Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_XPO1_0004700
Sequence Length
2686 nt
GC Content
0.3690
CAAAGAAUGGCUCAAGAAGUACUGACACAUUUAAAGGAGCAUCCUGAUGCUUGGACAAGAGUCGACACAAUUUUGGAAUUUUCUCAGAAUAUGAAUACGAAAUACUAUGGACUACAAAUUUUGGAAAAUGUGAUAAAAACAAGGUGGAAGAUUCUUCCAAGGAACCAGUGCGAAGGAAUAAAAAAAUACGUUGUUGGCCUCAUUAUCAAGACGUCAUCUGACCCAACUUGUGUAGAGAAAGAAAAGGUGUAUAUCGGAAAAUUAAAUAUGAUCCUUGUUCAGAUACUGAAACAAGAAUGGCCCAAACAUUGGCCAACUUUUAUCAGUGAUAUUGUUGGAGCAAGUAGGACCAGCGAAAGUCUCUGUCAAAAUAAUAUGGUGAUUCUUAAACUCUUGAGUGAAGAAGUAUUUGAUUUCUCUAGUGGACAGAUAACCCAAGUCAAAUCUAAGCAUUUAAAAGACAGCAUGUGCAAUGAAUUCUCACAGAUAUUUCAACUGUGUCAGUUUGUAAUGGAAAAUUCUCAAAAUGCUCCACUUGUACAUGCAACCUUGGAAACAUUGCUCAGAUUUCUGAACUGGAUUCCCCUGGGAUAUAUUUUUGAGACCAAAUUAAUCAGCACAUUGAUUUAUAAGUUCCUGAAUGUUCCAAUGUUUCGAAAUGUCUCUCUGAAGUGCCUCACUGAGAUUGCUGGUGUGAGUGUAAGCCAAUAUGAAGAACAAUUUGUAACACUAUUUACUCUGACAAUGAUGCAACUAAAGCAGAUGCUUCCUUUAAAUACCAAUAUUCGACUUGCGUACUCAAAUGGAAAAGAUGAUGAACAGAACUUCAUUCAAAAUCUCAGUUUGUUUCUCUGCACCUUUCUUAAGGAACAUGAUCAACUUAUAGAAAAAAGAUUAAAUCUCAGGGAAACUCUUAUGGAGGCCCUUCAUUAUAUGUUGUUGGUAUCUGAAGUAGAAGAAACUGAAAUCUUUAAAAUUUGUCUUGAAUACUGGAAUCAUUUGGCUGCUGAACUCUAUAGAGAGAGUCCAUUCUCUACAUCUGCCUCUCCGUUGCUUUCUGGAAGUCAACAUUUUGAUGUUCCUCCCAGGAGACAGCUAUAUUUGCCCAUGUUAUUCAAGGUCCGUUUAUUAAUGGUUAGUCGAAUGGCUAAACCAGAGGAAGUAUUGGUUGUAGAGAAUGAUCAAGGAGAAGUUGUGAGAGAAUUCAUGAAGGAUACAGAUUCCAUAAAUUUGUAUAAGAAUAUGAGGGAAACAUUGGUUUAUCUUACUCAUCUGGAUUAUGUAGAUACAGAAAGAAUAAUGACAGAGAAGCUUCACAAUCAAGUGAAUGGUACAGAGUGGUCAUGGAAAAAUUUGAAUACAUUGUGUUGGGCAAUAGGCUCCAUUAGUGGAGCAAUGCAUGAAGAGGACGAAAAACGAUUUCUUGUUACUGUUAUAAAGGAUCUAUUAGGAUUAUGUGAACAGAAAAGAGGCAAAGAUAAUAAAGCUAUUAUUGCAUCAAAUAUCAUGUACAUAGUAGGUCAAUACCCACGUUUUUUGAGAGCUCACUGGAAAUUUCUGAAGACUGUAGUUAACAAGCUGUUCGAAUUCAUGCAUGAGACCCAUGAUGGAGUCCAGGAUAUGGCUUGUGAUACUUUCAUUAAAAUAGCCCAAAAAUGCCGCAGGCAUUUCGUUCAGGUUCAGGUUGGAGAAGUGAUGCCAUUUAUUGAUGAAAUUUUGAACAACAUUAACACUAUUAUUUGUGAUCUUCAGCCUCAACAGGUUCAUACGUUUUAUGAAGCUGUGGGGUACAUGAUUGGUGCACAAACAGAUCAAACAGUACAAGAACACUUGAUAGAAAAGUACAUGUUACUCCCUAAUCAAGUGUGGGAUAGUAUAAUCCAGCAGGCAACCAAAAAUGUGGAUAUACUGAAAGAUCCUGAAACAGUCAAGCAGCUUGGUAGCAUUUUGAAAACAAAUGUGAGAGCCUGCAAAGCUGUUGGACACCCCUUUGUAAUUCAGCUUGGAAGAAUUUAUUUAGAUAUGCUUAAUGUAUACAAGUGCCUCAGUGAAAAUAUUUCUGCAGCUAUCCAAGCUAAUGGUGAAAUGGUUACAAAGCAACCAUUGAUUAGAAGUAUGCGAACUGUAAAAAGGGAAACUUUAAAGUUAAUAUCUGGUUGGGUGAGCCGAUCCAAUGAUCCACAGAUGGUCGCUGAAAAUUUUGUUCCCCCUCUGUUGGAUGCAGUUCUCAUUGAUUAUCAGAGAAAUGUCCCAGCUGCUAGAGAACCAGAAGUGCUUAGUACUAUGGCCAUAAUUGUCAACAAGUUAGGGGGACAUAUAACAGCUGAAAUACCUCAAAUAUUUGAUGCUGUUUUUGAAUGCACAUUGAAUAUGAUAAAUAAGGACUUUGAAGAAUAUCCUGAACAUAGAACGAACUUUUUCUUACUACUUCAGGCUGUCAAUUCUCAUUGUUUCCCAGCAUUCCUUGCUAUUCCACCUACACAGUUUAAACUUGUUUUGGAUUCCAUCAUUUGGGCUUUCAAACAUACUAUGAGGAAUGUCGCAGAUACGGGCUUACAGAUACUUUUUACACUCUUACAAAAUGUUGCACAAGAAGAAGCUGCAGCUCAGAGUUUUUAUCAAACUUAUUUUUGUGAUAUUCUCCAGCAUAUCUUUUCUGUUGUGACAGACACUUCACAUACUGCUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-642.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -698.19
