Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ZCCHC11_0022800

Sequence Length

436 nt

GC Content

0.3670

CGAUCACCAGAAUAUACCAAUUGUCGGUAUCUAUGCAAACUUUGCUUAAUUCACAUUGAAAAUAUCCAGGGGGCUCAUAAACAUAUAAAGGAGAAACGACAUAAGAAAAAUAUUUUGGAAAAACAAGAAGAAAGUGAGCUUCGUUCUCUGCCACCUCCUUCCCCUGCCCACUUGGCUGCUUUAAGUGUUGCAGUCAUUGAAUUAGCAAAAGAACAUGGAAUAACAGAUGAUGACCUCAGAGUCCGUCAGGAAAUUGUGGAGGAAAUGUCAAAGGUUAUAACGACAUUUUUACCAGAAUGUUCACUUAGGUUGUAUGGCUCAUCUCUGACUAGAUUUGCUCUGAAAAGUAGUGAUGUUAAUAUAGAUAUAAAAUUUCCUCCCAAGAUGAAUCAUCCAGAUCUUCUGAUAAAAGUACUUGGGAUUUUAAAGAAAAAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-87.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -95.96

Frequency: 0.0000

Diversity: 64.50

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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