Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_XPO1_0019600
Sequence Length
1396 nt
GC Content
0.3732
GCUAGAGUGUGGUGGUGCAUCUCGGCUUACUGCAAACUCCGUCUCCUGGGUUCAAGCAGUUCUCCUGCCUCAGCUUCCCAAGUAGCUGGGAUUACAGGUGCCCGCCUCCAUGCCUGGCUGAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACGGGGUUUUGCCAUGUUGGCCAGGCUGGUCUGGAACUCCUGACCUCAAGUGAUUCGCCCACCUCGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGUGUGAGCCACCACGCUCGGCCCAUUCUGUCUUUAUAGCAUUAUUUUUAUAAAGUUAAGAUAAUGUGAAGUGAGCUUUUACUGAGUUAUUCAGAAGACCCUACUUGGGAAGAAAAGAAAAUCACAUUCACUUGAACUUAAUCCUACUUGCUUAAAAAGUUUUGACAUCAAGAUACUGAACUGUAUCACGUUUUAGGACCAUAAAAUCCUAAUAGUGGAUGCGUUUAAAUAAUAGGUUAGCAUACUUUAUAAAUGUUAGUAGAAUAGGAAAGUCUUCCUGGUGUAUAAACUAAACACUAGAAAAGUUGAAUGGACCAUAAUAAUUUAUGUAAUUAUCAAAUAGCUAAGUAAUUUCAGCUUUUGUUACUUGCUUUUACUAUCUCAGUUUUCUGUAAUUAAAGUCUCUAAAGUAUUCAUUAAAAUAUUUGUAAUAACAUGGUUGAAGUAAAAUAACUUGUAGGAAGUUUUUGAUAAUACCAAAACUUGAUAGGCAGCUUCAAUUUUUUUUCUUUAUUUUCAGUAAUCUAUGCCAGCAAUUAUGACAAUGUUAGCAGACCAUGCAGCUCGUCAGCUGCUUGAUUUCAGCCAAAAACUGGAUAUCAACUUAUUAGAUAAUGUGGUGAAUUGCUUAUACCAUGGAGAAGGAGCCCAGCAAAGAAUGGCUCAAGAAGUACUGACACAUUUAAAGGAGCAUCCUGAUGCUUGGACAAGAGUCGACACAAUUUUGGAAUUUUCUCAGAAUAUGAAUACGAAAUACUAUGGACUACAAAUUUUGGAAAAUGUGAUAAAAACAAGGUGGAAGAUUCUUCCAAGGAACCAGUGCGAAGGAAUAAAAAAAUACGUUGUUGGCCUCAUUAUCAAGACGUCAUCUGACCCAACUUGUGUAGAGAAAGAAAAGGUGUAUAUCGGAAAAUUAAAUAUGAUCCUUGUUCAGAUACUGAAACAAGAAUGGCCCAAACAUUGGCCAACUUUUAUCAGUGAUAUUGUUGGAGCAAGUAGGACCAGCGAAAGUCUCUGUCAAAAUAAUAUGGUGAUUCUUAAACUCUUGAGUGAAGAAGUAUUUGAUUUCUCUAGUGGACAGAUAACCCAAGUCAAAUCUAAGCAUUUAAAAGACAGCAUGUGCAAUGAAUUCUCACAGAUAUUUCAACUGUGUCAGUUUGUAAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-342.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -372.32
Frequency: 0.0000
Diversity: 342.86
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.((((((((((((((((((.((((.((.((((((((((((((..........((((.....))))(((((((........)))))))....(((((............)))))(((((...........))))).))))))))).)))))...)).)))).....((((.((....)).))))...........(((......))).(((((......)))))....))))))..)))))))))))))))(........((((((((........))))))))(((((.....(((((((((..((((.((((.....))))....(((.....)))......))))..)))).))))).....)))))((((((((((((.....((((((....)))))).((((((((((((((...((((((........))))))..)).))))))........((((((((...(((((((...((((((......((((((....))))))((((.........))))(((((((.((((((((..(((((....)))))............(((.(((((((..........))))))))))....)))).)))))))))))...............(((((((......)))))))....))))))...)))))))...))))))))...(((((((.(......).)))))))((((.(((.(((.....((((((((((((....(((......(((.((((..........)))).)))......((((((....))))))((((((((((.......))))).))))).......(((((((.(((.(((.((((((.((.........(((((...........))))).....((((((...((((...((((...))))))))((((((..((((((..(((..(((((..((((((.((((((.((.....................)).))))))))))))....))))).....)))...))))))))))))....))))))...)).))))........)).))).))).))))))).....(((....)))...)))...))))))))))))))).))).))))(((..((.....))..)))..)))))).((((((...(((..(((((........))))).)))...)))))).........)))))))))))).(((.((...)).)))........(((((.((..((((......(((((((....((.((((((((.......(((.........)))))))))))))...))))))))))))).)))))...(((((((..(((((.........)))))..)))))))...)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.((((((((((((((((((.((((.((.((((((((((((((,{(({.....((((.....)))){{{{{{{.,,,,...}}}))))....{((({,...|||.....,}}})||||,.....,.....}})),.)))))))))))))))...)).)))).{{{,((((.((....)).))))....{{{....||,|||.,.})},(((((......)))))....))))))..)))))))))))))))((((.((((((((...((((((((((.{.....,,)))))))))},{{{{{{.,{({{.(((({...,)))).,|,{{{.,,,,|||......,||,..||||.|||,|{{,,.,,...((((((((((((.....((((((....)))))).,(((((.(((((((...((((((........))))))..))})))))))}}}....((((((((...(((((((...((((((.,{,{,{(((({....})))|(((((.,.......))))}||((((,((((({{{,,(((((....)))))....,,,..,,.{{{.{{{{{{{,,,,,,,,,,}}}}}}}}}},|,.}}||.,|||,,,,))).......,,,.....||{{{{{......}})))))....))))))...)))))))...))))))))...,{{(((((({{{{{{{{..,,||((({({{{{,{|,|,,{((((((((((({{...,,{{..{{{{((,.(((((({{{.{{{.||||.|,,......((((((....)))))){(((((((((.......))))).))))}.......||||,||},||,|||}}|}.....}}}}},....(((((,{........}))))).....((((((...{{{{...((((...))))},|,((((((..((((((..(((..(((((..((((((.((((((.((....(.........,,.....)).))))))))))))....))))).....)))...))))))))))))....))))))...}},,..,,,,.,,..)}.))),))),,,,})))}}}..(((....)))...,}},,.)))))))))))}}}))))).))))}}}},,|,........},{((((((((...)))|,})))}..(((((........))))).|},.,.||}}}},,...,,,.)))))))))))).{{{.{,..,}},|||{{.........|||}||}||||..,{{{{{,|||,}}},||,{|{{{|{{|,.,,..,{|,,,,,...}}})))),}}}))}...},,,,,)))))))).))).,,.({(((((..(((((.........)))))..)))))))...)
Back