Frequency: 0.0000
Diversity: 732.56
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(...(((((..(((........)))..)))))...).((((..(((.(.((((((..((((((..(((..(((((..((((((.((((((.((.....................)).))))))))))))....))))).....)))...)))))))))))).)..))).((.((.((.............)).)).))(((.....((((..(((....)))....))))....)))..(((((((((((((((((.((((.(((........(((((((((...))).))))))..(((((........)))))..((((..(((.(((.(((((((..(.....)..)))))))..))).)))..)))).....((((((.....(((((((.(((((((((((((((((..(((((((((((.........(((..((((((((.(((((((..(((...((((((((((((((((..(((((.........)))))..)))))))..((((..(((.....)))..))))..)))))))))...)))..)))...)))).)))))..)))..)))......(((((((((.(((((((........((((((......(((.(((((((..((((((((...(((((((((((((((.((((((...((((((((((..(((((.(((.(((((.(((((((((((((((......)))))...........((((.(((((..(((((((......((((((((((((.........(((((((((.((......(((((((((((((((((((......)))))).......(((((((.(...(((((.((((....))))......((((((.((((......((((...)))).((((...((((...)))).))))......))))..)))))).......)))))).))))))).))))))........(((((((((((((........(((.(.((.......((((((........)))))))).).))).....((((.(((((((.((..(((((....))))).)).))))))).)))).........))).).)))))))))))))))).......)).)))))))))........)))))))))))))))))))..................))))).))))..((((((....(((((((((.....))))))))).....))))))......)))))))))))))))((.((((.(((((...............)))))..))))))....)))))))).)))))..))))))))).)).))).......)))))).))))))..((((((....((((((((((.(((..(.(((((((((..(((((...........((((((((((........(((((((((....(((((((........((.((((.((((.......)))).)))).)).....)))))))..))))))))).........((((((.((((..((....))..)))).))))))..))).))))))).)))))...)))))))))..)..)))))))))))))((((......))))(((.....)))........))))))(((((((...)))))))))))))))..)((((((((((((((....))))).((((((.............))))))(((........)))..)))))))))..((((.((((((.....)))))).))))(((((...(((((.((......)).)))))............(((((((((((...((((.....))))..)).)))))))))(((((((((((.((((.((............)))))))))))).....)))))......(((.((((((((.(((((((((((....)))).))).....)))).)))))))).)))))))).)))))).)))(((((((..............(((((.....))))).....((..(((.((.....)).)))..))..)))))))(((((((....((....)).....))))))).........(((.((((((((....(((((..(((..(((...(((((((((((((......)))))))......))))))...)))..))).....)))))((......)).)))))))).)))))))))))))))).))))))))))))))))))))(((..(((((...))))).)))...(((((.......)))))((((((((....(((((((((.........((((((((((.(((........)))))))))))))........((((..((....))..))))......((((........))))......)))).)))))..........)))))))).(((((((((.....((((...(((.(((....))))))..)))).((((.....))))................))))))))).((........))...)))))))))))).))))).........(((((((........).))))))..)))))))))))))