Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_XPO1_0023900
Sequence Length
677 nt
GC Content
0.3796
AUAUGAUUAUACUAGUUUAUCAACACUGUAGUUACAUUUGUUACAGACAAAAUUAAUUUAAAAAAUUUUUGUUUCUUUCUUUCUUCUUUGUUGAGACAGAUUCUCACUCUGUUCCUCAGGCUGGAGUGCAUUGGCACCAUCACUGCAGCUUCAAAUAGCUGCGGUCAAGCAAUCCUCCCACCUCAGCCUCCCGAGUAGCUGGGAACAUAGGCAUGCCCCACCAUGCCCUACUAAAUUUUUUUUUUUUUUAAUGUUUUGUAGGGAUGGUGUCUCGCUGUGUUGCCCAUGCUGCUGGCUGCUGGGCUUGAGCAAUCCUCCCACCUUGGCCUGCCAGAGUGCUGGGAUUGUAAGCAUGAGCCACCAUACUUAGUCAACAUGAUUACCUUUUUAAUUUUAACUGGGAGGCUUCUCUAACCUAAAGAUUUAUUUCACAAAAUACACUAGAACUUCUGAACAUUAAUUUUCCUUCAUCUUUAAGUAACUUUGGUAUUGGAAAUUACAUAAAUUAAUUUAAAACAUUUUAUUUCCUUUUUCUGUAAGUGUCCUGUCUUUUAAAGGUAUUCGCUUUGCUUUUUGCUGUAGCUAUACCCUUUGUCCAACUACCAUAGCAUAUAUAUUUGUUCACCUGGGGUGCAUAUUGUGCGUUUCCUUUGUACCGAUUACUACUAAAUAUUAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-160.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -174.79
Frequency: 0.0000
Diversity: 179.80
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.((((..(((((...(((...((((((((((........((((((((..............)))))))).................(((((((((.......)))))..))))((..(((.(((.(((........(((((((((......))))))))))))))).)))..)).....((((((((((((((((((((((((((....(...((((((.((((((.((((................)))).)))))))))))).)...))))))).)))).))))))((..(((.(((((..((((((((..(((.((((....)))).)))..)))))))))))).).)))..)).....((((((...))))))................)))))))))......((((((((((......(((.........((((...)))).........(((((...(((.............)))...)))))(((((.(((......((((....)))).......))).))))))))....))))))...)))).........((.....))))))))))))....)))...)))))..)))))))))(((((((.........((((((................)))))).........)))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({{({(({,..||{{|.,,{,,...{{{(({{{,,,{{{{{,,||||||{{..........,{{{|,,||||{............,,,{,{({((((((.......))))}.,||||((..((({(((.{{{||......{((((((((......)))))))))}}}})}.,}),,},.,,..(((((((({(((((((((((((((((.{..(...((((((.((((((.{(((.,,..........}}.)))}.)))))))))))).}..}))))))).)))).))))))((,,{{{.{((((..((((((((..(((.((((....)))).)))..)))))))))))).,.))),.}}.....((((({...})))))................})))))))).........,{{|||,.....,....,},,,....|||,...,,)}},}..,},}},.....|},||||,||,...,((((((,((({{{,,,,.,{,......{,,.,,{,||||,..........,)}))}}},...,.....{{{{(((((..(((..((.....)).,.))).)))}},}))},,,}),}}}}},||||,,.,,,..||},,,||,},))||||....}}},},,,,,..})))))}},.,,},,}},,,,,...}
Back