Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_XPO1_0004300
Sequence Length
1567 nt
GC Content
0.3720
GUCCGUUUAUUAAUGGUUAGUCGAAUGGCUAAACCAGAGGAAGUAUUGGUUGUAGAGAAUGAUCAAGGAGAAGUUGUGAGAGAAUUCAUGAAGGAUACAGAUUCCAUAAAUUUGUAUAAGAAUAUGAGGGAAACAUUGGUUUAUCUUACUCAUCUGGAUUAUGUAGAUACAGAAAGAAUAAUGACAGAGAAGCUUCACAAUCAAGUGAAUGGUACAGAGUGGUCAUGGAAAAAUUUGAAUACAUUGUGUUGGGCAAUAGGCUCCAUUAGUGGAGCAAUGCAUGAAGAGGACGAAAAACGAUUUCUUGUUACUGUUAUAAAGGAUCUAUUAGGAUUAUGUGAACAGAAAAGAGGCAAAGAUAAUAAAGCUAUUAUUGCAUCAAAUAUCAUGUACAUAGUAGGUCAAUACCCACGUUUUUUGAGAGCUCACUGGAAAUUUCUGAAGACUGUAGUUAACAAGCUGUUCGAAUUCAUGCAUGAGACCCAUGAUGGAGUCCAGGAUAUGGCUUGUGAUACUUUCAUUAAAAUAGCCCAAAAAUGCCGCAGGCAUUUCGUUCAGGUUCAGGUUGGAGAAGUGAUGCCAUUUAUUGAUGAAAUUUUGAACAACAUUAACACUAUUAUUUGUGAUCUUCAGCCUCAACAGGUUCAUACGUUUUAUGAAGCUGUGGGGUACAUGAUUGGUGCACAAACAGAUCAAACAGUACAAGAACACUUGAUAGAAAAGUACAUGUUACUCCCUAAUCAAGUGUGGGAUAGUAUAAUCCAGCAGGCAACCAAAAAUGUGGAUAUACUGAAAGAUCCUGAAACAGUCAAGCAGCUUGGUAGCAUUUUGAAAACAAAUGUGAGAGCCUGCAAAGCUGUUGGACACCCCUUUGUAAUUCAGCUUGGAAGAAUUUAUUUAGAUAUGCUUAAUGUAUACAAGUGCCUCAGUGAAAAUAUUUCUGCAGCUAUCCAAGCUAAUGGUGAAAUGGUUACAAAGCAACCAUUGAUUAGAAGUAUGCGAACUGUAAAAAGGGAAACUUUAAAGUUAAUAUCUGGUUGGGUGAGCCGAUCCAAUGAUCCACAGAUGGUCGCUGAAAAUUUUGUUCCCCCUCUGUUGGAUGCAGUUCUCAUUGAUUAUCAGAGAAAUGUCCCAGCUGCUAGAGAACCAGAAGUGCUUAGUACUAUGGCCAUAAUUGUCAACAAGUUAGGGGGACAUAUAACAGCUGAAAUACCUCAAAUAUUUGAUGCUGUUUUUGAAUGCACAUUGAAUAUGAUAAAUAAGGACUUUGAAGAAUAUCCUGAACAUAGAACGAACUUUUUCUUACUACUUCAGGCUGUCAAUUCUCAUUGUUUCCCAGCAUUCCUUGCUAUUCCACCUACACAGUUUAAACUUGUUUUGGAUUCCAUCAUUUGGGCUUUCAAACAUACUAUGAGGAAUGUCGCAGAUACGGGCUUACAGAUACUUUUUACACUCUUACAAAAUGUUGCACAAGAAGAAGCUGCAGCUCAGAGUUUUUAUCAAACUUAUUUUUGUGAUAUUCUCCAGCAUAUCUUUUCUGUUGUGACAGACACUUCACAUACUGCUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-384.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -416.76
Frequency: 0.0000
Diversity: 362.59
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((((....)))))((((((....)))))).((((((.((((((((..(((((.(((((..(((((((..(((..........(((((....(((((((((.....))))))))).....)))))((((((((.((..............((((..((.....))..)))).(((((..((((((.((((.(((((......)))))...(((((.(((.(((..........))).))).)))))((((((....((((((((((.(((..(.(((((((((..(((((...........((((((((((........(((((((((....(((((((........((.((((.((((.......)))).)))).)).....)))))))..))))))))).........((((((.((((..((....))..)))).))))))..))).))))))).)))))...)))))))))..)..)))))))))))))((((......))))(((.....)))........)))))).((((((...))))))((((((..(((((((.((((((((((....))))).((((((.............))))))(((........)))..)))))((((((.(((.