Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_XPO1_0024500
Sequence Length
2723 nt
GC Content
0.3511
GAAGAAAAGGGGUGUCUUCCUGUGCAACUGACACAGCUAGGCUUUGACGGCAGGCCUCCACAAGGUCUACCCUUUUGAUUCCCUUUAACUGAAUUCUGUUCAUCAAUUGUUUUUGUUUCAUGGGCGGUGGGAGGGGAAAGGGGAAUUCAAUGCAUAAAAUAAGUAUUUCUAAGGGCUCAGUAGAAAUUUCUACCAUAGGGAUCAUUUCAUGCAUUUAUUUUUUCAUUUAGUCUUUGCUGUUAUCUGUCCCUCAUCUUCAUAACUCAGCAGUGGAUUUCUCAAGUUUGGAGAUGUAAGGCAAAAGUAUAAUUCUUCAGAAUGUUUGGAUUGUAGUGAUUUAUCAUUGGCUUUCAGAUUUGACUGUCACUUCAGAUUUUUGAGCAAAAAUACUAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAUUCUUUGAAGAGACAGGACCUCUGUUGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGUGUGAUUAUAGCUCACUGUAACCUCAAACUCCUGGGCUUAAGUGACAUUUCUGCCUCAACUUUCUGAGUAGCUAGGGCUACAGGUGCGUGUCACCAUGCCUCGCUAACUUACCAAUUUUUUUAUAGAAGUGGGGUCUCCCUGUGUUGCUCAGGCUGAUCUUGAACUCCUGGCCCUCCCGCCUUGGCCUCCCCAAAAUGUUGGGAUUACAGGCGAGGGCCACUUUGCCUGGCCCCAAAUAACAUUUUUUCAAAGGAAUGUAAAUUUUUUUUGUUUUAGUUUCAUAGGCAAAGUCUUUAUGUCUGGGAGAGAUUGGAUUUUAGGAUAUUAUAGUAACAGAUGUAUUCCUUUGACCUAACCUGGGCAAAGCAUUUAUUGGGCUCCCUGCUUCAACCCCCUUGGCAGAAAGAUGAAAUAUGAAUUGUAUCUUCAUCAAGCUUAUGCUACCUUUAUACAGUUGUAGAAAAUACAGGUUAGUAAAUAGUAAUUUUAGGUAACAGUAUCAAAUAGGAAGAAGUAAAUAAAAAAGAAAGGACAGUGUCUUUCCAUUAAAAAUGUAAAAAAGUUUGGUUAAAUAAGAUGAAGUUAUCUUUAAGAUUUUUAUUUGUAACUAUAUUUAUGGUGGGUUUUGUUUCUUAGUGUUUUAAAGGCUUUUUAAUUGAUUUUUGGCAAGAGGAUAUAUUGUAAGCAGUGCAUUGCUUUGACUUACUGAGUCUUGACAAUCUGAUUUUGUGCCUAUAAAAUUAAAGAAAAUGCUUAGGGUAGUAUGUUUUUAAAAGCUAAUUAAGAACUUCAGGCAUUUGGACAACUCUCUUUUUUUUACAUAUUUCUCAGACCUAGACAUAAUAAAUAGAUAUGUUUUUAAAAGUGAACAGGUUAGAAAGCAUCACUAUUUACUGCUGAUUAUGAAACAUUUUAAUAGCAUCAAAUUUGUAAUUUUAGAAUUUUGCUUUGGCCUUGUUUUUAUUUUGAAAGUUUUUAAGGAAUGUUCUGCAAAUGUAGUACUUUAGUUGAAAUGGCAAAAUUUUCUUGAAGAGUGUGAAAUGUUAAAAUGAAAGAAAACAGCAAAAACAUUCACUGUUUGAGCACAAUGUAGUUUGGGACAGUCUAUAUUGUGCUUUGGAUAAAAUGAGCAUUCACAUGAUCCCUUUGGUUGAAAUACUAAUGCUCCUAUUUUAUUGUGUAAUGACUAACCAUUUUAAAGAUGAACUCUUAUUCUCAGCCAAAACUUGCAAUCUGAGGUUAUAUGUCUAUAUAUGAAUGAGCUUACCUUUCAGAUAUUAUAGCUGAUUCUUCCCUAAUUCUCUCAGUUGAAAUGUACCACAACGGUUUUGUCCCUUUUCUUCCUCCUGCCUAUCCACACUAAUUGGUCAUAGUAAUUCAGGUAGUAACUCCUGGGGCUUUAUAAAUUAUUAUAAAUAUUGUUGACUAUUUAGAGUGAGUAAUCAGCAGGAGGGACAAAAUGGCUUGAAAGUGGUAUCUCUGUUUUUUAAUUUUUUAUACUUUUAGUUAUAACUUUCAGUAUUUAGGAAGAAAUACCUGAAAGGUAGAUACAGAUUGCAACAUGCGUUUGUGAUUAUUUUGACUGUGCACAAAAGUUUAUCUUUAAAUUAGUAGAAAUAGCAACUAUAAGGGUGGGGUUAAAAUAUAAAAUAAACCCAUGGGUUGUCUUGCUGCUCCUUAAGUAACACACCAGUGAUGCUUGUAAACACUUUCUAUAGAAAGUAUCUGUGACAAUACUUUAAUAUUUGGCCAAAAGCUUAUAACUCCUAGAGGAUGGUAGGAAGCUUGAUAGCAUCCAAGCUGCUAAAUUCUUAGGAGCCUGUUCGUGUUAAAGUACGUGAGCCUAUGAGCAGUCAUUUAUGCUGUGAAUUCAUAUCUGGCUGCUACUUUUCCUUCGACAGAUAAGCCUAUUUGGCUGCUAAAGGGCUUUUUAUUUGGUUCUUCCUCCUGGUGUGAGCAUGUAUAAACAGCAGGACGUUAUAUAGAGUAGCAAACAAUAAAAUGAGGAAAAUGCAUGAAAACUCAGUAUAUGGGUGAAUAGAUACUUGUUUAAUAUGUGUAAUUAAACUUGGUAGCAUAAUGUUUUUGAAACUUUAGAUGUAAAUGUGUGAAUGUCUGUCCAUUUGUGAAUCCUGAGAGUUGCCAGUCCUAUAAGCAAUAUAUUCACAUGCUUCUAUUCUCCAAUUUUCAGUACUAUGGACUACAAAUUUUGGAAAAUGUGAUAAAAACAAGGUGGAAGAUUCUUCCAAGGAACCAGUGCGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-703.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -755.38
