Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_XPO1_0015400

Sequence Length

447 nt

GC Content

0.3691

UGCCUCACUGAGAUUGCUGGUGUGAGUGUAAGCCAAUAUGAAGAACAAUUUGUAACACUAUUUACUCUGACAAUGAUGCAACUAAAGCAGAUGCUUCCUUUAAAUACCAAUAUUCGACUUGCGUACUCAAAUGGAAAAGAUGAUGAACAGAACUUCAUUCAAAAUCUCAGUUUGUUUCUCUGCACCUUUCUUAAGGAACAUGAUCAACUUAUAGAAAAAAGAUUAAAUCUCAGGGAAACUCUUAUGGAGGCCCUUCAUUAUAUGUUGUUGGUAUCUGAAGUAGAAGAAACUGAAAUCUUUAAAAUUUGUCUUGAAUACUGGAAUCAUUUGGCUGCUGAACUCUAUAGAGAGAGUCCAUUCUCUACAUCUGCCUCUCCGUUGCUUUCUGGAAGUCAACAUUUUGAUGUUCCUCCCAGGAGACAGCUAUAUUUGCCCAUGUUAUUCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-84.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -93.88

Frequency: 0.0000

Diversity: 105.52

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((...))((..(((.(((((.(((((((((((((((.((((..............((.((((((....(((((..............(((...(((((((((.((((((((((((.(.(((......))).).)))...((((((((..(..((((((...............(((((((((....(((((((((............)))).)))))..((((...)))))))))))))....))))))..).))))))))....))))))))).)))))..))))...))).............))))).)))))).))...))))))))))...........((((((........)))))).............((((.(((((((.((..(((((....))))).)).))))))).)))))))))))))))).)).)))..))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((...))((,,({{.(((((.(((((((((((((((.((((....,....,{{{.,,.,,,|||,...(((({....,........,(((...(((((((((.(((((((((,,{.,.{({,,,...}},,},})}...((((((((..{..{{||||......,........(((((((((..,,(({{{{{||,...........}}}}.}))}}..{({{...}))})))))))))....}}))))..,,)))))}}}....))))))))).)))))..))))...)))....,,,,.....))))).,}},,,.}}...)))))))))),,.,.......{{{(((({,.....})))),..,,.},......((((.(((((((.((..(((((....))))).)).))))))).)))))))))))))))).)).})),.))