...))).)))).))))))........)))))))))))(((((((........))))).)))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(...({{((,.(((.,..,,.,||}..}}}}}...|,({{{,|||{.{.((((((..((((((..(((..(((((..((((((.((((((.((....{.........,,,....)).))))))))))))....}}))}.....)))...)))))))))))).,..})},||.,{.,...........,{{||,||{|,.{{....,||{|,,||{..,,))}}}}.)})},}|||,|..(((((((((((((((((.((((.{{,...,,,,.(((((((((...)))}}}))))..(((((........)))))..{{((..(((.(((.(((((((..(.....)..)))))))..))).)))..}}}}......{,{(({....(((((((.((((((((((((((((({{(((((((((({.........(((.,((((((((.(((((((..(((...((((((((((((((((..(((((.........)))))..))))))}..((((..(((.....)))..)))).,)))))))))...)))..)))...)))).)))))..))).,))),,{{{.,,|||||,,.,,{(((,...||,,,.,,((({{{{{,||||{{{...,{{(({({{{{..,{{{{{{{{{|,,{{({({(((({..,(((((((((..(((((.{{{.(((((.(((((((({({{{{{......}}}}},.{{{.,{{{.((((,(({{(..(((((((,.....{(((((((((((.........{((((((((.{(,,....(((((((,,{(((((((((......}))))),....,.{((((({,((({(((({.{{((,,..|||}......{,{{{|,||,||,,...{(({...}))},|(((...((((...}))).)})),|,.,,}}.},}),}})}.,,},.,)})))},))))))).,}}}},........{((((((((((((....{..((((((.....,,,..,{{{{({{|....,})))),,....,..{{{{{,.,{.,,,,{(({((,{(({,,..,}))}))}),.}}})))),)))))).......))).),})))))))})))))))....,,,)}.))))))))),.......))))))))))))))))))).....},.)),.,}}}}})),))}}}}}..{(((((....(((((((((.....))))))))).....)))))}.....}))))))))))}}}))||,((((.{((,{...,,..,,,.....,},}}..}}}}},..,,}}}))))).)))))..))))))))).)).)))}}}}...,,))))},)),))}}||||{,....,((((((....|))))}.(((((((((..(((({.........,,((({{{,((({{.,....(((((,,,,}}}}|,|{|||}}}}..,.||,{{{,.,{{{......,|||||||||,|,.....,,))))).,))))))|},.......{,((((((.((((..((....))..)))).)))))),}}||||,,},}),)))))...))))))))){{{{{|{{|{||||||{((((({{,.{{{{,{(((.....}})}.,....}))),,.(((((((...))))))),|||||||.,|(((((((({({(((,...}}}},.||||||......,,,,,..},,},.(((........}}}.}|}}}}||||{.((((.((((((.....)))))).))))|||||,,.{(|({|((......}}.,)))}....,}},....(((((((((((...((((.....))))..)),})))))))){(((((((((,{((({.((............))))))))))))}....}))))......(((.{(((((((.(((({,((((,....,,,,,}}}})},.)))).}))))))).))).,,}},,}}},....{(((((((.,.....,,,,.{.(((((.....))))),,,}}{{..(((.{{.....}},)))..)),.))))))))|||||||.{{(({{{.,,....}))))))...,,.,|||,|,.{((((({.....((((((({((((((((..,{{{{{((((({{...,,,)))))}},{,({{,,,,})}}}((((.......(((((((((((((((((..(((.{((((..{{{...}))))))}.))).)))))....))))..(((..(((((...))))).)))...{{{((,......}}}}})))))))).....))))(((......}}}.((((((((((.(((........))))))))))))),,........))))))))}{,{{{.((((((..(((,{.(({....))),,.))).)))))).))),..........)))))))((((.....))))...,,,.....}}||}},..}}}))))})))))))))}}}..}))).}))),....}}}}}.))))))){{(,{......,})}...)))))))))))).))))).........(((((({........}.))))))..)))))))..))))...})).)))).))))))........))))))))))){,(((((........))))).,})))),
Back