Frequency: 0.0000
Diversity: 539.51
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.........)))))((.((((.(((.((.(((...))).))..((.((((((.....)))))).))....(((((((((((..((.....(((((((((((......)))....)))))))).....))..))))))))..)))((((((((((((((((..((((...(((((.(((..(((((.((((.(((((((((...((((..........((((((.((((((((((((.(((..........(((((((.((((((((((((.......((((((((((((((((.(((((........((((((.((((((((...((((((....))))))((((..((((((((........))))))))..)))).(((((((((.......((((((......))))))..(((((((((((((((((.(((((((...(((((((((((.((.......))))))))))..))).....)))))))..........((((((((.........((((((((..((((....((((.....))))..)))).))).)))))..............(((((((((...((((((.((((((((((((((((....((((((((((((..((((.(.....(((((....)))))....))))))))))))((((((((((.........((((.......((((((((....)))))))))))).........))))))))))..........)))))))))))).....((((...((((........)))).)))).........))))))))).)))......)))..))))))))).........))))))))((((((((((.....)))).)))))).(((....))).............((((.....))))(((((.(((((((.(((((((((((((..((((..........................((((((...))))))(((...................)))........))))..)))))))..)))))).))))))))))))......)))).))))))))))))))))))))))..((((.((((..((((((((.((((.((((.((.((((((((((......))))).(((((...)))))...))))).)).)))).))))...))))))))..)))).))))..........((((((((.......)))))))))))))))))))))).......))))))))))))..)))).)))))..(((((((.........))))))).....(((((....(((....))).)))))))))))))))))))))))).((((((((((...(((.((((........(((((((((((....(((((((((((...))))))....)))))...((.((((....)))).))............)))))))))))......)))).)))..))))))))))..))).))))))))(((((.....)))))(((((((((((((.(((...))).))))))))))))).)))).))))))))))....))))))))).)))).))))).)))....((((((((((((((......(((((....((((((((((((((........(((.(((((..(((((((((...(((((((....)))))))......((((((((((((((((.(((((((................))))))).)))))((((((((.((((((((((......((((.(((..(((.(((.((((.(((((((((((.((((((........))))))..(((((((....)))))))))))).)))))).)))).))).)))..))).)))))))))))))).).))....))))).....(((((((...((((..(((((...(((....)))...)))))..))))))))))).)))))))))))...)))))))))(((......))).....))))).)))........))))))))))))))))))).......((((((....((((....................))))...)))))).(((((((((..((((((.(((....))).)))))).....((((((....))))))...((((((...............(((((((.((((((..(((((.((((((..(((..((((((........)))))).))).))))))))))).((((.((.(..((((((.((.((((((((((((((.......)))))....)))))...))))))))))))..)..))))))))))))...)))))))....(((((((........)))))))..(((((.(((............))).))))).))))))..))))))))))))))))))).))))..((((.(((....))))))).)))))...)))))))))))))..))))))).......((((........((((((((.(((.((((.((......)).))))(((..((((((..(((....((((((((((..((......