((((((.....)))))).)))))))))...(((((.((......)).)))))............(((((((((((...((((.....))))..)).)))))))))(((((((((((.((((.((............)))))))))))).....)))))......(((.((((((((.(((((((((((....)))).))).....)))).)))))))).)))..((((((..(((((.........)))))(((((.(.(((((.....)))))))))))...((((....(((((((((.((((.....))))((((((....((....)).....))))))...)))))))))....))))...))))))...((((((((((..(((((((((((((......)))))))......))))))...((((.......(((((((((((((((((..(((.(((((..(((...)))))))).))).)))))....))))..(((..(((((...))))).)))...(((((.......))))))))))))).....))))(((......))).((((((((((.(((........)))))))))))))..........)))))))))).....)))))))...))))))..............))))...))))))))))))).))))))))))).))))))).)))))...)))))))))....)))).))))))..((((.....))))..................(((((((((((((...(((((..(((...((((((........(((...)))........))))))))).))))).((((((.....))))))...))))))))))))))(((((..........(((((((........))))).)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.(((((....)))))((((((....)))))).((((((.(((({(((,.(((((.(((((..(((((({..{((({{{,....,|||||....(((((((((.....))))))))).....,}}}}((((((((.((|..,.,||,.,,..((((.,,{...,,))}.})),.|{{{{..((((((.{,{{,(((((......))))}.,.|{{{({(((,(,{.{{,,,,,..}}}.}}}.}}}}}{(((((....((((((((({.(((..{.(((((((((..(((({.........,,((({{{,((({{.,....(((((,,,,}}}}|,|{|||}}}}..,.||,{{{,.,{{{......,|||||||||,|,.....,,))))).,))))))|},.......{,((((((.((((..((....))..)))).)))))),},||||,,},)),)))))...)))))))))..}..)))))))))))))((((....,.}|}|(((.....))),.......))))},,((((((...))))))|{((((,,((((((({(((((({(((....||||,.,{{|||.............)}}}},(((........))).})))))||(((,{(((.((((((.....)))))).)))))))||,,.(({((,((......}}.}))))....,,,,....(((((((((((...((((.....))))..)),}))))))))((((((((((,{((((.((............))))))))))))}....}))))......(((.{(((((({.(((({,((((,....,,,..,})})},.)))).}))))))}.)))..((((((.,..,,,{(((((((.......,,,,.,.(((((.....))))),,}}}{{..(((.{{.....}},)))..}},.)))))))){{{(((,.,,((,{,.},....}))))))...}}..|||.,....}}}},,.})))))...((((((((((..{{{{{{((((({{...,,,)))))}}{{.{{,..,,)))}}((((.......(((((((((((((((((..(((.(((((..{({...})}))))}.))).)))))....))))..(((..(((((...))))).)))...{{{((.......)}}}})))))))).....)))){({......})}.((((((((((.(((........))))))))))))),,,.......)))))))))).....))))))).,.}}}))},.,,,}))}.,}}}))))...))))))}}}}))).)))))))),}}.})))))).)))))...)))))))))....)))).))))))..{(((.....)))}...||,.........,},(((((((((((((...(((((..(((...((((((.,,.....,,.....)}.,...})))))...))).))))).((((((.....))))))...))))))))))))))(((((,,.......,({(((({..,.....}))}),),)))))
Back