGUCUGAGCUUGGGAGUUUGAGAUCAGCCUGGGCAACAUGGUGAAACUACGUCUCUAGUAAAAAUACAAAAAAUGAGCCAGAUGUGGUGGUGCCUGUAAUCCCAGCUGCUGGGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUUGCUUGCAUCUUGGAGGAAGAGGUUGAGAUAAUGUGCUGGGGCUACAGAACAAGACUCUAUCACAAAGAGAACAAAAUUUGUGUGAAUACAUAGUAGGUGUAUAUACUUAGGGGAUGGGAUGCAUGAGAUACUUCGGUAGAAGCAUACAAUGCAUAAUAAUCACAUUGAAGACUAUUUACUGUAAGGUAUCACACCAUUUUUUUUGUUUUUUUUGGGGGGGCACAGUCUCGCUUUUAUCACCCAGGCUGGAGAGCAGUGGCGUGAUCUUGGCUCACUGCAACCUCCGCCAUGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-831.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -883.76
Frequency: 0.0000
Diversity: 756.57
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((...)))(((....((...(((((((((((((((.((((((((((((((((((((.((.((((((((((((.(((((((((((((......(((..((((((((..(((.(((((((((((....)))))).)).))).)))..))))))))....)))......((..(((((((..(((((((((((.(((.((.(((.(((((((((((..((((((((((.(((((((((((......(((((((...............)))))))..(((((...((((((.........(((((.(((((((((((((............))))))))))))))))))............((.(((((.....))))).))............(((..((((...)))).)))..))))))...)))))...(((.....((((((......)))))).....)))...(((((((..((....))..))))))).)))))..))))))..))).....((((..((((.....((((((.((.(((((...(((((((.(((..(((((((..........(((((((((...((((.....))))..................(((((((((((((...(((((..(((...((((((........(((...)))........))))))))).))))).((((((.....))))))...)))))))))))))(((((((((..(((((((....)))))..(((((......(((((.((((..(((.(((((........))))).)))..)))).))))))))))...........................((((....))))....(((((...(((((((((((((...((((((...((((((....(((((((((((((((....((((.(((.......))))))).))))..(((((....)))))......((((.(((((.......))))).))))...((((((((.(((((..((((((((..((...((((((((((((.........))))))))))))..)).))))))))........(((((.......(((.((((((((((.((((......(((((((((((...........((((.((.((((................)))).))))))((((((((((((..((((.((.....(((.(((.((((((((((.((((...(((((((((((((((((((((..((((((.((.((........)).)).)))))))))))))..((((((.(((((..((((..(((((((((.(((....(((((.....)))))...))).)))))))))..)))).....))))).))))))((((((((.(((((((((((.......((((.((.((((((((......)))).)))).))..)))).......))))))))))).)))....))))).)))))...)))))))))..(((((.(........).)))))...))))))))))))))))).)))..........))))))..))))))))))))....((((((...............))))))...(((((((((((((((.((((..((....))))))...)))))((((((((....)))))))).(((.((((((..(((((.((.....(((((.......((((...)))).........)))))..(((((.........))))))).))))))))))).)))((((((....)))))).((((.(.((.(.((((((.....)))))).).))).)))).....((.((((((((..((......))))))))))..))..)))))))))).....)))))))))))....................(((((.((((((((.....((((.(((...................))).)))))))))))).)))))....(((......)))(((((.((((......)))).)))))......((((((.((((((.....)).))))...))))))...((((....)))))))))))))))))).)))((((.((.(((.......))))))))).....(((((....))))))))))..................(((((.((((((((((.(((((....((((........)))).....))))).........((((....)))).......((((((((....))))))))......)))).)))))))))))((......))......(((((((((...............((((.(((((((((..(((....)))))))..))))))))))))))))))..((((((.....))))))))))).)))))))).....((((.((((..(((.((((..(((((((((...((.................)).)))))))))..)))))))...))))))))..)))))))))))