Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_XPO1_0006600
Sequence Length
486 nt
GC Content
0.3786
AAUGUGGAUAUACUGAAAGAUCCUGAAACAGUCAAGCAGCUUGGUAGCAUUUUGAAAACAAAUGUGAGAGCCUGCAAAGCUGUUGGACACCCCUUUGUAAUUCAGCUUGGAAGAAUUUAUUUAGAUAUGCUUAAUGUAUACAAGUGCCUCAGUGAAAAUAUUUCUGCAGCUAUCCAAGCUAAUGGUGAAAUGGUUACAAAGCAACCAUUGAUUAGAAGUAUGCGAACUGUAAAAAGGGAAACUUUAAAGUUAAUAUCUGGUUGGGUGAGCCGAUCCAAUGAUCCACAGAUGGUCGCUGAAAAUUUUGUUCCCCCUCUGUUGGAUGCAGUUCUCAUUGAUUAUCAGAGAAAUGUCCCAGCUGCUAGAGAACCAGAAGUGCUUAGUACUAUGGCCAUAAUUGUCAACAAGUUAGGGGGACAUAUAACAGCUGAAAUACCUCAAAUAUUUGAUGCUGUUUUUGAAUGCACAUUGAAUAUGAUAAAUAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-108.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -119.21
Frequency: 0.0000
Diversity: 134.09
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.((.............(((...)))((.(((((((.((..(((((((..........((((((((.(((.((((((....(((......)))....)))))).............(((((((...((((......((((.(((((((....(((((((((.((((.....))))((((((....((....)).....))))))...)))))))))....))))......)))..))))....)))))))))))(((((((......))))))).(((((((((.((..((..........))...)).)))).))))))))))))))))...........))))))))).))))))).))...(((..(((((...))))).))).......((((..(.......)..))))...(((((((.(((((.......))))).).)))))).....)).))))))...(((.....)))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((.((...,,,.......{{....}}}{{.(((((((,((..(((((((,.........(((((((,{(((.((((((....(((......}))....))))))............,{{({(((((,,...}|}},.,|||,{{{((((....(((((((({.{(((.....)))}{{((((,...((,,..}}...,}))))))...)))))))))....)))).....})),..|}}},..})),.}}}}}}|(((((((......))))))).{((((((((.((..((.{,.......}}.,,}}.))))}}))))))))))))))),,....,,,,,))))))),)}))))))).)}...(((..(((((...))))).))),,.,{,{({,,..{.,,,,,,)},)}}}...{((((((.(((((.......))))).).)))))}.....)).))))))...{{{.....}},..
Back