(((((...........))))).....)).))))))))))))).)))))).)))...))).))))))))........)))).((((((...))))))......))))))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((.........)))))((.(((,,(((.((,(((,{{|}|,||,.((.((((((.....)))))).))...,{((((((((((..((...,.(((((((({((......}})....)))))))).,...})}.,)))))))},}))|((((((((((((((({,((((...(((((,{{,..(((((.((((.(((((((((...((((..,{{{{{,.(({,,,.{{,(((((((((.(((..........(((((((.((((((((((({.......((((((((((((((((.(((((......,.((({(((((((((((...((((((....))))))((((..((((((((........)))))))}..)))).(((((((({.......((((((......)))))).,((((((((((((((({{.(((((((...((({(((((((,((.......))}))))))}..))).....)))))))...,,..,,.{(((((((.........{(((((((..((((....((((.....))))..)))).))),,)))}..............(((((((((...((((((.((((((((({{(((((,...{(((((((((((.,((({{(...{,(((({....})))),...))))))))))))((((((((((.........((((.......((((((({....}))))))))))).........))))))))))..........)))))))))}))..|,,{((|,..{{{{.......,}}}}.})})..}..,...))))))))}.)))......)))..))))))))).........)))))))}((((((((((.....)))).)))))).{((....))},,,{{{{(,...{{{{{.....|}}}|{|{{,|||{{{|.|{{{{|{{{|{{{..|||{...,,,,......,..........({(((({{...})))))){{{,...,||},....,,|}}}}||,,,,,,{||||,,|}}}})),})}}}}),))))))}}}})}||,,,,,}))}))))))))))))))))))))))..{(((.((((..((((((((.((((.{(((,(,.((((((((((,....,))))}.(((((...)))))...))))).,,,)))).))))...))))))))..)))}.)))}..........((((((((.......)))))))))))))))))))))).......)))))))))))),.}))).)))))..|{{((({.........})))))|.....(((({...,,{|...,)}).)))))))))))))))))))))))).((((((((((...(((.((((........(((((((((((....({{{{{{{{,,...,}}))}..,,}}}}},,.((.((((....)))).)).,,..,,,,,,.)))))))))))......)))).)))..))))))))))..))).))))))))|{(({.....}))}}(((((((((((((.,((...)),.))))))))))))).})),,))))))))))....))))))))).)))).))))).,,.,{||((((((((((((((......{((({,...((((((((((((((.,,...,.(((.(((({.,(((((((((.,.(((((({,...,)))))}.,,,.,|((((((((((.((({.,{{{{{{.,,,,,,..,......}}}}}}),}},|(((((({{(.((((((((((,.....,{((,(((,.(((.(((.((((.(((((((((((.,(((((........))))),..(((((({....)))))))))))),}))))).)))).))).)))..,})})))))))))))))).).}},...})))))}...,{,,,,,,..,,.,..(((((...(({....)))...))))),,})))))))))).))))))))))}...)))))))))|((......})),....})))).))).}...,,.)))))))))))))),}}}).,.....((((((....((((....{{........,.....)))).,.)))))).(((((((((..((((((.(((....))).)))))}.....((((((....))))))...{{{{{{.,,,...........(((((((.((((((..((((({{(((((..(((..{(((((........)))))).))).))))))))))).((({{((.{..((((((.((.((((((((((((({{,.....)))))....)))))...))))))))))))..,..))))))))))))...))))))),...(((((((........)))))))..(((((.(((............))).))))).)}}}},..))))))))))))))))))),})))..{{||,|{{....|}}}}}}.)))))...}))))))))))))..})))))}..,,,,,||||}}.,,,,.{{(((({{.|||,,|||,|||}...,))}),.,{{{..((((((..(((....((((((((((..((...,,.(((((...........))))).,,..)).))))))))))))).)))))).}}}...|||,,,,,,}}}........))}}.{(((((...)))))}......))))))).))
Back