...))))))...)).)))))))))))))))))))))).))..))))))))).....))))))))).((((.......)))).........(((((....))))))))))))...)))..)))))))))))).)))))))).....)))).))))....(((((...........))))).)))))))))))))))))))))...)).))).))))))))))))))))))..)))))))))))))))..)))))))))))).)).)))))))))))))))))))).))))))))))))))).)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((...)))(((....{{...(((((((((((((((.((((((((((((((((((((.({.((((((((((((.(((((((((((((...........{(((((((..(((.(((((((((((....)))))).))},)).)))..)))))))|,,..{({{{{{{,{{{.,,,,,,,..,,{(((({{{{{((({(({(({(((((,({{{{,.,{{{{{{,,.({(((((.{{,{{,...{(((..{.......)))}...,..)),)))))}|((((...((((((..,.......{{((.(((((((((((((,{,.........))))))))))))))))||,,....,,,,..|{,||{,{..,,.}}}}}.}}............(((..((((...)))).)))..))))))...)))),...,||,,..,((((((......)))))).,,,.,||,,.{{{{(((,.{(,..,||..}||||||.,|||,..|||,,..}))},,))},|||,,||||,...,|||||,,||,|(((({{(((((((,,{.{{{{((({{{..,{.....,{|(((((((((.((((.....))))..}}}}}}},......,.(((((((((((((...(((((..(((...((((((.,,.....,,....,)}.,...)))))).,.))).))))).((((((.....))))))...)))))))))))))(((((({{{....,,{(({{{{|,,},..,,||}}}.},}}}}}|.,.{({,{((.(((((........))))).)))))),)).}}))),},})}})}}...............,,.....((((....))))....(((((...(((((((((((((...((((((...((((((....(((((((((((.....,,,{{({.(((...,.,,||||||,.}},..,|||||,,..}))}}......{(((.(((((.......))))).))))...((((((((.(((((,.((((({{{..,{.,,|{((((((((((........,})))))))}|||{{||.}}}}}}}}}}},,,,,{{{{{....,,,{{{{((({((((((.{{({......{{(((((((({.,.........{(((.((.((((.{,.........,,..)))).})))}}{(((((((((({..{,,({((.....|||}{((.((((((((((.((((...(((((((({,{((,(((((((..((((({.((.((........)).)).})))))))))))),,{(((({.(((((.,(({{..{{{{{{{{{.,,{.,.,{{{{{.....))))).|{}||,||}}}})))}.}))|,,,,.}}))),)}||},((((((((.(((((((((((.......((((.((.((((((((......)))).)))).))..)))).......))))))))))).)))....)))))..}},}}..))))))))).,(((({,{.....,.|}.}}}}}...)))))))))))))),|}|}||..........}}}}}},.})))))))))))....{{{{{{....,,,,,......}},,},...((((((((((,((((.(((({.((,{{{{{((|...,{{{{.((((((((....)))))))}{(,({|(((((((.,(((({.((({...})))..,.)))},,.)}.))))}..))))}||||,..(((((.........))))).}}||||||||{||.|{{((((((....)))))).((((.(.((.(.((((((.....)))))).).))).)))){{{,..,,}||,|||,}}}|...,,,}))}})))),}.))}.})))))))))..{{{{||..||))),}}}.................(((((.((((((((.....((((.(((...................))).)))))))))))).))))).,|.|{(||....,,}|((((.((((......)))).)))),......((((((.((((((.....))}})))...))))))..,||||,.{{|||,|||,}}},||||,,,|||(,{,.,,.,||},.}}}}.)))))))).....{{{{|..,.))))),}}}},................,(((((.(((((((((({(((((.{..((((........)))).,,,.)))),..,,..{{|((|(,||||}}}.,.,.}.|||||{||,,,.))}}}}}}....,.)))).)))))))))))||,,,,},}),,,.,.((((((((,..............{((((.(((((((((..(((....))))))}..)))))))))))))))))).,((((((.....))))))))))).)))))))).,,..((({{((((..(((.((((..(((((((((...{{.................},.)))))))))..)))))))...)))))))),,)))))))))))...))))))...))},))))))))))))))))))))).,,..,,))))))))}}}}))))))}}}.((((.,{.(({((({{{{{{{{..|(((({,.{{{{{{|||||||.......,|||}||||,,,|{||||,,,|,.{{{|,,,.)))).}}.,.})))}}....}}}.),}}}}}})}))))))))))..,))))))))).,...,))))))))))))))}})}}),)))))))))))))..)))))))))))).}).)))))))))))))))))))).))))))))))))))).}})))
Back