Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_XPO1_0018100
Sequence Length
516 nt
GC Content
0.3585
AUACUGAAACAAGAAUGGCCCAAACAUUGGCCAACUUUUAUCAGUGAUAUUGUUGGAGCAAGUAGGACCAGCGAAAGUCUCUGUCAAAAUAAUAUGGUGAUUCUUAAACUCUUGAGUGAAGAAGUAUUUGAUUUCUCUAGUGGACAGAUAACCCAAGUCAAAUCUAAGCAUUUAAAAGACAGCAUGUGCAAUGAAUUCUCACAGAUAUUUCAACUGUGUCAGUUUGUAAUGGAAAAUUCUCAAAAUGCUCCACUUGUACAUGCAACCUUGGAAACAUUGCUCAGAUUUCUGAACUGGAUUCCCCUGGGAUAUAUUUUUGAGACCAAAUUAAUCAGCACAUUGAUUUAUAAGGUACAGUGAAUACAUUUCAGUUAUUUGUCACCGGAUAGCCACAUAUAUUCUUUUCACAUGUAAAGCUCUCAUCUCUGCAUUCUAAACCUUAUUCAACCUUGUUUCUAACACGAGGACGCUGCUCAGGAGAAAUUUCCCAUAUUCACACCUAGUAAAUUAUUUAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-106.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -116.91
Frequency: 0.0000
Diversity: 67.49
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((.........(((((........)))))..((((..(((.(((.(((((((..(.....)..)))))))..))).)))..)))).(((((((.((........(((((((((((((((((((.((.....(((.(((.((((((((((((..((((((((.(((((((..(((...((((((((((((((((..(((((.........)))))..)))))))..((((..(((.....)))..))))..)))))))))...)))..)))...)))).)))))..)))..))).......((((((.((((((((..(((..((.(((((......))))).))..))).))).))))).)))))))))))))))))).)))......)).))))).)))))..(((((.((.......)).)))))................((((((.......)))))).....))))))))).....)))))))))......)))))...........
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((.....,,..(((((........)))))..||{{..(((.(((.(((((((..(.....)..)))))))..))).)))..}}},.(((((((.((........(((((((((((((((((((.((.,,,.(((.(({{((((((((((((.,((((((((.(((((((..(((...((((((((((((((((..(((((.........)))))..))))))}..((((..(((.....)))..)))).,)))))))))...)))..)))...)))).)))))..))).,))).......((((((.(((((,{{..(((..{{.(((((,....,))))).}}..))).}},.))))).)))))))))))))))))).))).|,.,,,},))}))}))},,..(((((.((.......)).)))))................((((((.......)))))).....))))))))).....)))))))))......}}))}...........
Back