Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_XPO1_0014900

Sequence Length

655 nt

GC Content

0.3664

CAUGUGCAAUGAAUUCUCACAGAUAUUUCAACUGUGUCAGUUUGUAAUGGAAAAUUCUCAAAAUGCUCCACUUGUACAUGCAACCUUGGAAACAUUGCUCAGAUUUCUGAACUGGAUUCCCCUGGGAUAUAUUUUUGAGACCAAAUUAAUCAGCACAUUGAUUUAUAAGUUCCUGAAUGUUCCAAUGUUUCGAAAUGUCUCUCUGAAGUGCCUCACUGAGAUUGCUGGUGUGAGUGUAAGCCAAUAUGAAGAACAAUUUGUAACACUAUUUACUCUGACAAUGAUGCAACUAAAGCAGAUGCUUCCUUUAAAUACCAAUAUUCGACUUGCGUACUCAAAUGGAAAAGAUGAUGAACAGAACUUCAUUCAAAAUCUCAGUUUGUUUCUCUGCACCUUUCUUAAGGAACAUGAUCAACUUAUAGAAAAAAGAUUAAAUCUCAGGGAAACUCUUAUGGAGGCCCUUCAUUAUAUGUUGUUGGUAUCUGAAGUAGAAGAAACUGAAAUCUUUAAAAUUUGUCUUGAAUACUGGAAUCAUUUGGCUGCUGAACUCUAUAGAGAGAGUCCAUUCUCUACAUCUGCCUCUCCGUUGCUUUCUGGAAGUCAACAUUUUGAUGUUCCUCCCAGGAGACAGCUAUAUUUGCCCAUGUUAUUCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-130.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -145.16

Frequency: 0.0000

Diversity: 235.79

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((((((((((..(((((.........)))))..)))))))..((((..(((.....)))..))))..))))))))(....((((((((((.((.(((((....(((.(((((((..((.(((......))).))...((((((((......))))))))...(((..((((((((((((.((((.(((...(((((..(((......)))..)))))(((...(((.((.(((((....((((((......))))))......))))).)).))).....)))..((((((((...(((((((((.((((((((((((.(.(((......))).).)))...((((((((..(..((((((...............(((((((((....(((((((((............)))).)))))..((((...)))))))))))))....))))))..).))))))))....))))))))).)))))..))))...)))....))))).........))))))).))))).)))))))..)))...(((....))).)))))))))).....))))).......((((.(((((((.((..(((((....))))).)).))))))).)))).......))..))))).))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((((({(((((..(((((.........)))))..)))))}}..((((..(((.....}))..)))}.,))))))))(....(({(((((((,(,{(((....}}}}.{{{,..{{,|{{{(({.....,{{{{|{,,,,,,,.{((((,....}))))},,,.||||||{||||||{{||,||||||{|,.,{{{{{..((({{.{,,|||{,|||||{((,,{(((,((,(({((,,,.{(((({......}}))}}......}}))).}},|||,..,.|||.....,{({{..}|{(((((({.{(((((({,..,...|||.||,..,,}}}}})}...{(((((((.....,|||||,,...,}}},,},..(((((((((..,,(({{{{{||,...........}))}.})}},..{{{{...}))})))))))))....}}}))),,.}))))}}},..,.}}}}|||}|,|}}}}..}}))|.,)))....,,,,.....,,,,,,}})}}}.})}},,))))))),,,..},}}},,.,|{(((({{....,})))),,,}}.},.,,,,.||{|,,{{{,(({(({{((,,,.,,})),)),)),)))))}),)))}......,)}.,)))}}.}})}))